MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012028	TATACA	2	12	2462	2473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012028	GCTGTC	2	12	2698	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012028	TCGTAC	2	12	26754	26765	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012028	CGACGC	2	12	54675	54686	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012028	GCACAG	2	12	58397	58408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012028	GCTGTC	2	12	77955	77966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012028	GCTGTC	2	12	87194	87205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012028	TCGCCC	2	12	95204	95215	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_012028	GCCCTC	2	12	109370	109381	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_012028	TCTGGA	2	12	117244	117255	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012028	GCGTCG	2	12	133137	133148	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012028	CCGGAT	2	12	135703	135714	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012028	GCTGTC	2	12	138497	138508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012028	TGACGC	2	12	165672	165683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012028	ATCGAT	2	12	170054	170065	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012028	GCTGTC	2	12	170188	170199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012028	GCTCAC	2	12	206795	206806	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012028	GTTCAC	2	12	212833	212844	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012028	ACGTCG	2	12	230168	230179	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012028	GACCAC	2	12	290374	290385	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012028	TCGCGT	2	12	293047	293058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012028	CCATCG	2	12	302003	302014	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012028	CTTTCG	2	12	308854	308865	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012028	GCTGTC	2	12	326707	326718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012028	GCTGTC	2	12	356148	356159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012028	GCCCTC	2	12	368057	368068	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_012028	CAATCA	2	12	386235	386246	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012028	ACGGCT	2	12	430912	430923	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012028	AGGACC	2	12	452690	452701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012028	GCTGTC	2	12	456460	456471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012028	CCGTCG	2	12	469748	469759	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012028	GCCAGC	2	12	484332	484343	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012028	TTCCGG	2	12	486143	486154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012028	AACACG	2	12	509430	509441	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.