MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 10871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012032	GAAG	2	8	440	447	50 %	0 %	50 %	0 %	222523303
2	NC_012032	GCCT	2	8	774	781	0 %	25 %	25 %	50 %	222523303
3	NC_012032	TTCA	2	8	1087	1094	25 %	50 %	0 %	25 %	222523303
4	NC_012032	GAGC	2	8	1469	1476	25 %	0 %	50 %	25 %	222523303
5	NC_012032	TCGC	2	8	1514	1521	0 %	25 %	25 %	50 %	222523303
6	NC_012032	TGCG	2	8	2282	2289	0 %	25 %	50 %	25 %	222523304
7	NC_012032	GGCC	2	8	2825	2832	0 %	0 %	50 %	50 %	222523304
8	NC_012032	TGGC	2	8	3076	3083	0 %	25 %	50 %	25 %	222523304
9	NC_012032	CCAA	2	8	3137	3144	50 %	0 %	0 %	50 %	222523304
10	NC_012032	GCCA	2	8	4194	4201	25 %	0 %	25 %	50 %	222523305
11	NC_012032	AAAG	2	8	4445	4452	75 %	0 %	25 %	0 %	222523305
12	NC_012032	ACCA	2	8	4719	4726	50 %	0 %	0 %	50 %	222523305
13	NC_012032	GTAC	2	8	4909	4916	25 %	25 %	25 %	25 %	222523305
14	NC_012032	GGTA	2	8	6172	6179	25 %	25 %	50 %	0 %	222523306
15	NC_012032	CAGG	2	8	6429	6436	25 %	0 %	50 %	25 %	222523306
16	NC_012032	CCCA	2	8	6512	6519	25 %	0 %	0 %	75 %	222523306
17	NC_012032	GTCC	2	8	7465	7472	0 %	25 %	25 %	50 %	222523306
18	NC_012032	GATC	2	8	7474	7481	25 %	25 %	25 %	25 %	222523306
19	NC_012032	CGCC	2	8	7601	7608	0 %	0 %	25 %	75 %	222523306
20	NC_012032	GCGT	2	8	8428	8435	0 %	25 %	50 %	25 %	222523307
21	NC_012032	GCGG	2	8	8560	8567	0 %	0 %	75 %	25 %	222523307
22	NC_012032	GATA	2	8	9296	9303	50 %	25 %	25 %	0 %	222523308
23	NC_012032	CCAG	2	8	9364	9371	25 %	0 %	25 %	50 %	222523308
24	NC_012032	CAAC	2	8	9912	9919	50 %	0 %	0 %	50 %	222523308
25	NC_012032	CAAT	2	8	10187	10194	50 %	25 %	0 %	25 %	222523308
26	NC_012032	AGCC	2	8	11158	11165	25 %	0 %	25 %	50 %	222523310
27	NC_012032	ATCA	2	8	11183	11190	50 %	25 %	0 %	25 %	222523310
28	NC_012032	GATC	2	8	11227	11234	25 %	25 %	25 %	25 %	222523310
29	NC_012032	TGCC	2	8	11321	11328	0 %	25 %	25 %	50 %	222523310
30	NC_012032	CATC	2	8	11568	11575	25 %	25 %	0 %	50 %	222523311
31	NC_012032	AACC	2	8	11932	11939	50 %	0 %	0 %	50 %	222523311
32	NC_012032	GATC	2	8	12061	12068	25 %	25 %	25 %	25 %	222523311
33	NC_012032	GCGG	2	8	12972	12979	0 %	0 %	75 %	25 %	222523313
34	NC_012032	GGTT	2	8	13134	13141	0 %	50 %	50 %	0 %	222523313
35	NC_012032	AATG	2	8	13864	13871	50 %	25 %	25 %	0 %	222523313
36	NC_012032	TGGT	2	8	14506	14513	0 %	50 %	50 %	0 %	222523314
37	NC_012032	CTGG	2	8	14699	14706	0 %	25 %	50 %	25 %	222523314
38	NC_012032	CGGA	2	8	14803	14810	25 %	0 %	50 %	25 %	222523314
39	NC_012032	TGGC	2	8	14823	14830	0 %	25 %	50 %	25 %	222523314
40	NC_012032	GATC	2	8	15311	15318	25 %	25 %	25 %	25 %	222523315
41	NC_012032	TGGC	2	8	17838	17845	0 %	25 %	50 %	25 %	222523318
42	NC_012032	ACCC	2	8	18698	18705	25 %	0 %	0 %	75 %	222523319
43	NC_012032	CCGA	2	8	21117	21124	25 %	0 %	25 %	50 %	222523321
44	NC_012032	CAGG	2	8	21489	21496	25 %	0 %	50 %	25 %	222523321
45	NC_012032	ACGA	2	8	23765	23772	50 %	0 %	25 %	25 %	222523322
46	NC_012032	CGGT	2	8	24788	24795	0 %	25 %	50 %	25 %	222523323
47	NC_012032	ACAG	2	8	24945	24952	50 %	0 %	25 %	25 %	222523323
48	NC_012032	TCAG	2	8	25097	25104	25 %	25 %	25 %	25 %	222523323
49	NC_012032	TGAG	2	8	25163	25170	25 %	25 %	50 %	0 %	222523323
50	NC_012032	GTGC	2	8	25678	25685	0 %	25 %	50 %	25 %	222523323
51	NC_012032	CATC	2	8	26242	26249	25 %	25 %	0 %	50 %	222523324
52	NC_012032	GAGC	2	8	26320	26327	25 %	0 %	50 %	25 %	222523324
53	NC_012032	CAAC	2	8	26680	26687	50 %	0 %	0 %	50 %	222523325
54	NC_012032	CAGG	2	8	26770	26777	25 %	0 %	50 %	25 %	222523325
55	NC_012032	TGAT	2	8	26978	26985	25 %	50 %	25 %	0 %	222523325
56	NC_012032	ACCG	2	8	27062	27069	25 %	0 %	25 %	50 %	222523325
57	NC_012032	CACG	2	8	27388	27395	25 %	0 %	25 %	50 %	222523325
58	NC_012032	TGCA	2	8	27445	27452	25 %	25 %	25 %	25 %	222523325
59	NC_012032	ATGC	2	8	27726	27733	25 %	25 %	25 %	25 %	222523326
60	NC_012032	GGCC	2	8	28953	28960	0 %	0 %	50 %	50 %	222523327
61	NC_012032	GATC	2	8	29511	29518	25 %	25 %	25 %	25 %	222523327
62	NC_012032	CAAT	2	8	29547	29554	50 %	25 %	0 %	25 %	222523327
63	NC_012032	GAGC	2	8	29694	29701	25 %	0 %	50 %	25 %	222523327
64	NC_012032	ACCA	2	8	29794	29801	50 %	0 %	0 %	50 %	222523327
65	NC_012032	CTGG	2	8	30078	30085	0 %	25 %	50 %	25 %	222523327
66	NC_012032	CAGC	2	8	30368	30375	25 %	0 %	25 %	50 %	222523327
67	NC_012032	CGAC	2	8	30600	30607	25 %	0 %	25 %	50 %	222523327
68	NC_012032	TGGT	2	8	30935	30942	0 %	50 %	50 %	0 %	222523327
69	NC_012032	GAAG	2	8	31254	31261	50 %	0 %	50 %	0 %	222523327
70	NC_012032	GGCC	2	8	32750	32757	0 %	0 %	50 %	50 %	222523329
71	NC_012032	GGCA	2	8	33326	33333	25 %	0 %	50 %	25 %	222523330
72	NC_012032	ACCG	2	8	34040	34047	25 %	0 %	25 %	50 %	222523331
73	NC_012032	AATC	2	8	34171	34178	50 %	25 %	0 %	25 %	222523331
74	NC_012032	AGCC	2	8	35059	35066	25 %	0 %	25 %	50 %	222523332
75	NC_012032	TGCG	2	8	35795	35802	0 %	25 %	50 %	25 %	222523332
76	NC_012032	AGAA	2	8	36046	36053	75 %	0 %	25 %	0 %	222523332
77	NC_012032	CCAT	2	8	36953	36960	25 %	25 %	0 %	50 %	222523334
78	NC_012032	AACG	2	8	37531	37538	50 %	0 %	25 %	25 %	222523334
79	NC_012032	CAAT	2	8	38049	38056	50 %	25 %	0 %	25 %	222523335
80	NC_012032	CCGA	2	8	38281	38288	25 %	0 %	25 %	50 %	222523335
81	NC_012032	AGGC	2	8	38457	38464	25 %	0 %	50 %	25 %	222523335
82	NC_012032	GCAG	2	8	38472	38479	25 %	0 %	50 %	25 %	222523335
83	NC_012032	GGAT	2	8	38635	38642	25 %	25 %	50 %	0 %	222523335
84	NC_012032	GACC	2	8	39575	39582	25 %	0 %	25 %	50 %	222523337
85	NC_012032	CATC	3	12	39790	39801	25 %	25 %	0 %	50 %	222523337
86	NC_012032	CTGG	2	8	40363	40370	0 %	25 %	50 %	25 %	222523337
87	NC_012032	TCGT	2	8	42784	42791	0 %	50 %	25 %	25 %	222523340
88	NC_012032	GCCA	2	8	43165	43172	25 %	0 %	25 %	50 %	222523340
89	NC_012032	CAGC	2	8	43423	43430	25 %	0 %	25 %	50 %	222523341
90	NC_012032	GCCA	2	8	43464	43471	25 %	0 %	25 %	50 %	222523341
91	NC_012032	CAAG	2	8	43680	43687	50 %	0 %	25 %	25 %	222523341
92	NC_012032	GAAC	2	8	43705	43712	50 %	0 %	25 %	25 %	222523341
93	NC_012032	TCGG	2	8	43909	43916	0 %	25 %	50 %	25 %	222523342
94	NC_012032	GATA	2	8	44039	44046	50 %	25 %	25 %	0 %	222523342
95	NC_012032	GCCG	2	8	44217	44224	0 %	0 %	50 %	50 %	222523342
96	NC_012032	CAAT	2	8	44396	44403	50 %	25 %	0 %	25 %	222523342
97	NC_012032	GCCA	2	8	44559	44566	25 %	0 %	25 %	50 %	222523343
98	NC_012032	CAGC	2	8	44617	44624	25 %	0 %	25 %	50 %	222523343
99	NC_012032	TCGT	2	8	44735	44742	0 %	50 %	25 %	25 %	222523343
100	NC_012032	CGCC	2	8	44781	44788	0 %	0 %	25 %	75 %	222523343
101	NC_012032	AAGC	2	8	44860	44867	50 %	0 %	25 %	25 %	222523343
102	NC_012032	CAGC	2	8	45152	45159	25 %	0 %	25 %	50 %	222523343
103	NC_012032	AAAT	2	8	45307	45314	75 %	25 %	0 %	0 %	222523343
104	NC_012032	CCAT	2	8	45477	45484	25 %	25 %	0 %	50 %	222523344
105	NC_012032	GCCG	2	8	45644	45651	0 %	0 %	50 %	50 %	222523344
106	NC_012032	ACTG	2	8	45911	45918	25 %	25 %	25 %	25 %	222523344
107	NC_012032	ACGA	2	8	46594	46601	50 %	0 %	25 %	25 %	222523344
108	NC_012032	TGCG	2	8	46906	46913	0 %	25 %	50 %	25 %	222523344
109	NC_012032	TTGA	2	8	47409	47416	25 %	50 %	25 %	0 %	222523344
110	NC_012032	GCGA	2	8	48159	48166	25 %	0 %	50 %	25 %	222523344
111	NC_012032	TTTG	2	8	48938	48945	0 %	75 %	25 %	0 %	222523344
112	NC_012032	TGAC	2	8	49090	49097	25 %	25 %	25 %	25 %	222523345
113	NC_012032	GGTG	2	8	49531	49538	0 %	25 %	75 %	0 %	222523346
114	NC_012032	CTCG	2	8	50322	50329	0 %	25 %	25 %	50 %	222523346
115	NC_012032	ATTG	2	8	51381	51388	25 %	50 %	25 %	0 %	222523348
116	NC_012032	ACTG	2	8	51753	51760	25 %	25 %	25 %	25 %	222523348
117	NC_012032	CGTG	2	8	51888	51895	0 %	25 %	50 %	25 %	222523348
118	NC_012032	CCGA	2	8	52191	52198	25 %	0 %	25 %	50 %	222523349
119	NC_012032	TTGA	2	8	52617	52624	25 %	50 %	25 %	0 %	222523349
120	NC_012032	GTGC	2	8	53007	53014	0 %	25 %	50 %	25 %	222523349
121	NC_012032	GGTC	2	8	53042	53049	0 %	25 %	50 %	25 %	222523349
122	NC_012032	TCGG	2	8	53215	53222	0 %	25 %	50 %	25 %	222523349
123	NC_012032	CGAA	2	8	53324	53331	50 %	0 %	25 %	25 %	222523349
124	NC_012032	TTCG	2	8	53473	53480	0 %	50 %	25 %	25 %	222523349
125	NC_012032	GGCG	2	8	54239	54246	0 %	0 %	75 %	25 %	222523350
126	NC_012032	CGTG	2	8	55127	55134	0 %	25 %	50 %	25 %	222523351
127	NC_012032	ATTC	2	8	55729	55736	25 %	50 %	0 %	25 %	222523351
128	NC_012032	GATC	2	8	55892	55899	25 %	25 %	25 %	25 %	222523351
129	NC_012032	ACAG	2	8	56683	56690	50 %	0 %	25 %	25 %	222523352
130	NC_012032	CCTC	2	8	56705	56712	0 %	25 %	0 %	75 %	222523352
131	NC_012032	CAGG	2	8	57186	57193	25 %	0 %	50 %	25 %	222523353
132	NC_012032	CGCA	2	8	58501	58508	25 %	0 %	25 %	50 %	222523354
133	NC_012032	CTGG	2	8	58756	58763	0 %	25 %	50 %	25 %	222523354
134	NC_012032	CAGC	2	8	59446	59453	25 %	0 %	25 %	50 %	222523355
135	NC_012032	CAAC	2	8	60131	60138	50 %	0 %	0 %	50 %	222523356
136	NC_012032	GTAC	2	8	60314	60321	25 %	25 %	25 %	25 %	222523356
137	NC_012032	GGCA	2	8	60373	60380	25 %	0 %	50 %	25 %	222523356
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