MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012030	A	6	6	3036	3041	100 %	0 %	0 %	0 %	222481155
2	NC_012030	G	6	6	4016	4021	0 %	0 %	100 %	0 %	222481155
3	NC_012030	G	6	6	5334	5339	0 %	0 %	100 %	0 %	222481156
4	NC_012030	A	7	7	12098	12104	100 %	0 %	0 %	0 %	222481162
5	NC_012030	A	6	6	17449	17454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012030	C	6	6	18916	18921	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_012030	A	6	6	23951	23956	100 %	0 %	0 %	0 %	222481172
8	NC_012030	G	6	6	24568	24573	0 %	0 %	100 %	0 %	222481172
9	NC_012030	C	6	6	32537	32542	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_012030	T	6	6	34988	34993	0 %	100 %	0 %	0 %	222481181
11	NC_012030	T	6	6	36061	36066	0 %	100 %	0 %	0 %	222481182
12	NC_012030	A	6	6	53268	53273	100 %	0 %	0 %	0 %	222481197
13	NC_012030	G	6	6	54175	54180	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012030	C	6	6	54875	54880	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_012030	C	6	6	60887	60892	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_012030	C	6	6	61028	61033	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_012030	T	6	6	62659	62664	0 %	100 %	0 %	0 %	222481204
18	NC_012030	G	6	6	63326	63331	0 %	0 %	100 %	0 %	222481204
19	NC_012030	T	6	6	77560	77565	0 %	100 %	0 %	0 %	222481210
20	NC_012030	T	6	6	78807	78812	0 %	100 %	0 %	0 %	222481211
21	NC_012030	T	6	6	81007	81012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012030	T	6	6	82929	82934	0 %	100 %	0 %	0 %	222481214
23	NC_012030	A	6	6	84227	84232	100 %	0 %	0 %	0 %	222481214
24	NC_012030	G	6	6	85659	85664	0 %	0 %	100 %	0 %	222481215
25	NC_012030	T	6	6	87612	87617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012030	A	6	6	88655	88660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012030	A	7	7	91620	91626	100 %	0 %	0 %	0 %	222481220
28	NC_012030	T	6	6	94194	94199	0 %	100 %	0 %	0 %	222481223
29	NC_012030	T	6	6	97376	97381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012030	G	6	6	98373	98378	0 %	0 %	100 %	0 %	222481226
31	NC_012030	A	6	6	100798	100803	100 %	0 %	0 %	0 %	222481227
32	NC_012030	T	6	6	104940	104945	0 %	100 %	0 %	0 %	222481231
33	NC_012030	T	6	6	108609	108614	0 %	100 %	0 %	0 %	222481233
34	NC_012030	C	6	6	109474	109479	0 %	0 %	0 %	100 %	222481233
35	NC_012030	G	6	6	110879	110884	0 %	0 %	100 %	0 %	222481235
36	NC_012030	C	6	6	113569	113574	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_012030	G	6	6	122308	122313	0 %	0 %	100 %	0 %	222481247
38	NC_012030	C	6	6	123955	123960	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_012030	C	6	6	131486	131491	0 %	0 %	0 %	100 %	222481257
40	NC_012030	G	6	6	133255	133260	0 %	0 %	100 %	0 %	222481259
41	NC_012030	G	6	6	134010	134015	0 %	0 %	100 %	0 %	222481259
42	NC_012030	C	6	6	145697	145702	0 %	0 %	0 %	100 %	222481271
43	NC_012030	A	6	6	150077	150082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012030	A	6	6	153723	153728	100 %	0 %	0 %	0 %	222481277
45	NC_012030	A	6	6	155514	155519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012030	A	6	6	164203	164208	100 %	0 %	0 %	0 %	222481287
47	NC_012030	A	6	6	165057	165062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012030	A	6	6	165824	165829	100 %	0 %	0 %	0 %	222481288
49	NC_012030	A	7	7	166118	166124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012030	A	6	6	167549	167554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012030	A	6	6	169980	169985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012030	A	6	6	170471	170476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012030	T	6	6	171076	171081	0 %	100 %	0 %	0 %	222481296
54	NC_012030	G	6	6	171393	171398	0 %	0 %	100 %	0 %	222481296
55	NC_012030	T	6	6	172701	172706	0 %	100 %	0 %	0 %	222481298
56	NC_012030	T	6	6	174013	174018	0 %	100 %	0 %	0 %	222481300
57	NC_012030	T	6	6	174126	174131	0 %	100 %	0 %	0 %	222481300
58	NC_012030	T	7	7	174846	174852	0 %	100 %	0 %	0 %	222481302
59	NC_012030	T	6	6	175480	175485	0 %	100 %	0 %	0 %	222481302
60	NC_012030	A	6	6	175598	175603	100 %	0 %	0 %	0 %	222481302
61	NC_012030	T	6	6	180418	180423	0 %	100 %	0 %	0 %	222481308
62	NC_012030	C	7	7	184562	184568	0 %	0 %	0 %	100 %	222481310
63	NC_012030	G	6	6	185313	185318	0 %	0 %	100 %	0 %	222481310
64	NC_012030	A	6	6	189116	189121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012030	G	6	6	204221	204226	0 %	0 %	100 %	0 %	222481327
66	NC_012030	G	6	6	204744	204749	0 %	0 %	100 %	0 %	222481328
67	NC_012030	A	6	6	211702	211707	100 %	0 %	0 %	0 %	222481333
68	NC_012030	C	6	6	218646	218651	0 %	0 %	0 %	100 %	222481342
69	NC_012030	G	6	6	219631	219636	0 %	0 %	100 %	0 %	222481344
70	NC_012030	C	6	6	222393	222398	0 %	0 %	0 %	100 %	222481346
71	NC_012030	C	6	6	226016	226021	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_012030	G	6	6	229585	229590	0 %	0 %	100 %	0 %	222481353
73	NC_012030	G	6	6	230334	230339	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012030	G	7	7	234178	234184	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012030	T	6	6	236073	236078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012030	G	7	7	236367	236373	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012030	G	7	7	239651	239657	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012030	T	6	6	240483	240488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012030	A	6	6	247235	247240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012030	G	6	6	249068	249073	0 %	0 %	100 %	0 %	222481373
81	NC_012030	T	6	6	250616	250621	0 %	100 %	0 %	0 %	222481376
82	NC_012030	T	6	6	251157	251162	0 %	100 %	0 %	0 %	222481378
83	NC_012030	A	7	7	253558	253564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012030	G	7	7	254479	254485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012030	C	6	6	254899	254904	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_012030	A	6	6	256390	256395	100 %	0 %	0 %	0 %	222481381
87	NC_012030	A	6	6	256525	256530	100 %	0 %	0 %	0 %	222481381
88	NC_012030	C	6	6	259520	259525	0 %	0 %	0 %	100 %	222481384
89	NC_012030	A	7	7	267229	267235	100 %	0 %	0 %	0 %	222481389
90	NC_012030	G	6	6	273236	273241	0 %	0 %	100 %	0 %	222481394
91	NC_012030	T	6	6	273680	273685	0 %	100 %	0 %	0 %	222481394
92	NC_012030	C	6	6	277931	277936	0 %	0 %	0 %	100 %	222481398
93	NC_012030	C	6	6	278944	278949	0 %	0 %	0 %	100 %	222481399
94	NC_012030	A	7	7	280340	280346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012030	G	7	7	281178	281184	0 %	0 %	100 %	0 %	222481401
96	NC_012030	A	6	6	285991	285996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012030	G	6	6	288685	288690	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012030	A	6	6	292979	292984	100 %	0 %	0 %	0 %	222481412
99	NC_012030	A	6	6	293115	293120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012030	C	6	6	299294	299299	0 %	0 %	0 %	100 %	222481420
101	NC_012030	G	6	6	300783	300788	0 %	0 %	100 %	0 %	222481421
102	NC_012030	G	6	6	302526	302531	0 %	0 %	100 %	0 %	222481422
103	NC_012030	A	6	6	312756	312761	100 %	0 %	0 %	0 %	222481431
104	NC_012030	A	6	6	313297	313302	100 %	0 %	0 %	0 %	222481433
105	NC_012030	C	6	6	316772	316777	0 %	0 %	0 %	100 %	222481436
106	NC_012030	A	6	6	321863	321868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012030	T	7	7	326568	326574	0 %	100 %	0 %	0 %	222481441
108	NC_012030	A	6	6	329097	329102	100 %	0 %	0 %	0 %	222481443
109	NC_012030	G	6	6	331423	331428	0 %	0 %	100 %	0 %	222481444
110	NC_012030	C	6	6	333500	333505	0 %	0 %	0 %	100 %	222481447
111	NC_012030	C	6	6	334003	334008	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_012030	A	8	8	335005	335012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012030	C	6	6	335876	335881	0 %	0 %	0 %	100 %	222481448
114	NC_012030	A	6	6	339162	339167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012030	G	6	6	341759	341764	0 %	0 %	100 %	0 %	222481457
116	NC_012030	A	6	6	351820	351825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012030	T	6	6	353624	353629	0 %	100 %	0 %	0 %	222481468
118	NC_012030	A	6	6	358364	358369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012030	G	6	6	365936	365941	0 %	0 %	100 %	0 %	222481476
120	NC_012030	G	6	6	376742	376747	0 %	0 %	100 %	0 %	222481486
121	NC_012030	G	6	6	377312	377317	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012030	T	6	6	382519	382524	0 %	100 %	0 %	0 %	222481491
123	NC_012030	C	6	6	383079	383084	0 %	0 %	0 %	100 %	222481491
124	NC_012030	A	6	6	384173	384178	100 %	0 %	0 %	0 %	222481492
125	NC_012030	C	6	6	389686	389691	0 %	0 %	0 %	100 %	222481494
126	NC_012030	T	6	6	394914	394919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012030	T	7	7	398522	398528	0 %	100 %	0 %	0 %	222481499
128	NC_012030	C	6	6	401923	401928	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_012030	G	6	6	403769	403774	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012030	T	6	6	407505	407510	0 %	100 %	0 %	0 %	222481511
131	NC_012030	T	6	6	408944	408949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012030	G	6	6	409363	409368	0 %	0 %	100 %	0 %	222481513
133	NC_012030	T	7	7	411081	411087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012030	T	7	7	411296	411302	0 %	100 %	0 %	0 %	222481517
135	NC_012030	T	6	6	415360	415365	0 %	100 %	0 %	0 %	222481518
136	NC_012030	T	6	6	418217	418222	0 %	100 %	0 %	0 %	222481520
137	NC_012030	T	6	6	418601	418606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012030	C	7	7	419047	419053	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_012030	A	6	6	424024	424029	100 %	0 %	0 %	0 %	222481524
140	NC_012030	C	7	7	424626	424632	0 %	0 %	0 %	100 %	222481524
141	NC_012030	A	6	6	425170	425175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012030	G	6	6	425981	425986	0 %	0 %	100 %	0 %	222481525
143	NC_012030	G	6	6	426015	426020	0 %	0 %	100 %	0 %	222481525
144	NC_012030	C	6	6	427496	427501	0 %	0 %	0 %	100 %	222481525
145	NC_012030	A	6	6	429504	429509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.