MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 5076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012029	CGA	2	6	25	30	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012029	ACT	3	9	235	243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012029	AAC	2	6	244	249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012029	TAA	2	6	297	302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012029	CCA	2	6	342	347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_012029	CCT	2	6	555	560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_012029	GCC	2	6	735	740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_012029	CGC	2	6	3661	3666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_012029	TCC	2	6	3709	3714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_012029	CGT	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012029	GCC	2	6	7371	7376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_012029	GAG	2	6	8376	8381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012029	ACG	2	6	10098	10103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012029	CCG	2	6	10370	10375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_012029	CGC	2	6	11550	11555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_012029	ACT	2	6	11847	11852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012029	GCC	2	6	11857	11862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_012029	CGG	2	6	11978	11983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012029	CTT	2	6	13059	13064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012029	TCG	2	6	13070	13075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012029	TCT	2	6	13080	13085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012029	CGC	2	6	13118	13123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_012029	ATT	2	6	14176	14181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012029	CGA	2	6	14270	14275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012029	GAC	2	6	14345	14350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012029	GAG	2	6	14384	14389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012029	CGA	2	6	14740	14745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012029	CGA	2	6	14764	14769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012029	GTG	2	6	14898	14903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012029	CGC	2	6	14948	14953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_012029	CGC	2	6	14961	14966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_012029	TGC	2	6	14979	14984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012029	TCG	2	6	15027	15032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012029	CGC	2	6	15063	15068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012029	CGC	2	6	15101	15106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_012029	CGG	2	6	15428	15433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012029	CCG	2	6	19234	19239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_012029	CCG	2	6	19241	19246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_012029	GTT	2	6	19582	19587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012029	TCC	2	6	19678	19683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_012029	TTA	2	6	19792	19797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012029	GGA	2	6	19821	19826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012029	GAA	2	6	20302	20307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012029	AAT	2	6	20852	20857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012029	GCA	2	6	20925	20930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012029	GCC	2	6	21054	21059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_012029	GGA	2	6	21480	21485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012029	TAA	2	6	21536	21541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012029	TGA	2	6	21554	21559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012029	GCC	2	6	21591	21596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012029	CAG	2	6	21662	21667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012029	CCG	2	6	21699	21704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_012029	GGA	2	6	21715	21720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012029	GTA	2	6	21885	21890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012029	CCG	2	6	22152	22157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_012029	CGA	2	6	22168	22173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012029	CCT	2	6	22249	22254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_012029	AGG	2	6	22260	22265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012029	GAC	3	9	22353	22361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012029	GAC	2	6	22434	22439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012029	GAA	2	6	22665	22670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012029	GTC	2	6	22775	22780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012029	CTC	2	6	23009	23014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_012029	GAG	2	6	23141	23146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012029	TCC	2	6	23150	23155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_012029	CGT	2	6	23178	23183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012029	GCA	2	6	23275	23280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012029	GAG	2	6	23555	23560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012029	AAC	2	6	23647	23652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012029	GGT	2	6	23700	23705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012029	AGC	2	6	23740	23745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012029	ACC	2	6	23818	23823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_012029	AGC	2	6	23938	23943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012029	GAA	2	6	24336	24341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012029	TAA	2	6	24396	24401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012029	CGG	2	6	24504	24509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012029	GTA	2	6	24537	24542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012029	GCA	2	6	24714	24719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012029	ACA	2	6	24766	24771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012029	TAC	2	6	24778	24783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012029	GAG	2	6	24812	24817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012029	ATC	2	6	24885	24890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012029	GTC	2	6	25052	25057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012029	GTT	2	6	25146	25151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012029	AGG	2	6	25162	25167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012029	CGT	2	6	25187	25192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012029	GCT	2	6	25204	25209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012029	AAG	2	6	25373	25378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012029	AGA	2	6	25398	25403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012029	GAA	2	6	25551	25556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012029	GGC	2	6	25629	25634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012029	CCA	2	6	25684	25689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_012029	CGC	2	6	25737	25742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_012029	CGG	2	6	25826	25831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012029	GCC	2	6	25933	25938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_012029	GGT	2	6	26006	26011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012029	CTT	2	6	26015	26020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012029	GCG	2	6	26849	26854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012029	CGA	2	6	26910	26915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012029	TGC	2	6	26977	26982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012029	GCC	2	6	27003	27008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_012029	TCA	2	6	28116	28121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012029	CGC	2	6	28578	28583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_012029	CAG	2	6	28648	28653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012029	CGG	2	6	28660	28665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012029	TCC	2	6	30099	30104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_012029	GCG	2	6	38102	38107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012029	GCT	2	6	38183	38188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012029	ACG	2	6	38206	38211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012029	GCC	2	6	38386	38391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_012029	CGC	2	6	38413	38418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_012029	CGC	2	6	39150	39155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_012029	CGC	2	6	40089	40094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_012029	ACA	2	6	40146	40151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012029	ACC	2	6	40820	40825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_012029	GCC	2	6	41460	41465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_012029	CTC	2	6	41472	41477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_012029	TCC	2	6	41484	41489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_012029	CCT	2	6	41894	41899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_012029	CTC	2	6	41905	41910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_012029	CCG	2	6	41911	41916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_012029	CGA	2	6	41920	41925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012029	CGT	2	6	42383	42388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012029	CGA	2	6	44340	44345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012029	CCG	2	6	45430	45435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_012029	CCG	2	6	47050	47055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_012029	ATT	2	6	47057	47062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012029	CGT	2	6	47162	47167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012029	CGG	2	6	47614	47619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012029	GCG	2	6	47651	47656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012029	CGT	2	6	48940	48945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012029	CGA	2	6	48949	48954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012029	TCG	2	6	49338	49343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012029	CGG	2	6	49361	49366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012029	CGA	2	6	49367	49372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012029	TCG	2	6	49376	49381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012029	TTG	2	6	49431	49436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012029	GTG	2	6	49747	49752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012029	TAC	2	6	49770	49775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012029	CCG	2	6	49882	49887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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