MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 7434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012032	TG	3	6	254	259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012032	TC	3	6	393	398	0 %	50 %	0 %	50 %	222523303
3	NC_012032	GC	3	6	1506	1511	0 %	0 %	50 %	50 %	222523303
4	NC_012032	AG	3	6	3070	3075	50 %	0 %	50 %	0 %	222523304
5	NC_012032	CG	3	6	3423	3428	0 %	0 %	50 %	50 %	222523304
6	NC_012032	TC	3	6	3790	3795	0 %	50 %	0 %	50 %	222523304
7	NC_012032	GC	3	6	5750	5755	0 %	0 %	50 %	50 %	222523305
8	NC_012032	GC	3	6	5900	5905	0 %	0 %	50 %	50 %	222523305
9	NC_012032	GC	3	6	6908	6913	0 %	0 %	50 %	50 %	222523306
10	NC_012032	GT	3	6	8491	8496	0 %	50 %	50 %	0 %	222523307
11	NC_012032	CG	3	6	8548	8553	0 %	0 %	50 %	50 %	222523307
12	NC_012032	CT	3	6	10333	10338	0 %	50 %	0 %	50 %	222523308
13	NC_012032	CA	3	6	12645	12650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012032	CA	3	6	13493	13498	50 %	0 %	0 %	50 %	222523313
15	NC_012032	GC	3	6	13970	13975	0 %	0 %	50 %	50 %	222523314
16	NC_012032	GC	3	6	14163	14168	0 %	0 %	50 %	50 %	222523314
17	NC_012032	GT	3	6	14383	14388	0 %	50 %	50 %	0 %	222523314
18	NC_012032	GC	3	6	14634	14639	0 %	0 %	50 %	50 %	222523314
19	NC_012032	TC	3	6	15056	15061	0 %	50 %	0 %	50 %	222523314
20	NC_012032	GC	3	6	15471	15476	0 %	0 %	50 %	50 %	222523315
21	NC_012032	AC	3	6	15596	15601	50 %	0 %	0 %	50 %	222523315
22	NC_012032	AC	3	6	15703	15708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012032	GC	3	6	15872	15877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012032	AC	4	8	16218	16225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012032	AC	3	6	18026	18031	50 %	0 %	0 %	50 %	222523318
26	NC_012032	AG	3	6	18424	18429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012032	CA	4	8	19046	19053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012032	TC	4	8	21347	21354	0 %	50 %	0 %	50 %	222523321
29	NC_012032	TG	3	6	22531	22536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012032	CA	3	6	23281	23286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012032	CT	3	6	23312	23317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012032	CT	3	6	23572	23577	0 %	50 %	0 %	50 %	222523322
33	NC_012032	AG	3	6	24037	24042	50 %	0 %	50 %	0 %	222523322
34	NC_012032	CG	3	6	26457	26462	0 %	0 %	50 %	50 %	222523324
35	NC_012032	GC	3	6	27268	27273	0 %	0 %	50 %	50 %	222523325
36	NC_012032	GC	3	6	27501	27506	0 %	0 %	50 %	50 %	222523325
37	NC_012032	TG	3	6	28536	28541	0 %	50 %	50 %	0 %	222523326
38	NC_012032	GC	3	6	29177	29182	0 %	0 %	50 %	50 %	222523327
39	NC_012032	CG	3	6	29267	29272	0 %	0 %	50 %	50 %	222523327
40	NC_012032	GC	4	8	29367	29374	0 %	0 %	50 %	50 %	222523327
41	NC_012032	CG	3	6	30464	30469	0 %	0 %	50 %	50 %	222523327
42	NC_012032	AC	3	6	30501	30506	50 %	0 %	0 %	50 %	222523327
43	NC_012032	GC	3	6	30736	30741	0 %	0 %	50 %	50 %	222523327
44	NC_012032	AC	3	6	32097	32102	50 %	0 %	0 %	50 %	222523327
45	NC_012032	AC	3	6	32160	32165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012032	GT	3	6	32173	32178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012032	AC	3	6	32882	32887	50 %	0 %	0 %	50 %	222523329
48	NC_012032	AT	3	6	33790	33795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012032	AT	3	6	34743	34748	50 %	50 %	0 %	0 %	222523332
50	NC_012032	GC	3	6	35966	35971	0 %	0 %	50 %	50 %	222523332
51	NC_012032	CA	3	6	38233	38238	50 %	0 %	0 %	50 %	222523335
52	NC_012032	CA	3	6	39127	39132	50 %	0 %	0 %	50 %	222523336
53	NC_012032	GA	3	6	39855	39860	50 %	0 %	50 %	0 %	222523337
54	NC_012032	GA	4	8	41649	41656	50 %	0 %	50 %	0 %	222523338
55	NC_012032	AC	3	6	42306	42311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012032	CT	3	6	42414	42419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012032	TG	3	6	44053	44058	0 %	50 %	50 %	0 %	222523342
58	NC_012032	GC	3	6	44314	44319	0 %	0 %	50 %	50 %	222523342
59	NC_012032	GT	3	6	44524	44529	0 %	50 %	50 %	0 %	222523343
60	NC_012032	AC	3	6	44948	44953	50 %	0 %	0 %	50 %	222523343
61	NC_012032	GC	3	6	45264	45269	0 %	0 %	50 %	50 %	222523343
62	NC_012032	CT	3	6	45456	45461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012032	GT	3	6	46971	46976	0 %	50 %	50 %	0 %	222523344
64	NC_012032	GT	3	6	47122	47127	0 %	50 %	50 %	0 %	222523344
65	NC_012032	AG	3	6	47330	47335	50 %	0 %	50 %	0 %	222523344
66	NC_012032	AT	4	8	47788	47795	50 %	50 %	0 %	0 %	222523344
67	NC_012032	GT	3	6	50564	50569	0 %	50 %	50 %	0 %	222523347
68	NC_012032	TC	3	6	50727	50732	0 %	50 %	0 %	50 %	222523347
69	NC_012032	GC	4	8	51052	51059	0 %	0 %	50 %	50 %	222523348
70	NC_012032	CA	3	6	52432	52437	50 %	0 %	0 %	50 %	222523349
71	NC_012032	CG	3	6	55849	55854	0 %	0 %	50 %	50 %	222523351
72	NC_012032	CG	3	6	55910	55915	0 %	0 %	50 %	50 %	222523351
73	NC_012032	TG	3	6	56967	56972	0 %	50 %	50 %	0 %	222523352
74	NC_012032	GC	3	6	57708	57713	0 %	0 %	50 %	50 %	222523353
75	NC_012032	CG	3	6	57746	57751	0 %	0 %	50 %	50 %	222523353
76	NC_012032	CT	3	6	58649	58654	0 %	50 %	0 %	50 %	222523354
77	NC_012032	AC	3	6	58740	58745	50 %	0 %	0 %	50 %	222523354
78	NC_012032	AG	3	6	58774	58779	50 %	0 %	50 %	0 %	222523354
79	NC_012032	TA	3	6	59769	59774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012032	AT	3	6	59779	59784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012032	GC	3	6	61357	61362	0 %	0 %	50 %	50 %	222523357
82	NC_012032	CA	4	8	61496	61503	50 %	0 %	0 %	50 %	222523357
83	NC_012032	GA	3	6	63212	63217	50 %	0 %	50 %	0 %	222523358
84	NC_012032	GA	3	6	63996	64001	50 %	0 %	50 %	0 %	222523358
85	NC_012032	AC	3	6	65535	65540	50 %	0 %	0 %	50 %	222523359
86	NC_012032	TC	3	6	67034	67039	0 %	50 %	0 %	50 %	222523361
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88	NC_012032	CG	3	6	68657	68662	0 %	0 %	50 %	50 %	222523362
89	NC_012032	TC	3	6	69135	69140	0 %	50 %	0 %	50 %	222523363
90	NC_012032	GC	3	6	69583	69588	0 %	0 %	50 %	50 %	222523363
91	NC_012032	CA	3	6	69750	69755	50 %	0 %	0 %	50 %	222523363
92	NC_012032	AT	3	6	70048	70053	50 %	50 %	0 %	0 %	222523364
93	NC_012032	GC	3	6	70756	70761	0 %	0 %	50 %	50 %	222523364
94	NC_012032	GC	3	6	73571	73576	0 %	0 %	50 %	50 %	222523366
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96	NC_012032	GC	3	6	75240	75245	0 %	0 %	50 %	50 %	222523366
97	NC_012032	CA	3	6	75591	75596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012032	GC	3	6	75639	75644	0 %	0 %	50 %	50 %	222523367
99	NC_012032	AC	3	6	76676	76681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012032	AC	3	6	76701	76706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012032	AC	3	6	76900	76905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012032	GC	3	6	77306	77311	0 %	0 %	50 %	50 %	222523369
103	NC_012032	GC	3	6	77378	77383	0 %	0 %	50 %	50 %	222523369
104	NC_012032	CT	3	6	78039	78044	0 %	50 %	0 %	50 %	222523370
105	NC_012032	GC	3	6	79094	79099	0 %	0 %	50 %	50 %	222523371
106	NC_012032	GA	3	6	79246	79251	50 %	0 %	50 %	0 %	222523371
107	NC_012032	CG	3	6	79715	79720	0 %	0 %	50 %	50 %	222523372
108	NC_012032	GA	3	6	81539	81544	50 %	0 %	50 %	0 %	222523373
109	NC_012032	GC	3	6	81951	81956	0 %	0 %	50 %	50 %	222523373
110	NC_012032	CT	3	6	82278	82283	0 %	50 %	0 %	50 %	222523373
111	NC_012032	CG	3	6	82529	82534	0 %	0 %	50 %	50 %	222523373
112	NC_012032	GC	3	6	82766	82771	0 %	0 %	50 %	50 %	222523373
113	NC_012032	AC	3	6	82906	82911	50 %	0 %	0 %	50 %	222523373
114	NC_012032	CG	3	6	83029	83034	0 %	0 %	50 %	50 %	222523373
115	NC_012032	GC	3	6	83374	83379	0 %	0 %	50 %	50 %	222523373
116	NC_012032	GC	3	6	83549	83554	0 %	0 %	50 %	50 %	222523373
117	NC_012032	TC	3	6	83722	83727	0 %	50 %	0 %	50 %	222523373
118	NC_012032	AC	3	6	84256	84261	50 %	0 %	0 %	50 %	222523374
119	NC_012032	GC	3	6	84324	84329	0 %	0 %	50 %	50 %	222523374
120	NC_012032	AT	3	6	84948	84953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012032	CA	3	6	85061	85066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012032	TG	3	6	86081	86086	0 %	50 %	50 %	0 %	222523375
123	NC_012032	AC	3	6	86619	86624	50 %	0 %	0 %	50 %	222523375
124	NC_012032	AC	3	6	86736	86741	50 %	0 %	0 %	50 %	222523376
125	NC_012032	GC	3	6	87552	87557	0 %	0 %	50 %	50 %	222523376
126	NC_012032	GC	3	6	88073	88078	0 %	0 %	50 %	50 %	222523376
127	NC_012032	AG	3	6	88334	88339	50 %	0 %	50 %	0 %	222523376
128	NC_012032	AG	3	6	88951	88956	50 %	0 %	50 %	0 %	222523376
129	NC_012032	GC	3	6	89266	89271	0 %	0 %	50 %	50 %	222523376
130	NC_012032	TG	3	6	90034	90039	0 %	50 %	50 %	0 %	222523377
131	NC_012032	GA	4	8	91016	91023	50 %	0 %	50 %	0 %	222523377
132	NC_012032	CG	3	6	91523	91528	0 %	0 %	50 %	50 %	222523378
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136	NC_012032	AC	3	6	92322	92327	50 %	0 %	0 %	50 %	222523379
137	NC_012032	AC	3	6	94709	94714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012032	CA	3	6	94760	94765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012032	GC	3	6	95054	95059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012032	CG	3	6	95697	95702	0 %	0 %	50 %	50 %	222523381
141	NC_012032	CG	3	6	96011	96016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_012032	CA	3	6	96134	96139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012032	AT	3	6	96365	96370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012032	CT	3	6	96981	96986	0 %	50 %	0 %	50 %	222523383
145	NC_012032	TG	4	8	97502	97509	0 %	50 %	50 %	0 %	222523383
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