MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 1378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012030	GCC	2	6	22	27	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_012030	CTC	2	6	8145	8150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_012030	GCC	2	6	8160	8165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_012030	AAG	2	6	8927	8932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012030	ATA	2	6	9049	9054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012030	CTA	2	6	10760	10765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012030	TGG	2	6	10783	10788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012030	AGA	2	6	10797	10802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012030	CAC	2	6	10849	10854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_012030	CCG	2	6	10981	10986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_012030	CGT	2	6	10999	11004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012030	TGG	2	6	11026	11031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012030	TGT	2	6	11051	11056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012030	CGA	2	6	11086	11091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012030	CTG	2	6	11117	11122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012030	CGC	2	6	11201	11206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_012030	CGG	2	6	11301	11306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012030	ACG	2	6	11402	11407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012030	GTC	3	9	11434	11442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012030	CGA	2	6	11495	11500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012030	TGA	2	6	11507	11512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012030	TAG	2	6	11522	11527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012030	CGC	2	6	11560	11565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_012030	CGA	2	6	11587	11592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012030	CAC	2	6	11773	11778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_012030	CCA	2	6	14695	14700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_012030	AAC	2	6	14744	14749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012030	TAA	2	6	14775	14780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012030	ACC	2	6	14800	14805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_012030	AAT	2	6	14815	14820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012030	TGG	2	6	14888	14893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012030	TAC	2	6	15149	15154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012030	CGA	2	6	15301	15306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012030	CAG	2	6	15309	15314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012030	TGT	2	6	15403	15408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012030	TTC	2	6	15552	15557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012030	CTG	2	6	15566	15571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012030	CCT	2	6	15600	15605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_012030	TGT	2	6	15662	15667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012030	CCG	2	6	15869	15874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_012030	GCC	2	6	15906	15911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_012030	ACG	2	6	15951	15956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012030	CCA	2	6	15984	15989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_012030	TCG	2	6	16029	16034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012030	ATA	2	6	16749	16754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012030	GAA	2	6	16856	16861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012030	CAA	2	6	16929	16934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012030	CCA	2	6	16936	16941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_012030	TGT	2	6	16953	16958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012030	GAC	2	6	17284	17289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012030	GCT	2	6	17296	17301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012030	ATG	2	6	17371	17376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012030	GGT	2	6	17858	17863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012030	TGG	2	6	17902	17907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012030	AAG	2	6	17915	17920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012030	TAG	2	6	17971	17976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012030	ACG	2	6	17986	17991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012030	CTA	2	6	18025	18030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012030	TCT	2	6	18064	18069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012030	AAT	2	6	18603	18608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012030	ATT	2	6	18665	18670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012030	CTA	2	6	19040	19045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012030	TCG	2	6	19080	19085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012030	CGT	2	6	20196	20201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012030	GCC	2	6	20287	20292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_012030	GCG	2	6	20301	20306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012030	GTG	2	6	20342	20347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012030	CGG	2	6	20403	20408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012030	TCG	2	6	20743	20748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012030	TTG	2	6	20883	20888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012030	TCA	2	6	20905	20910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012030	GTG	2	6	28925	28930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012030	CTG	2	6	30845	30850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012030	TCA	2	6	30918	30923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012030	TCC	2	6	30925	30930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_012030	AAT	2	6	30990	30995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012030	GTC	2	6	31043	31048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012030	GAC	2	6	31456	31461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012030	GTT	2	6	32228	32233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012030	ACG	2	6	32470	32475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012030	ACG	2	6	32523	32528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012030	TTC	2	6	32873	32878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012030	TCG	2	6	32934	32939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012030	TGG	2	6	32982	32987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012030	GAG	2	6	35983	35988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012030	TCT	2	6	37191	37196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012030	AGC	2	6	37217	37222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012030	AAT	2	6	38149	38154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012030	CGA	2	6	38178	38183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012030	TGA	2	6	38277	38282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012030	CCA	2	6	38803	38808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_012030	TCA	2	6	38864	38869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012030	CAC	2	6	38978	38983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_012030	TCA	2	6	39052	39057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012030	GAA	2	6	39101	39106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012030	AGA	2	6	39148	39153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012030	TCG	2	6	39198	39203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012030	GAC	2	6	39239	39244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012030	GAA	2	6	39322	39327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012030	GAT	2	6	39368	39373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012030	ACG	2	6	39459	39464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012030	CGA	2	6	39587	39592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012030	GGC	2	6	39631	39636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012030	GCC	2	6	39642	39647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_012030	ACC	2	6	40984	40989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_012030	CGG	2	6	41003	41008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012030	TGA	2	6	41021	41026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012030	AAC	2	6	41160	41165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012030	AGA	2	6	41198	41203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012030	CTG	2	6	41247	41252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012030	ACG	2	6	41279	41284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012030	TGA	2	6	41324	41329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012030	GAA	2	6	41334	41339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012030	AGC	2	6	41341	41346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012030	AGA	2	6	41426	41431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012030	GAA	3	9	41553	41561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012030	GTC	2	6	41595	41600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012030	AAC	2	6	41654	41659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012030	TCG	2	6	41668	41673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012030	AGC	2	6	41693	41698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012030	CGG	2	6	41783	41788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012030	TGG	2	6	41953	41958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012030	ACG	2	6	42129	42134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012030	AGA	2	6	42137	42142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012030	GAC	2	6	42165	42170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012030	GCC	2	6	42182	42187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_012030	CGC	2	6	42223	42228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_012030	ATT	2	6	42270	42275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012030	CTG	2	6	44188	44193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012030	CTA	2	6	44284	44289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012030	GTT	2	6	44296	44301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012030	CGA	2	6	44360	44365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012030	ACT	2	6	45165	45170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012030	CTT	2	6	45262	45267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012030	CTG	2	6	45304	45309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012030	CAC	2	6	45403	45408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_012030	GAG	2	6	45530	45535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012030	CGG	2	6	45639	45644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012030	TCG	2	6	48714	48719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012030	GTT	2	6	48722	48727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_012030	TAA	2	6	117866	117871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_012030	TCC	2	6	117995	118000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
413	NC_012030	CGG	2	6	119417	119422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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