MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012030	GTGCGA	2	12	17438	17449	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012030	GTGTGG	2	12	31002	31013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012030	GCTGTC	2	12	39619	39630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012030	TGCAAC	2	12	45343	45354	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012030	TTCGAG	2	12	51364	51375	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012030	GCTGTC	2	12	57391	57402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012030	GGAGGG	2	12	59765	59776	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012030	GCTGTC	2	12	66112	66123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012030	CACCCC	2	12	68656	68667	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
10	NC_012030	GATCGC	2	12	70020	70031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012030	TCTTCG	2	12	74367	74378	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012030	GTGTCT	2	12	94517	94528	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012030	GCTGTC	2	12	95502	95513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012030	GGATGA	2	12	115241	115252	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012030	GCTGTC	2	12	115901	115912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012030	CGGGGG	2	12	124310	124321	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012030	CGCGGT	2	12	125037	125048	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012030	CGCAAC	2	12	146047	146058	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012030	GCTGTC	2	12	147697	147708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012030	TCTGGA	2	12	189207	189218	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012030	TATGAT	2	12	194883	194894	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012030	TACGAC	2	12	230768	230779	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012030	ACCGGT	2	12	232481	232492	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012030	GCTGTC	2	12	236518	236529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012030	GTTGTC	2	12	236826	236837	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012030	AGATCC	2	12	245446	245457	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012030	CACTCA	2	12	247628	247639	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012030	CTGATT	2	12	247961	247972	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012030	GCTGTC	2	12	251722	251733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012030	TTCGAC	2	12	267894	267905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012030	GTCGCG	2	12	268938	268949	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012030	CGTTGG	2	12	293163	293174	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012030	GGGAGT	2	12	334422	334433	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012030	TTCACA	2	12	336367	336378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012030	GAACGC	2	12	338477	338488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012030	GAACGC	2	12	338771	338782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012030	GACAGC	2	12	358086	358097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012030	TGCAAC	2	12	362763	362774	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012030	CTAAAA	2	12	368763	368774	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012030	GAAGCC	2	12	369666	369677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012030	ATCACC	2	12	373833	373844	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012030	ATTATG	2	12	395067	395078	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012030	ATCGGT	2	12	395130	395141	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012030	CGAGGG	2	12	404004	404015	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012030	GTCTCA	2	12	413657	413668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.