MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter lari RM2100

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012039	ATTAAA	2	12	15860	15871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012039	CAAAAA	2	12	41680	41691	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012039	TATAAT	2	12	78351	78362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012039	GAAAAT	2	12	93593	93604	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012039	TTTTTG	2	12	115210	115221	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012039	AAAGTA	2	12	118354	118365	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012039	TTTTAG	2	12	124562	124573	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012039	TCTTGT	2	12	125215	125226	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012039	GAATTT	2	12	134278	134289	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012039	TAAATT	2	12	199705	199716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012039	ATAGGT	2	12	233588	233599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012039	AAAATA	2	12	242160	242171	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012039	TTCATT	2	12	258077	258088	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012039	TCATTT	2	12	258177	258188	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012039	ACCCTT	2	12	283133	283144	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012039	ATGAAA	2	12	283172	283183	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012039	TTTACC	2	12	283230	283241	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012039	TTAAAG	2	12	285227	285238	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012039	AAAAGA	2	12	323362	323373	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012039	AAATCA	2	12	323899	323910	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012039	AAATAA	2	12	329753	329764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012039	AATAAA	2	12	345787	345798	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012039	ATAAAT	2	12	358534	358545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012039	TTTAAA	2	12	402007	402018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012039	TTTTAA	2	12	410139	410150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012039	TTATAT	2	12	436280	436291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012039	AATATA	2	12	438298	438309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012039	TTTTTA	2	12	442347	442358	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012039	ATTAAG	2	12	462023	462034	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012039	AGTTTT	2	12	485078	485089	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012039	TTATAT	2	12	488482	488493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012039	AATATA	2	12	490500	490511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012039	TTTTTA	2	12	494525	494536	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012039	TAAAAA	2	12	638480	638491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012039	AAATTT	2	12	663159	663170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012039	TTAGAT	2	12	707951	707962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012039	TAAAAA	2	12	727972	727983	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012039	TATTTT	2	12	750575	750586	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012039	TTTATT	2	12	756764	756775	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012039	TAAATA	2	12	766073	766084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012039	TAAAAT	2	12	820516	820527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012039	TTATAA	2	12	838483	838494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012039	ATTTAA	2	12	841668	841679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012039	TGAAAA	2	12	841732	841743	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012039	GAAAAA	2	12	845329	845340	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012039	CATAAA	2	12	916543	916554	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_012039	ATTATA	2	12	916558	916569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012039	TTTTAA	2	12	937939	937950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012039	TTTAAA	2	12	971565	971576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012039	AAAAAT	2	12	986422	986433	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012039	TAAAAA	2	12	1020108	1020119	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012039	GCTTTT	2	12	1021459	1021470	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012039	TTTTAA	2	12	1059315	1059326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012039	CATTAT	2	12	1122222	1122233	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_012039	TATCAT	2	12	1141965	1141976	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_012039	TTTAAT	2	12	1225907	1225918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012039	TAAAAT	2	12	1226456	1226467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012039	TTTATT	2	12	1267722	1267733	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012039	CAATAT	2	12	1267850	1267861	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012039	AAATTT	2	12	1268038	1268049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012039	ATTTGC	2	12	1268446	1268457	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012039	TAAAAT	2	12	1270612	1270623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012039	ATAAAA	2	12	1281055	1281066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012039	TATAAA	2	12	1282324	1282335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012039	TTAATT	2	12	1293912	1293923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012039	TTAATT	2	12	1327076	1327087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012039	AATATA	2	12	1332725	1332736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012039	ACAAAA	2	12	1339965	1339976	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012039	ATTTTT	2	12	1397977	1397988	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012039	ATATAA	2	12	1398121	1398132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012039	ACTAAA	2	12	1406915	1406926	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012039	TAAAAA	2	12	1408059	1408070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012039	TAAAAA	2	12	1408194	1408205	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012039	ATATAA	2	12	1414189	1414200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012039	AAAATA	2	12	1425560	1425571	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012039	AATTTT	2	12	1425578	1425589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012039	AGAAAA	2	12	1459505	1459516	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012039	ATTTTA	2	12	1461870	1461881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012039	ACTTAG	2	12	1470551	1470562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_012039	TATTAA	2	12	1480318	1480329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012039	AAAGCA	2	12	1481312	1481323	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012039	TAAATT	2	12	1481376	1481387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012039	GTTAAT	2	12	1499378	1499389	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012039	AAATTT	2	12	1525368	1525379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.