MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 plasmid pATHE01

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012036	TTC	2	6	323	328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530713
2	NC_012036	GGT	2	6	451	456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222530714
3	NC_012036	TTG	2	6	539	544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530714
4	NC_012036	AGC	2	6	551	556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530714
5	NC_012036	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530715
6	NC_012036	CAA	2	6	656	661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530715
7	NC_012036	TCT	2	6	730	735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530715
8	NC_012036	TTC	2	6	1288	1293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530716
9	NC_012036	TGC	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530716
10	NC_012036	CTT	2	6	1485	1490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530716
11	NC_012036	TCG	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530716
12	NC_012036	TGT	2	6	1579	1584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530716
13	NC_012036	TGC	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
14	NC_012036	CAA	2	6	3293	3298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530717
15	NC_012036	TTG	2	6	3324	3329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530717
16	NC_012036	TCT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
17	NC_012036	TAC	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530717
18	NC_012036	GTC	2	6	3489	3494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
19	NC_012036	TAT	2	6	3531	3536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222530717
20	NC_012036	TCT	2	6	3540	3545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
21	NC_012036	TCT	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
22	NC_012036	CTT	2	6	3802	3807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
23	NC_012036	TGC	2	6	3876	3881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
24	NC_012036	AAC	2	6	3882	3887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530717
25	NC_012036	TCA	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530717
26	NC_012036	CTG	2	6	4041	4046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
27	NC_012036	TCA	2	6	4171	4176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530718
28	NC_012036	ACC	2	6	4216	4221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530718
29	NC_012036	TCA	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530718
30	NC_012036	AAG	2	6	4311	4316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222530718
31	NC_012036	AGA	2	6	4629	4634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222530718
32	NC_012036	GCT	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530719
33	NC_012036	TAC	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
34	NC_012036	CTT	2	6	6198	6203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
35	NC_012036	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
36	NC_012036	CTT	2	6	6650	6655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
37	NC_012036	TTC	2	6	6814	6819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
38	NC_012036	TTC	2	6	6861	6866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
39	NC_012036	CTT	2	6	6946	6951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
40	NC_012036	CTA	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
41	NC_012036	ACT	2	6	7103	7108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
42	NC_012036	TGC	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
43	NC_012036	TCT	2	6	7222	7227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
44	NC_012036	CTG	2	6	7299	7304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
45	NC_012036	AGC	2	6	7451	7456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530720
46	NC_012036	CAA	2	6	7500	7505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530720
47	NC_012036	TCA	2	6	7613	7618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
48	NC_012036	CTT	2	6	7659	7664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
49	NC_012036	ACC	2	6	7668	7673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530720
50	NC_012036	ACC	2	6	7687	7692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530720
51	NC_012036	TTA	2	6	7766	7771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222530720
52	NC_012036	TTC	2	6	7837	7842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
53	NC_012036	CTG	2	6	7879	7884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
54	NC_012036	CAG	2	6	7978	7983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530720
55	NC_012036	TGC	2	6	8056	8061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
56	NC_012036	GGT	2	6	8064	8069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222530720
57	NC_012036	CCA	2	6	8082	8087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530720
58	NC_012036	CAG	2	6	8090	8095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530720
59	NC_012036	TCG	2	6	8156	8161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.