MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter lari RM2100

Total Repeats: 430

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012039	TTTA	2	8	13849	13856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012039	TTTA	2	8	15825	15832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012039	TAAT	2	8	15875	15882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012039	ATTT	2	8	19624	19631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012039	ATTA	2	8	19644	19651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012039	GGGT	2	8	24740	24747	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012039	TTTA	2	8	29947	29954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012039	AGTG	2	8	30018	30025	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012039	CTTA	2	8	34426	34433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012039	CTTT	2	8	37709	37716	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012039	AACG	2	8	38005	38012	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012039	ATTT	2	8	67410	67417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012039	CTTA	2	8	68574	68581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012039	CTTT	2	8	78331	78338	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012039	TTAA	2	8	89933	89940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012039	ACTA	2	8	89962	89969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012039	GAGT	2	8	93561	93568	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012039	ATTG	2	8	94200	94207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012039	AAAT	2	8	94247	94254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012039	AAGG	2	8	105150	105157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012039	ATTG	2	8	112433	112440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012039	AAAG	2	8	112458	112465	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012039	AAAT	2	8	116161	116168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012039	TTTA	2	8	121151	121158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012039	AAAT	2	8	121255	121262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012039	GGTA	2	8	121303	121310	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012039	TATT	2	8	121365	121372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012039	TCAA	2	8	121461	121468	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012039	ATAA	3	12	123568	123579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012039	AAAT	2	8	123591	123598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012039	TCAT	2	8	124378	124385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012039	TGAT	2	8	124657	124664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012039	TCTT	2	8	124878	124885	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012039	GGAT	2	8	124962	124969	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012039	TGTT	2	8	124978	124985	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012039	GATT	2	8	125113	125120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012039	TTGG	2	8	125140	125147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012039	TTTG	2	8	125182	125189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012039	ATTA	2	8	125446	125453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012039	AGTG	2	8	125677	125684	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012039	TAAA	2	8	140974	140981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012039	ATTT	2	8	142762	142769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012039	TTTA	2	8	154840	154847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012039	AAAT	2	8	159930	159937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012039	TTTA	2	8	159994	160001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012039	ATTT	2	8	170917	170924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012039	TAAA	3	12	179652	179663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012039	CCTT	2	8	185549	185556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012039	TTCA	2	8	185572	185579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012039	TTAA	2	8	199768	199775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012039	TAAT	2	8	201045	201052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012039	TAAA	2	8	204305	204312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012039	AGAT	2	8	213245	213252	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012039	TTTA	2	8	222474	222481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012039	AATT	2	8	234972	234979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012039	ATAA	2	8	238187	238194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012039	CATG	2	8	245750	245757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012039	TTTA	2	8	255359	255366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012039	ATTT	2	8	255425	255432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012039	TTTA	2	8	258215	258222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012039	AAAG	2	8	273407	273414	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012039	AATA	2	8	273524	273531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012039	TAAA	2	8	279629	279636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012039	AAAT	2	8	280047	280054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012039	GAAA	2	8	280306	280313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012039	ATTT	2	8	280344	280351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012039	AATA	2	8	283943	283950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012039	CAAA	2	8	283951	283958	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012039	GTTT	2	8	284067	284074	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012039	AAAG	2	8	284081	284088	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012039	TAAT	2	8	284369	284376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012039	AAAG	2	8	284380	284387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012039	TTCT	2	8	294922	294929	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_012039	ATTT	2	8	294947	294954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012039	ATTT	2	8	295066	295073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012039	TATT	2	8	305024	305031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012039	AGAA	2	8	323049	323056	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012039	AAAG	2	8	323759	323766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012039	GTAA	2	8	323792	323799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012039	TAGC	2	8	328754	328761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012039	AAAT	2	8	330458	330465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012039	TAAA	2	8	330524	330531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012039	TAAA	2	8	335070	335077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012039	TTTA	2	8	336698	336705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012039	TAAA	2	8	336760	336767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012039	TTAA	2	8	343412	343419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012039	TTAC	2	8	348142	348149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012039	GATT	2	8	351741	351748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012039	ATTA	2	8	358473	358480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012039	ATTA	2	8	358495	358502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012039	TTTG	2	8	358607	358614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012039	AAAT	2	8	358625	358632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012039	TCTT	2	8	360769	360776	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012039	ATTA	2	8	360843	360850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012039	ATTT	2	8	361945	361952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012039	ATAA	2	8	363626	363633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012039	TAAG	2	8	401981	401988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012039	ATGA	2	8	409919	409926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012039	AATA	2	8	410072	410079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012039	TTTG	2	8	412806	412813	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012039	AAAG	2	8	417324	417331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012039	TTCT	2	8	417368	417375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012039	TTTA	2	8	426189	426196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012039	AATT	2	8	429275	429282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012039	ATTA	2	8	429285	429292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012039	AAAT	2	8	431229	431236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012039	TATT	2	8	435768	435775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012039	TTTA	2	8	435862	435869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012039	TTTG	2	8	438289	438296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012039	AGTA	2	8	438327	438334	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012039	TAAA	2	8	438350	438357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012039	TACT	2	8	438378	438385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012039	CAAG	2	8	438480	438487	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012039	TAAG	2	8	438997	439004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012039	TAGC	2	8	439071	439078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012039	CTTA	2	8	439734	439741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012039	AAAG	2	8	439805	439812	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012039	TAAT	2	8	439989	439996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012039	AAGC	2	8	440156	440163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_012039	GGAT	2	8	440259	440266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012039	GGTG	2	8	440344	440351	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012039	TCCC	2	8	440486	440493	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_012039	TCGT	2	8	441034	441041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012039	TTAA	2	8	441772	441779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012039	GTTT	2	8	442036	442043	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012039	TTTG	2	8	442131	442138	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012039	TTTC	2	8	442186	442193	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012039	TTTA	2	8	442386	442393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012039	TAAT	2	8	442453	442460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012039	TAGA	2	8	442471	442478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012039	TATT	2	8	442480	442487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012039	TTAT	2	8	442534	442541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012039	ATTT	2	8	444980	444987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012039	AAAG	2	8	450093	450100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012039	TAAA	2	8	459366	459373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012039	ATGC	2	8	475259	475266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012039	ATTA	2	8	480451	480458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012039	TTTG	2	8	490491	490498	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012039	AGTA	2	8	490529	490536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012039	TAAA	2	8	490552	490559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012039	TACT	2	8	490580	490587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012039	CAAG	2	8	490682	490689	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_012039	TAAG	2	8	491199	491206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012039	TAGC	2	8	491273	491280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012039	CTTA	2	8	491936	491943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012039	AAAG	2	8	492007	492014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012039	TAAT	2	8	492191	492198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012039	AAGC	2	8	492358	492365	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012039	GGAT	2	8	492461	492468	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.