MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter lari RM2100

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012039	ATAAA	2	10	1429	1438	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012039	ATATT	2	10	7244	7253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012039	ACTTT	2	10	7280	7289	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_012039	TTTAA	2	10	29996	30005	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012039	TGTTT	2	10	34399	34408	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012039	AATTT	2	10	37669	37678	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012039	AATAA	2	10	45569	45578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012039	AATTT	2	10	56747	56756	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012039	ATTTT	2	10	69280	69289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012039	ATTAA	2	10	95644	95653	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012039	ATTTT	2	10	107247	107256	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012039	ATTTT	2	10	115237	115246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012039	AAATT	2	10	121436	121445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012039	TATTT	2	10	123717	123726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012039	GCTTG	2	10	124165	124174	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012039	AATTT	2	10	125400	125409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012039	TAATT	2	10	125620	125629	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012039	TTTAT	2	10	160047	160056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012039	AATTA	2	10	179635	179644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012039	TAAAA	2	10	189186	189195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012039	AAAAT	2	10	201117	201126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012039	ATCTT	2	10	213260	213269	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012039	ATTTT	2	10	230085	230094	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012039	ATTAA	2	10	233480	233489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012039	ATTTT	2	10	242254	242263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012039	ATATT	2	10	246565	246574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012039	TAATT	2	10	252350	252359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012039	TATAA	2	10	258876	258885	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012039	TATAA	2	10	273425	273434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012039	TGATT	2	10	279573	279582	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012039	ATTTT	2	10	279725	279734	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012039	AAACA	2	10	280232	280241	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_012039	ATAAA	2	10	282965	282974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012039	AAAAT	2	10	285123	285132	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012039	TATAT	2	10	304172	304181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012039	ATACT	2	10	314438	314447	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_012039	ATACT	2	10	316392	316401	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_012039	TGATT	2	10	316422	316431	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012039	ATCGC	2	10	322841	322850	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_012039	GATGA	2	10	322888	322897	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012039	ATAAA	2	10	343354	343363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012039	ATATA	2	10	348211	348220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012039	ATTTT	2	10	358157	358166	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012039	AAAAT	2	10	358387	358396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012039	TTATT	2	10	361908	361917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012039	GATAT	2	10	397654	397663	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012039	AAATT	2	10	409957	409966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012039	TAATA	2	10	409982	409991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012039	AGATA	2	10	416315	416324	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012039	TTTTA	2	10	416330	416339	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012039	TCTGC	2	10	416395	416404	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_012039	GATTT	2	10	426619	426628	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012039	ATCAA	2	10	431201	431210	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012039	ATTTC	2	10	436072	436081	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_012039	TCGTG	2	10	437405	437414	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_012039	TGCTT	2	10	438028	438037	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_012039	TAAAT	2	10	438401	438410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012039	CCGTA	2	10	440324	440333	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_012039	ATAAA	2	10	441790	441799	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012039	AAATA	2	10	441800	441809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012039	TAATT	2	10	441843	441852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012039	TTATT	2	10	442112	442121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012039	TATTT	2	10	442551	442560	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012039	AAAAT	2	10	452996	453005	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012039	GAATT	2	10	478890	478899	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012039	TATAT	2	10	487288	487297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012039	TTTAC	2	10	488060	488069	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_012039	ATTTC	2	10	488274	488283	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_012039	TCGTG	2	10	489607	489616	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_012039	TGCTT	2	10	490230	490239	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012039	TAAAT	2	10	490603	490612	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012039	CCGTA	2	10	492526	492535	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_012039	ATAAA	2	10	493992	494001	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012039	AAATA	2	10	494002	494011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012039	TAATT	2	10	494045	494054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012039	TTATT	2	10	494314	494323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012039	TATTT	2	10	494729	494738	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012039	CTTAA	2	10	527608	527617	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012039	ATTTT	2	10	527713	527722	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012039	ATTTT	2	10	564722	564731	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012039	TAAAA	2	10	570905	570914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012039	ATTAT	2	10	572449	572458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012039	TTTAA	2	10	577461	577470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012039	TAAAA	2	10	577981	577990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012039	TCAAA	2	10	585215	585224	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012039	ATTTT	2	10	605778	605787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012039	TGTTA	2	10	621452	621461	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012039	ATTAT	2	10	640895	640904	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012039	AGCTT	2	10	687438	687447	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_012039	TGAAT	2	10	687887	687896	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012039	TTATT	2	10	700087	700096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012039	TTAAA	2	10	701539	701548	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012039	AATAA	2	10	706545	706554	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012039	TATGA	2	10	708054	708063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012039	TATAA	2	10	724575	724584	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012039	TTATT	2	10	735032	735041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012039	AAAAT	2	10	739724	739733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012039	TTTAA	2	10	765307	765316	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012039	TATAA	2	10	796777	796786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012039	ATTTT	2	10	826325	826334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012039	ATATT	2	10	826572	826581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012039	TAAAA	2	10	838576	838585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012039	GCTTT	2	10	839241	839250	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012039	TCAAA	2	10	840168	840177	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_012039	CCTAT	2	10	840242	840251	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_012039	GAAGC	2	10	840698	840707	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_012039	AAAAG	2	10	840748	840757	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012039	TAAAA	2	10	845242	845251	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012039	TAAGA	2	10	845576	845585	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012039	TATTG	2	10	850446	850455	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012039	TAAAA	2	10	864216	864225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012039	ACTCC	2	10	869370	869379	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
113	NC_012039	AAAAT	2	10	880801	880810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012039	AAAAG	2	10	899543	899552	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012039	ATTAT	2	10	899693	899702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012039	ATATA	2	10	904197	904206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012039	TTTTA	2	10	904321	904330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012039	AAATA	2	10	925353	925362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012039	TAAAT	2	10	930217	930226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012039	ATTAT	2	10	959815	959824	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012039	TTAAT	2	10	959916	959925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012039	AAACT	2	10	1039605	1039614	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_012039	AAATA	2	10	1048859	1048868	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012039	TGAAA	2	10	1048931	1048940	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012039	ATTTT	2	10	1048955	1048964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012039	AAATT	2	10	1059133	1059142	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012039	TAATA	2	10	1059158	1059167	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012039	GCTTA	2	10	1060640	1060649	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012039	TATAA	2	10	1073201	1073210	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012039	TAAAG	2	10	1109995	1110004	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012039	GTTTA	2	10	1192180	1192189	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012039	ATTTT	2	10	1214994	1215003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012039	CAAAA	2	10	1229905	1229914	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_012039	TTAAT	2	10	1244812	1244821	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012039	TTTTA	2	10	1250403	1250412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012039	ATCTT	2	10	1265942	1265951	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012039	TATTT	2	10	1266692	1266701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012039	AGGCA	2	10	1267923	1267932	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_012039	AATAA	2	10	1268575	1268584	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012039	ATTTT	2	10	1276981	1276990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012039	TAATT	2	10	1281837	1281846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012039	GGAAA	2	10	1292437	1292446	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012039	ATAAA	2	10	1298650	1298659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012039	TAATT	2	10	1393386	1393395	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012039	TTTGA	2	10	1393423	1393432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012039	ATTAA	2	10	1407182	1407191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012039	TAATT	2	10	1407332	1407341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012039	AAAAT	2	10	1408357	1408366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012039	AAATT	2	10	1408627	1408636	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012039	TTTAT	2	10	1408669	1408678	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012039	TACGG	2	10	1410147	1410156	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_012039	CTAAT	2	10	1412039	1412048	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_012039	ATTTA	2	10	1412070	1412079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012039	CACGA	2	10	1413066	1413075	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
155	NC_012039	GAAAT	2	10	1414400	1414409	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012039	ATTTC	2	10	1434192	1434201	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_012039	AACTT	2	10	1439422	1439431	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_012039	TTATT	2	10	1456337	1456346	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012039	TATTT	2	10	1459423	1459432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012039	TTTAT	2	10	1471845	1471854	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_012039	TTTTA	2	10	1471874	1471883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_012039	ATTTT	2	10	1475218	1475227	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012039	AAATC	2	10	1479241	1479250	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_012039	ATAGT	2	10	1480422	1480431	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_012039	ACTAT	2	10	1497270	1497279	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_012039	AAAAT	2	10	1508380	1508389	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012039	TTTAA	2	10	1524120	1524129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.