MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 56567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012029	CGA	2	6	25	30	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012029	ACT	3	9	235	243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012029	AAC	2	6	244	249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012029	TAA	2	6	297	302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012029	CCA	2	6	342	347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_012029	CCT	2	6	555	560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_012029	GCC	2	6	735	740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_012029	ACA	2	6	823	828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478440
9	NC_012029	CGA	2	6	884	889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
10	NC_012029	CGA	2	6	905	910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
11	NC_012029	CGA	2	6	928	933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
12	NC_012029	GCG	2	6	1003	1008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478440
13	NC_012029	CTC	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478440
14	NC_012029	GTC	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478440
15	NC_012029	CGA	5	15	1055	1069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
16	NC_012029	CGA	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
17	NC_012029	TCC	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478440
18	NC_012029	CCT	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478440
19	NC_012029	CGA	2	6	1192	1197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
20	NC_012029	ACG	2	6	1321	1326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
21	NC_012029	GAA	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478440
22	NC_012029	GCC	3	9	1467	1475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478440
23	NC_012029	GCC	2	6	1485	1490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478440
24	NC_012029	CGA	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
25	NC_012029	CGA	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
26	NC_012029	GGA	2	6	1568	1573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478440
27	NC_012029	CTT	2	6	1616	1621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478440
28	NC_012029	GTT	2	6	1650	1655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478440
29	NC_012029	CGA	2	6	1664	1669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
30	NC_012029	GAC	2	6	1698	1703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
31	NC_012029	ACG	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
32	NC_012029	TCC	2	6	1876	1881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478440
33	NC_012029	GAC	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
34	NC_012029	GCG	2	6	1944	1949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478440
35	NC_012029	CGC	2	6	1952	1957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478440
36	NC_012029	TCG	2	6	2038	2043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478440
37	NC_012029	CGT	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478440
38	NC_012029	GAA	2	6	2159	2164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478440
39	NC_012029	GAG	2	6	2220	2225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478440
40	NC_012029	TCA	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478440
41	NC_012029	CGT	3	9	2303	2311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478440
42	NC_012029	GAG	2	6	2364	2369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478440
43	NC_012029	TCT	2	6	2584	2589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478441
44	NC_012029	ACG	2	6	2652	2657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478441
45	NC_012029	TCG	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478441
46	NC_012029	GTT	2	6	2804	2809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478441
47	NC_012029	TGA	2	6	2821	2826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478441
48	NC_012029	CGT	2	6	2830	2835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478441
49	NC_012029	CGG	2	6	2869	2874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478441
50	NC_012029	TCG	2	6	2889	2894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478441
51	NC_012029	TCC	2	6	2919	2924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478441
52	NC_012029	GTC	2	6	2958	2963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478441
53	NC_012029	GGT	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478441
54	NC_012029	CAC	2	6	2984	2989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478441
55	NC_012029	CGG	2	6	3161	3166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478441
56	NC_012029	CGC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478441
57	NC_012029	GAA	2	6	3297	3302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478441
58	NC_012029	CGC	2	6	3502	3507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478441
59	NC_012029	CGT	2	6	3514	3519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478441
60	NC_012029	CGC	2	6	3520	3525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478441
61	NC_012029	CGT	2	6	3535	3540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478441
62	NC_012029	TCG	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478441
63	NC_012029	CCG	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478441
64	NC_012029	CGC	2	6	3661	3666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_012029	TCC	2	6	3709	3714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_012029	CCG	2	6	3828	3833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478442
67	NC_012029	GTC	2	6	3848	3853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478442
68	NC_012029	GAC	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
69	NC_012029	CAC	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478442
70	NC_012029	TCT	2	6	4130	4135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478442
71	NC_012029	CAG	2	6	4228	4233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
72	NC_012029	CAC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478442
73	NC_012029	ACC	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478442
74	NC_012029	CGG	2	6	4450	4455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478442
75	NC_012029	CGC	2	6	4462	4467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478442
76	NC_012029	GAT	2	6	4468	4473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478442
77	NC_012029	CCA	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478442
78	NC_012029	TCG	2	6	4518	4523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478442
79	NC_012029	AGA	2	6	4528	4533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478442
80	NC_012029	TCG	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478442
81	NC_012029	ATG	2	6	4601	4606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478442
82	NC_012029	GGC	2	6	4708	4713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478442
83	NC_012029	CGA	2	6	4762	4767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
84	NC_012029	CTG	2	6	4838	4843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478442
85	NC_012029	TCG	2	6	4905	4910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478442
86	NC_012029	AGG	2	6	4950	4955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478442
87	NC_012029	TGA	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478442
88	NC_012029	ACG	2	6	4995	5000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
89	NC_012029	ACG	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
90	NC_012029	CAT	2	6	5050	5055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478442
91	NC_012029	ACG	2	6	5064	5069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
92	NC_012029	CGA	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
93	NC_012029	GAG	2	6	5168	5173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478442
94	NC_012029	ACG	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
95	NC_012029	AAG	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478442
96	NC_012029	CGC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478442
97	NC_012029	CGG	2	6	5245	5250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478442
98	NC_012029	GGA	2	6	5269	5274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478442
99	NC_012029	TCG	2	6	5640	5645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478443
100	NC_012029	CGA	2	6	5669	5674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478443
101	NC_012029	TCG	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478443
102	NC_012029	CTC	2	6	5744	5749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478443
103	NC_012029	TCG	2	6	5763	5768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478443
104	NC_012029	GTA	2	6	5834	5839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478443
105	NC_012029	CAC	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478443
106	NC_012029	CGA	2	6	5854	5859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478443
107	NC_012029	GCT	2	6	5875	5880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478443
108	NC_012029	CGT	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478443
109	NC_012029	CGT	3	9	6025	6033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478443
110	NC_012029	CTC	2	6	6059	6064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478443
111	NC_012029	GAA	2	6	6101	6106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478443
112	NC_012029	TCG	2	6	6185	6190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478444
113	NC_012029	CCT	3	9	6234	6242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478444
114	NC_012029	TCC	2	6	6257	6262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478444
115	NC_012029	GCG	2	6	6317	6322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478444
116	NC_012029	CGA	2	6	6327	6332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478444
117	NC_012029	CGA	2	6	6348	6353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478444
118	NC_012029	GCC	2	6	6456	6461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478444
119	NC_012029	GGA	2	6	6624	6629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478444
120	NC_012029	TCG	2	6	6753	6758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478445
121	NC_012029	CTG	2	6	6809	6814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478445
122	NC_012029	GTA	2	6	6848	6853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478445
123	NC_012029	CTC	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478445
124	NC_012029	TCC	2	6	6990	6995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478445
125	NC_012029	TCC	2	6	7005	7010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478445
126	NC_012029	GTC	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478445
127	NC_012029	CGT	2	6	7111	7116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478445
128	NC_012029	CGT	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012029	GCC	2	6	7371	7376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_012029	CGC	2	6	7397	7402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478446
131	NC_012029	CGA	2	6	7530	7535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478446
132	NC_012029	TCG	3	9	7541	7549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478446
133	NC_012029	GGC	2	6	7730	7735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478446
134	NC_012029	GTG	2	6	7736	7741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478446
135	NC_012029	CCG	2	6	7758	7763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478446
136	NC_012029	CGG	2	6	7776	7781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478446
137	NC_012029	CGG	2	6	7785	7790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478446
138	NC_012029	GAC	2	6	7795	7800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478446
139	NC_012029	GTG	2	6	7828	7833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478446
140	NC_012029	GAC	2	6	7858	7863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478446
141	NC_012029	GTC	2	6	7939	7944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478446
142	NC_012029	GTA	2	6	7945	7950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478446
143	NC_012029	CGG	2	6	7968	7973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478446
144	NC_012029	CGA	2	6	7986	7991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478446
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148	NC_012029	TCG	2	6	8243	8248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478446
149	NC_012029	GAG	2	6	8376	8381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012029	TCG	2	6	8467	8472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478447
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152	NC_012029	GGT	2	6	8513	8518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478447
153	NC_012029	CGA	2	6	8537	8542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478447
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158	NC_012029	CGG	2	6	8762	8767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478447
159	NC_012029	CGC	2	6	8811	8816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478447
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184	NC_012029	GTC	2	6	9977	9982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478448
185	NC_012029	ACG	2	6	10098	10103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_012029	CCG	2	6	10370	10375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
189	NC_012029	CGG	2	6	10423	10428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478450
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223	NC_012029	GTC	2	6	12145	12150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478452
224	NC_012029	CGA	2	6	12156	12161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478452
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239	NC_012029	ACT	2	6	12875	12880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478453
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246	NC_012029	TCT	2	6	13080	13085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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255	NC_012029	GGA	2	6	13439	13444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478454
256	NC_012029	GTC	2	6	13449	13454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478454
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381	NC_012029	CGA	2	6	20078	20083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478460
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