MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012030	A	6	6	3036	3041	100 %	0 %	0 %	0 %	222481155
2	NC_012030	G	6	6	4016	4021	0 %	0 %	100 %	0 %	222481155
3	NC_012030	G	6	6	5334	5339	0 %	0 %	100 %	0 %	222481156
4	NC_012030	A	7	7	12098	12104	100 %	0 %	0 %	0 %	222481162
5	NC_012030	A	6	6	23951	23956	100 %	0 %	0 %	0 %	222481172
6	NC_012030	G	6	6	24568	24573	0 %	0 %	100 %	0 %	222481172
7	NC_012030	T	6	6	34988	34993	0 %	100 %	0 %	0 %	222481181
8	NC_012030	T	6	6	36061	36066	0 %	100 %	0 %	0 %	222481182
9	NC_012030	A	6	6	53268	53273	100 %	0 %	0 %	0 %	222481197
10	NC_012030	T	6	6	62659	62664	0 %	100 %	0 %	0 %	222481204
11	NC_012030	G	6	6	63326	63331	0 %	0 %	100 %	0 %	222481204
12	NC_012030	T	6	6	77560	77565	0 %	100 %	0 %	0 %	222481210
13	NC_012030	T	6	6	78807	78812	0 %	100 %	0 %	0 %	222481211
14	NC_012030	T	6	6	82929	82934	0 %	100 %	0 %	0 %	222481214
15	NC_012030	A	6	6	84227	84232	100 %	0 %	0 %	0 %	222481214
16	NC_012030	G	6	6	85659	85664	0 %	0 %	100 %	0 %	222481215
17	NC_012030	A	7	7	91620	91626	100 %	0 %	0 %	0 %	222481220
18	NC_012030	T	6	6	94194	94199	0 %	100 %	0 %	0 %	222481223
19	NC_012030	G	6	6	98373	98378	0 %	0 %	100 %	0 %	222481226
20	NC_012030	A	6	6	100798	100803	100 %	0 %	0 %	0 %	222481227
21	NC_012030	T	6	6	104940	104945	0 %	100 %	0 %	0 %	222481231
22	NC_012030	T	6	6	108609	108614	0 %	100 %	0 %	0 %	222481233
23	NC_012030	C	6	6	109474	109479	0 %	0 %	0 %	100 %	222481233
24	NC_012030	G	6	6	110879	110884	0 %	0 %	100 %	0 %	222481235
25	NC_012030	G	6	6	122308	122313	0 %	0 %	100 %	0 %	222481247
26	NC_012030	C	6	6	131486	131491	0 %	0 %	0 %	100 %	222481257
27	NC_012030	G	6	6	133255	133260	0 %	0 %	100 %	0 %	222481259
28	NC_012030	G	6	6	134010	134015	0 %	0 %	100 %	0 %	222481259
29	NC_012030	C	6	6	145697	145702	0 %	0 %	0 %	100 %	222481271
30	NC_012030	A	6	6	153723	153728	100 %	0 %	0 %	0 %	222481277
31	NC_012030	A	6	6	164203	164208	100 %	0 %	0 %	0 %	222481287
32	NC_012030	A	6	6	165824	165829	100 %	0 %	0 %	0 %	222481288
33	NC_012030	T	6	6	171076	171081	0 %	100 %	0 %	0 %	222481296
34	NC_012030	G	6	6	171393	171398	0 %	0 %	100 %	0 %	222481296
35	NC_012030	T	6	6	172701	172706	0 %	100 %	0 %	0 %	222481298
36	NC_012030	T	6	6	174013	174018	0 %	100 %	0 %	0 %	222481300
37	NC_012030	T	6	6	174126	174131	0 %	100 %	0 %	0 %	222481300
38	NC_012030	T	7	7	174846	174852	0 %	100 %	0 %	0 %	222481302
39	NC_012030	T	6	6	175480	175485	0 %	100 %	0 %	0 %	222481302
40	NC_012030	A	6	6	175598	175603	100 %	0 %	0 %	0 %	222481302
41	NC_012030	T	6	6	180418	180423	0 %	100 %	0 %	0 %	222481308
42	NC_012030	C	7	7	184562	184568	0 %	0 %	0 %	100 %	222481310
43	NC_012030	G	6	6	185313	185318	0 %	0 %	100 %	0 %	222481310
44	NC_012030	G	6	6	204221	204226	0 %	0 %	100 %	0 %	222481327
45	NC_012030	G	6	6	204744	204749	0 %	0 %	100 %	0 %	222481328
46	NC_012030	A	6	6	211702	211707	100 %	0 %	0 %	0 %	222481333
47	NC_012030	C	6	6	218646	218651	0 %	0 %	0 %	100 %	222481342
48	NC_012030	G	6	6	219631	219636	0 %	0 %	100 %	0 %	222481344
49	NC_012030	C	6	6	222393	222398	0 %	0 %	0 %	100 %	222481346
50	NC_012030	G	6	6	229585	229590	0 %	0 %	100 %	0 %	222481353
51	NC_012030	G	6	6	249068	249073	0 %	0 %	100 %	0 %	222481373
52	NC_012030	T	6	6	250616	250621	0 %	100 %	0 %	0 %	222481376
53	NC_012030	T	6	6	251157	251162	0 %	100 %	0 %	0 %	222481378
54	NC_012030	A	6	6	256390	256395	100 %	0 %	0 %	0 %	222481381
55	NC_012030	A	6	6	256525	256530	100 %	0 %	0 %	0 %	222481381
56	NC_012030	C	6	6	259520	259525	0 %	0 %	0 %	100 %	222481384
57	NC_012030	A	7	7	267229	267235	100 %	0 %	0 %	0 %	222481389
58	NC_012030	G	6	6	273236	273241	0 %	0 %	100 %	0 %	222481394
59	NC_012030	T	6	6	273680	273685	0 %	100 %	0 %	0 %	222481394
60	NC_012030	C	6	6	277931	277936	0 %	0 %	0 %	100 %	222481398
61	NC_012030	C	6	6	278944	278949	0 %	0 %	0 %	100 %	222481399
62	NC_012030	G	7	7	281178	281184	0 %	0 %	100 %	0 %	222481401
63	NC_012030	A	6	6	292979	292984	100 %	0 %	0 %	0 %	222481412
64	NC_012030	C	6	6	299294	299299	0 %	0 %	0 %	100 %	222481420
65	NC_012030	G	6	6	300783	300788	0 %	0 %	100 %	0 %	222481421
66	NC_012030	G	6	6	302526	302531	0 %	0 %	100 %	0 %	222481422
67	NC_012030	A	6	6	312756	312761	100 %	0 %	0 %	0 %	222481431
68	NC_012030	A	6	6	313297	313302	100 %	0 %	0 %	0 %	222481433
69	NC_012030	C	6	6	316772	316777	0 %	0 %	0 %	100 %	222481436
70	NC_012030	T	7	7	326568	326574	0 %	100 %	0 %	0 %	222481441
71	NC_012030	A	6	6	329097	329102	100 %	0 %	0 %	0 %	222481443
72	NC_012030	G	6	6	331423	331428	0 %	0 %	100 %	0 %	222481444
73	NC_012030	C	6	6	333500	333505	0 %	0 %	0 %	100 %	222481447
74	NC_012030	C	6	6	335876	335881	0 %	0 %	0 %	100 %	222481448
75	NC_012030	G	6	6	341759	341764	0 %	0 %	100 %	0 %	222481457
76	NC_012030	T	6	6	353624	353629	0 %	100 %	0 %	0 %	222481468
77	NC_012030	G	6	6	365936	365941	0 %	0 %	100 %	0 %	222481476
78	NC_012030	G	6	6	376742	376747	0 %	0 %	100 %	0 %	222481486
79	NC_012030	T	6	6	382519	382524	0 %	100 %	0 %	0 %	222481491
80	NC_012030	C	6	6	383079	383084	0 %	0 %	0 %	100 %	222481491
81	NC_012030	A	6	6	384173	384178	100 %	0 %	0 %	0 %	222481492
82	NC_012030	C	6	6	389686	389691	0 %	0 %	0 %	100 %	222481494
83	NC_012030	T	7	7	398522	398528	0 %	100 %	0 %	0 %	222481499
84	NC_012030	T	6	6	407505	407510	0 %	100 %	0 %	0 %	222481511
85	NC_012030	G	6	6	409363	409368	0 %	0 %	100 %	0 %	222481513
86	NC_012030	T	7	7	411296	411302	0 %	100 %	0 %	0 %	222481517
87	NC_012030	T	6	6	415360	415365	0 %	100 %	0 %	0 %	222481518
88	NC_012030	T	6	6	418217	418222	0 %	100 %	0 %	0 %	222481520
89	NC_012030	A	6	6	424024	424029	100 %	0 %	0 %	0 %	222481524
90	NC_012030	C	7	7	424626	424632	0 %	0 %	0 %	100 %	222481524
91	NC_012030	G	6	6	425981	425986	0 %	0 %	100 %	0 %	222481525
92	NC_012030	G	6	6	426015	426020	0 %	0 %	100 %	0 %	222481525
93	NC_012030	C	6	6	427496	427501	0 %	0 %	0 %	100 %	222481525

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.