MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Campylobacter lari RM2100

Total Repeats: 1132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012039	TGAAAA	2	12	1254	1265	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222823047
2	NC_012039	TGCTAG	2	12	3432	3443	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222823049
3	NC_012039	TTACAC	2	12	4902	4913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222823050
4	NC_012039	GATTCA	2	12	8736	8747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222823054
5	NC_012039	TTTAGC	2	12	9068	9079	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222823055
6	NC_012039	CGCCAC	2	12	12037	12048	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222823058
7	NC_012039	AGGCTA	2	12	13299	13310	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222823059
8	NC_012039	TAAAAA	2	12	14106	14117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	222823060
9	NC_012039	TCTTGC	2	12	14708	14719	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222823061
10	NC_012039	ATTAAA	2	12	15860	15871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012039	GAAATT	2	12	18273	18284	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222823064
12	NC_012039	CATGAG	2	12	18321	18332	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222823064
13	NC_012039	CTTTTT	2	12	18667	18678	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	222823064
14	NC_012039	GTATAG	2	12	19767	19778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222823066
15	NC_012039	TATGGG	2	12	20757	20768	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	222823067
16	NC_012039	ATTTAA	2	12	24440	24451	50 %	50 %	0 %	0 %	222823070
17	NC_012039	CAACCC	2	12	25344	25355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222823071
18	NC_012039	TTCTAT	2	12	26737	26748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	222823071
19	NC_012039	AGCTAT	2	12	27940	27951	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222823072
20	NC_012039	TGGTTT	2	12	29379	29390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222823073
21	NC_012039	TTAGAG	2	12	31059	31070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222823074
22	NC_012039	AAAGAA	2	12	31852	31863	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222823075
23	NC_012039	TAAAAC	2	12	34724	34735	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	222823078
24	NC_012039	TTTTGT	2	12	34788	34799	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	222823078
25	NC_012039	TGATAT	2	12	36354	36365	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222823079
26	NC_012039	AAAGTA	2	12	39267	39278	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222823082
27	NC_012039	CTATAC	2	12	39933	39944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222823083
28	NC_012039	TGATCA	2	12	39993	40004	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222823083
29	NC_012039	ATGGTG	2	12	41317	41328	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	222823085
30	NC_012039	CAAAAA	2	12	41680	41691	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012039	GTAAAT	2	12	43389	43400	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222823087
32	NC_012039	AGAAAA	2	12	45722	45733	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222823091
33	NC_012039	AATAGA	2	12	46394	46405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222823091
34	NC_012039	CTAAAG	2	12	46923	46934	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222823092
35	NC_012039	ATACAC	2	12	47998	48009	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	222823093
36	NC_012039	ATTTTG	2	12	48197	48208	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	222823093
37	NC_012039	ATGCTT	2	12	48410	48421	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222823093
38	NC_012039	GCTGTG	2	12	50593	50604	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222823095
39	NC_012039	TCAAAA	2	12	50738	50749	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	222823095
40	NC_012039	TTTTAA	2	12	52740	52751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222823097
41	NC_012039	GAAAAA	2	12	54972	54983	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222823100
42	NC_012039	ATCTTT	2	12	55670	55681	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	222823101
43	NC_012039	TTTAAA	2	12	55757	55768	50 %	50 %	0 %	0 %	222823101
44	NC_012039	AATTTA	2	12	56353	56364	50 %	50 %	0 %	0 %	222823101
45	NC_012039	AATTTT	2	12	56507	56518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222823101
46	NC_012039	TGATGT	2	12	60438	60449	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	222823109
47	NC_012039	AGTTTC	2	12	60642	60653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222823109
48	NC_012039	GTAAAG	2	12	61147	61158	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222823110
49	NC_012039	AATGTT	2	12	63686	63697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222823118
50	NC_012039	TAAAGA	2	12	66753	66764	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222823123
51	NC_012039	TAAATG	2	12	68037	68048	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222823124
52	NC_012039	TAATAC	2	12	68110	68121	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222823124
53	NC_012039	TGATGC	2	12	68386	68397	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222823124
54	NC_012039	GTTGGT	2	12	72069	72080	0 %	50 %	50 %	0 %	222823129
55	NC_012039	TATGAA	2	12	72627	72638	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222823129
56	NC_012039	TGCTAT	2	12	72842	72853	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222823129
57	NC_012039	GCATTT	2	12	73695	73706	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222823130
58	NC_012039	ATAAAG	2	12	75687	75698	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222823131
59	NC_012039	AGTTAA	2	12	75984	75995	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222823131
60	NC_012039	ATAAAA	2	12	77087	77098	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	222823133
61	NC_012039	TAAAAA	2	12	77353	77364	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	222823133
62	NC_012039	TATAAT	2	12	78351	78362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012039	ATGCTA	2	12	83518	83529	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222823142
64	NC_012039	AAAAGC	2	12	84637	84648	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	222823143
65	NC_012039	TTATTT	2	12	86329	86340	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	222823145
66	NC_012039	AGCTTA	2	12	86706	86717	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222823146
67	NC_012039	TAAAGA	2	12	88511	88522	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222823148
68	NC_012039	AAATTT	2	12	89755	89766	50 %	50 %	0 %	0 %	222823149
69	NC_012039	GTTTAT	2	12	90333	90344	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	222823150
70	NC_012039	CCAAAT	2	12	92289	92300	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	222823151
71	NC_012039	GAAAAT	2	12	93593	93604	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012039	AAAAAG	2	12	95290	95301	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222823153
73	NC_012039	TGAGTT	2	12	95511	95522	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	222823153
74	NC_012039	TGCTTT	2	12	98173	98184	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	222823158
75	NC_012039	GGCTTT	2	12	99306	99317	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222823159
76	NC_012039	TAAAGA	2	12	101793	101804	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222823160
77	NC_012039	AGTGGT	2	12	103084	103095	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	222823162
78	NC_012039	ATGCTT	2	12	104744	104755	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222823164
79	NC_012039	AATGTA	2	12	105452	105463	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222823165
80	NC_012039	GCTTTT	2	12	105473	105484	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	222823165
81	NC_012039	CATGAA	2	12	106022	106033	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222823166
82	NC_012039	GATAAA	2	12	107948	107959	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222823168
83	NC_012039	TAAGTT	2	12	108470	108481	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222823170
84	NC_012039	TATTTT	2	12	109127	109138	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	222823170
85	NC_012039	CTTGAT	2	12	109278	109289	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222823171
86	NC_012039	TAATTT	2	12	109891	109902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222823171
87	NC_012039	TTTGTT	2	12	111968	111979	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	222823174
88	NC_012039	CTAAGC	2	12	112351	112362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222823174
89	NC_012039	TAAAAG	2	12	113396	113407	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222823175
90	NC_012039	TTTAAA	2	12	113671	113682	50 %	50 %	0 %	0 %	222823176
91	NC_012039	AAAATA	2	12	113892	113903	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	222823176
92	NC_012039	TTCATC	2	12	114348	114359	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222823177
93	NC_012039	TTTTTG	2	12	115210	115221	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012039	GAATTT	2	12	115525	115536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222823178
95	NC_012039	TCTCAT	2	12	115544	115555	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222823178
96	NC_012039	TTTGCA	2	12	115625	115636	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222823178
97	NC_012039	TTTTTC	2	12	116970	116981	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	222823180
98	NC_012039	AAAGTA	2	12	118354	118365	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012039	AGCTAT	2	12	118402	118413	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222823181
100	NC_012039	TTTTAG	2	12	122411	122422	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	222823183
101	NC_012039	ATTTGG	2	12	122700	122711	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	222823183
102	NC_012039	TTTTAG	2	12	124562	124573	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012039	TCTTGT	2	12	125215	125226	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012039	TCTATA	2	12	126059	126070	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222823184
105	NC_012039	ATTATA	2	12	129179	129190	50 %	50 %	0 %	0 %	222823189
106	NC_012039	TTGAGC	2	12	130799	130810	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222823192
107	NC_012039	TACTTT	2	12	132564	132575	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	222823194
108	NC_012039	CTGATG	2	12	133443	133454	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222823195
109	NC_012039	GAATTT	2	12	134278	134289	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012039	AAAAAT	2	12	135783	135794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	222823198
111	NC_012039	GATTAT	2	12	138423	138434	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222823201
112	NC_012039	TTTATC	2	12	139590	139601	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	222823202
113	NC_012039	TTTCTC	2	12	140321	140332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222823202
114	NC_012039	ATTTAG	2	12	142661	142672	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222823203
115	NC_012039	GCTATG	2	12	146032	146043	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222823205
116	NC_012039	ACTGCA	2	12	146059	146070	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222823205
117	NC_012039	TCTTTT	2	12	150168	150179	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	222823208
118	NC_012039	CCAAAA	2	12	153484	153495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222823209
119	NC_012039	ATTTAA	2	12	154197	154208	50 %	50 %	0 %	0 %	222823210
120	NC_012039	AAAAGA	2	12	156278	156289	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222823213
121	NC_012039	ATCAGG	2	12	157903	157914	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222823215
122	NC_012039	TGGTTA	2	12	162394	162405	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	222823220
123	NC_012039	AGCGAT	2	12	163469	163480	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222823222
124	NC_012039	AAATAA	2	12	165235	165246	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	222823223
125	NC_012039	TTTAAA	2	12	170526	170537	50 %	50 %	0 %	0 %	222823230
126	NC_012039	AAAAGA	3	18	171270	171287	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222823231
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132	NC_012039	GAAAAT	2	12	181906	181917	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222823245
133	NC_012039	AGCTAA	2	12	183394	183405	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222823247
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137	NC_012039	AAATTT	2	12	193237	193248	50 %	50 %	0 %	0 %	222823258
138	NC_012039	AGCAAG	2	12	194342	194353	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222823259
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140	NC_012039	GAAAAA	2	12	199565	199576	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222823265
141	NC_012039	TAAATT	2	12	199705	199716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012039	TAAAGC	2	12	202059	202070	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222823268
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167	NC_012039	ATTTAA	2	12	235066	235077	50 %	50 %	0 %	0 %	222823306
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175	NC_012039	CTAAAG	2	12	242535	242546	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222823314
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184	NC_012039	TCATTT	2	12	258177	258188	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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225	NC_012039	AAGAGC	2	12	321220	321231	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222823384
226	NC_012039	AAAAGA	2	12	323362	323373	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
227	NC_012039	AAATCA	2	12	323899	323910	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
228	NC_012039	TCTTAG	2	12	325909	325920	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222823389
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231	NC_012039	AAATAA	2	12	329753	329764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_012039	AGTTTT	2	12	329878	329889	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	222823392
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234	NC_012039	GCCTTG	2	12	332755	332766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222823394
235	NC_012039	AAAGAA	2	12	332987	332998	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222823394
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237	NC_012039	GAAAAT	2	12	335163	335174	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222823397
238	NC_012039	AGAAAA	2	12	336235	336246	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222823398
239	NC_012039	TGCTTA	2	12	337869	337880	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222823399
240	NC_012039	AGTTGT	2	12	341656	341667	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	222823400
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243	NC_012039	GGTAAG	2	12	343612	343623	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	222823403
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248	NC_012039	ATGGAA	2	12	351293	351304	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222823412
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278	NC_012039	TTAAAT	2	12	403004	403015	50 %	50 %	0 %	0 %	222823462
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330	NC_012039	CAAATG	2	12	497002	497013	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222823535
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346	NC_012039	AATGAT	2	12	528104	528115	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222823565
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349	NC_012039	TTAAAT	2	12	534522	534533	50 %	50 %	0 %	0 %	222823570
350	NC_012039	TAGTGC	2	12	536493	536504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222823571
351	NC_012039	CAAAAC	2	12	537944	537955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222823572
352	NC_012039	TAAATT	2	12	539003	539014	50 %	50 %	0 %	0 %	222823573
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