MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 311

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012030	TA	4	8	14822	14829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012030	TG	4	8	14929	14936	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012030	TC	3	6	15039	15044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012030	GT	3	6	15056	15061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012030	AT	3	6	15090	15095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012030	GT	3	6	15369	15374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012030	TG	3	6	15392	15397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012030	GT	3	6	17054	17059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012030	TA	3	6	17931	17936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012030	TC	3	6	18012	18017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012030	AC	3	6	18690	18695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012030	TG	3	6	18750	18755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012030	CA	3	6	19105	19110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012030	AG	4	8	20317	20324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012030	TG	3	6	30800	30805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012030	CT	3	6	30808	30813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012030	CG	3	6	32364	32369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012030	GA	3	6	35940	35945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012030	TG	3	6	37200	37205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012030	AG	3	6	38903	38908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012030	GA	3	6	39083	39088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012030	GA	3	6	39591	39596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012030	AC	3	6	41232	41237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012030	AC	3	6	41443	41448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012030	CT	3	6	41877	41882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012030	TG	4	8	44218	44225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012030	AG	3	6	45085	45090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012030	TC	3	6	45312	45317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012030	TG	3	6	45327	45332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012030	CA	3	6	51379	51384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012030	TG	3	6	51497	51502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012030	TC	4	8	52609	52616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012030	CT	3	6	54468	54473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012030	TC	3	6	54749	54754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012030	AC	3	6	54791	54796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012030	TA	3	6	54945	54950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012030	GA	4	8	55035	55042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012030	CT	3	6	55069	55074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012030	TG	3	6	55163	55168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012030	AT	3	6	55238	55243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012030	AG	3	6	55246	55251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012030	AG	3	6	55453	55458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012030	GC	3	6	55466	55471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012030	CT	3	6	55796	55801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012030	GA	3	6	57363	57368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012030	AC	3	6	59029	59034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012030	TA	3	6	61145	61150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012030	GA	3	6	63545	63550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012030	GA	3	6	63590	63595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012030	TG	3	6	63656	63661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012030	AT	3	6	65581	65586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012030	AG	3	6	65615	65620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012030	GT	3	6	65785	65790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012030	GA	3	6	66084	66089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012030	GA	3	6	67722	67727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012030	AG	3	6	67735	67740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012030	AC	4	8	68668	68675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012030	GA	4	8	71074	71081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012030	GT	3	6	71987	71992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012030	GT	3	6	73178	73183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012030	AC	3	6	73985	73990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012030	CA	3	6	76170	76175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012030	GA	3	6	88297	88302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012030	TC	3	6	88425	88430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012030	TA	3	6	88716	88721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012030	AC	3	6	88792	88797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012030	AC	3	6	88811	88816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012030	TC	3	6	91171	91176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012030	AT	3	6	94087	94092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012030	TG	3	6	94567	94572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012030	GA	3	6	94581	94586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012030	GA	3	6	95152	95157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012030	GA	3	6	95474	95479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012030	AC	3	6	95703	95708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012030	GA	3	6	95889	95894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012030	CT	3	6	106081	106086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012030	TC	3	6	107448	107453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012030	TG	3	6	115660	115665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012030	TG	3	6	115744	115749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012030	TG	3	6	115756	115761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012030	GA	3	6	115873	115878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012030	AC	3	6	117204	117209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012030	TC	3	6	117729	117734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012030	CA	3	6	117785	117790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012030	TC	3	6	117960	117965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012030	TC	3	6	119426	119431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012030	CA	3	6	119603	119608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012030	AC	3	6	122463	122468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012030	AC	3	6	123991	123996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012030	AG	3	6	124114	124119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012030	TA	3	6	124160	124165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012030	CA	3	6	125305	125310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012030	AC	3	6	128283	128288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012030	GA	3	6	129974	129979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012030	CA	3	6	130715	130720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012030	AG	3	6	132537	132542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012030	GA	3	6	133149	133154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012030	AC	3	6	139179	139184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012030	CA	3	6	139328	139333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012030	CG	3	6	139419	139424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012030	TC	3	6	139548	139553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012030	GA	3	6	140693	140698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012030	AT	3	6	140803	140808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012030	AT	3	6	140810	140815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012030	AT	3	6	140818	140823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012030	GA	3	6	141063	141068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012030	TA	4	8	141413	141420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012030	CT	3	6	141707	141712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012030	GA	3	6	143514	143519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012030	CA	3	6	143657	143662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_012030	TC	3	6	143693	143698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012030	AT	3	6	147520	147525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012030	GA	3	6	147669	147674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012030	AT	3	6	149092	149097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012030	AT	3	6	149132	149137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012030	GA	3	6	149289	149294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012030	TG	3	6	149523	149528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012030	TA	3	6	149603	149608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012030	GA	3	6	149896	149901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012030	TG	3	6	150207	150212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012030	TA	4	8	153494	153501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012030	TC	3	6	154174	154179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012030	CT	3	6	154304	154309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012030	CA	3	6	155682	155687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012030	AG	3	6	156813	156818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012030	TG	4	8	158203	158210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012030	TC	3	6	158413	158418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012030	TA	3	6	159063	159068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012030	AC	3	6	161172	161177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_012030	AT	3	6	164022	164027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012030	GT	3	6	167483	167488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012030	AT	3	6	167623	167628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012030	CT	3	6	167862	167867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_012030	TC	3	6	167921	167926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_012030	CA	3	6	173570	173575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012030	AG	3	6	177107	177112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012030	TC	3	6	179704	179709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012030	TC	3	6	180030	180035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012030	GA	3	6	191601	191606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012030	AG	3	6	191941	191946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012030	GT	3	6	194937	194942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012030	AC	3	6	197876	197881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012030	GA	3	6	199170	199175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012030	CT	3	6	199209	199214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_012030	CG	3	6	230310	230315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_012030	TC	3	6	230352	230357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_012030	GC	4	8	235345	235352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012030	AG	3	6	235426	235431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012030	CA	3	6	236398	236403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_012030	GA	3	6	236490	236495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012030	CG	3	6	237318	237323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_012030	TC	3	6	237688	237693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_012030	GC	3	6	238055	238060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_012030	AC	3	6	239661	239666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_012030	GT	3	6	240603	240608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_012030	TC	3	6	240744	240749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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310	NC_012030	TC	3	6	429455	429460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
311	NC_012030	TG	3	6	429536	429541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.