MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 1499

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012028	AGTA	2	8	5	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012028	ATGT	2	8	57	64	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012028	TTAC	2	8	73	80	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012028	GATT	2	8	782	789	25 %	50 %	25 %	0 %	222475683
5	NC_012028	ATTT	2	8	1368	1375	25 %	75 %	0 %	0 %	222475683
6	NC_012028	CTAT	2	8	1965	1972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012028	CAGC	2	8	2370	2377	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012028	CGCT	2	8	2521	2528	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012028	ACGG	2	8	2679	2686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012028	CACT	2	8	2743	2750	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012028	TCGG	2	8	2763	2770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012028	CGCC	2	8	2898	2905	0 %	0 %	25 %	75 %	222475684
13	NC_012028	GTAC	2	8	3167	3174	25 %	25 %	25 %	25 %	222475684
14	NC_012028	AGCA	2	8	3947	3954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012028	CTAA	2	8	3961	3968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012028	AACT	2	8	4527	4534	50 %	25 %	0 %	25 %	222475686
17	NC_012028	GTAA	2	8	5312	5319	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012028	GAGC	2	8	6592	6599	25 %	0 %	50 %	25 %	222475687
19	NC_012028	AGTC	2	8	6744	6751	25 %	25 %	25 %	25 %	222475687
20	NC_012028	CTAA	2	8	7020	7027	50 %	25 %	0 %	25 %	222475687
21	NC_012028	GATG	2	8	7350	7357	25 %	25 %	50 %	0 %	222475688
22	NC_012028	GACC	2	8	7891	7898	25 %	0 %	25 %	50 %	222475689
23	NC_012028	ACTG	2	8	9838	9845	25 %	25 %	25 %	25 %	222475691
24	NC_012028	TGGA	2	8	10045	10052	25 %	25 %	50 %	0 %	222475691
25	NC_012028	TGCC	2	8	10107	10114	0 %	25 %	25 %	50 %	222475691
26	NC_012028	GTCA	2	8	10249	10256	25 %	25 %	25 %	25 %	222475691
27	NC_012028	GTCG	2	8	10399	10406	0 %	25 %	50 %	25 %	222475692
28	NC_012028	GTAC	2	8	10516	10523	25 %	25 %	25 %	25 %	222475692
29	NC_012028	TTCT	2	8	10739	10746	0 %	75 %	0 %	25 %	222475692
30	NC_012028	AGTT	2	8	11354	11361	25 %	50 %	25 %	0 %	222475692
31	NC_012028	CATC	2	8	11767	11774	25 %	25 %	0 %	50 %	222475692
32	NC_012028	CACT	2	8	12086	12093	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012028	TCGA	2	8	12094	12101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012028	CACG	2	8	13845	13852	25 %	0 %	25 %	50 %	222475694
35	NC_012028	ACGA	2	8	14287	14294	50 %	0 %	25 %	25 %	222475694
36	NC_012028	ACGA	2	8	14353	14360	50 %	0 %	25 %	25 %	222475694
37	NC_012028	GAAC	2	8	14574	14581	50 %	0 %	25 %	25 %	222475694
38	NC_012028	TCGG	2	8	15149	15156	0 %	25 %	50 %	25 %	222475694
39	NC_012028	CTCG	2	8	15157	15164	0 %	25 %	25 %	50 %	222475694
40	NC_012028	GCCT	2	8	16412	16419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012028	CACC	2	8	16561	16568	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_012028	GACA	2	8	16826	16833	50 %	0 %	25 %	25 %	222475696
43	NC_012028	TGAC	2	8	16978	16985	25 %	25 %	25 %	25 %	222475696
44	NC_012028	GTTT	2	8	17030	17037	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012028	CGGA	2	8	17176	17183	25 %	0 %	50 %	25 %	222475697
46	NC_012028	GACC	2	8	17469	17476	25 %	0 %	25 %	50 %	222475697
47	NC_012028	GTCG	2	8	17910	17917	0 %	25 %	50 %	25 %	222475697
48	NC_012028	AATG	2	8	17953	17960	50 %	25 %	25 %	0 %	222475697
49	NC_012028	ACTC	2	8	18222	18229	25 %	25 %	0 %	50 %	222475697
50	NC_012028	GGTG	2	8	18638	18645	0 %	25 %	75 %	0 %	222475697
51	NC_012028	AGAA	2	8	18659	18666	75 %	0 %	25 %	0 %	222475697
52	NC_012028	CTCC	2	8	19191	19198	0 %	25 %	0 %	75 %	222475697
53	NC_012028	CGCA	2	8	19231	19238	25 %	0 %	25 %	50 %	222475697
54	NC_012028	GAAG	2	8	19359	19366	50 %	0 %	50 %	0 %	222475697
55	NC_012028	TTGC	2	8	19899	19906	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012028	GATC	2	8	20242	20249	25 %	25 %	25 %	25 %	222475698
57	NC_012028	ACGA	2	8	20281	20288	50 %	0 %	25 %	25 %	222475698
58	NC_012028	GAAC	3	12	20695	20706	50 %	0 %	25 %	25 %	222475698
59	NC_012028	GCGA	2	8	21267	21274	25 %	0 %	50 %	25 %	222475699
60	NC_012028	GATT	2	8	21451	21458	25 %	50 %	25 %	0 %	222475700
61	NC_012028	CGAC	2	8	21460	21467	25 %	0 %	25 %	50 %	222475700
62	NC_012028	CATC	2	8	21692	21699	25 %	25 %	0 %	50 %	222475700
63	NC_012028	TCCA	2	8	21723	21730	25 %	25 %	0 %	50 %	222475700
64	NC_012028	GTTC	2	8	22173	22180	0 %	50 %	25 %	25 %	222475701
65	NC_012028	GTTT	2	8	22339	22346	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012028	ATCC	2	8	22477	22484	25 %	25 %	0 %	50 %	222475702
67	NC_012028	ATCC	2	8	22882	22889	25 %	25 %	0 %	50 %	222475702
68	NC_012028	TTCC	2	8	23024	23031	0 %	50 %	0 %	50 %	222475702
69	NC_012028	GCCC	2	8	23112	23119	0 %	0 %	25 %	75 %	222475702
70	NC_012028	ATTG	2	8	23284	23291	25 %	50 %	25 %	0 %	222475702
71	NC_012028	GGTG	2	8	23344	23351	0 %	25 %	75 %	0 %	222475702
72	NC_012028	AATT	2	8	23446	23453	50 %	50 %	0 %	0 %	222475702
73	NC_012028	CGTT	2	8	24068	24075	0 %	50 %	25 %	25 %	222475702
74	NC_012028	CTGT	2	8	24189	24196	0 %	50 %	25 %	25 %	222475702
75	NC_012028	GTGG	2	8	24277	24284	0 %	25 %	75 %	0 %	222475702
76	NC_012028	ACCC	2	8	25211	25218	25 %	0 %	0 %	75 %	222475703
77	NC_012028	TCTG	2	8	25261	25268	0 %	50 %	25 %	25 %	222475703
78	NC_012028	GATG	2	8	26138	26145	25 %	25 %	50 %	0 %	222475703
79	NC_012028	GTCT	2	8	26744	26751	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012028	TGAT	2	8	26868	26875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012028	CGTG	2	8	26941	26948	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012028	GTTC	2	8	27040	27047	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012028	TTCG	2	8	27276	27283	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012028	CGAG	2	8	27390	27397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012028	TCAA	2	8	27645	27652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012028	CGAA	2	8	28286	28293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012028	ACGA	2	8	28454	28461	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012028	CGAA	2	8	28673	28680	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012028	GATT	2	8	28879	28886	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012028	AAAC	2	8	29189	29196	75 %	0 %	0 %	25 %	222475704
91	NC_012028	TGGT	2	8	30219	30226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012028	ATGG	2	8	30856	30863	25 %	25 %	50 %	0 %	222475706
93	NC_012028	GCTG	2	8	31030	31037	0 %	25 %	50 %	25 %	222475706
94	NC_012028	TCGC	2	8	31270	31277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012028	ACCG	2	8	31424	31431	25 %	0 %	25 %	50 %	222475707
96	NC_012028	CATG	2	8	32195	32202	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012028	CGAA	2	8	32281	32288	50 %	0 %	25 %	25 %	222475709
98	NC_012028	CGAG	2	8	32686	32693	25 %	0 %	50 %	25 %	222475709
99	NC_012028	GACA	2	8	33051	33058	50 %	0 %	25 %	25 %	222475710
100	NC_012028	CAAT	2	8	33060	33067	50 %	25 %	0 %	25 %	222475710
101	NC_012028	CTGC	2	8	33235	33242	0 %	25 %	25 %	50 %	222475710
102	NC_012028	TTGC	2	8	33689	33696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012028	ATGA	2	8	33981	33988	50 %	25 %	25 %	0 %	222475711
104	NC_012028	AGAC	2	8	36048	36055	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012028	TTAG	2	8	36080	36087	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012028	TGCT	2	8	36094	36101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012028	GTAC	2	8	36874	36881	25 %	25 %	25 %	25 %	222475715
108	NC_012028	GGCG	2	8	37143	37150	0 %	0 %	75 %	25 %	222475715
109	NC_012028	GAGT	2	8	37297	37304	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012028	TCCG	2	8	37361	37368	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_012028	AAGT	2	8	37558	37565	50 %	25 %	25 %	0 %	222475716
112	NC_012028	GCTT	2	8	37859	37866	0 %	50 %	25 %	25 %	222475716
113	NC_012028	ATCC	2	8	39055	39062	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012028	GCAT	2	8	39067	39074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012028	GGTG	2	8	39091	39098	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012028	ACTG	2	8	39529	39536	25 %	25 %	25 %	25 %	222475718
117	NC_012028	TGCG	2	8	39576	39583	0 %	25 %	50 %	25 %	222475718
118	NC_012028	GCAG	2	8	40740	40747	25 %	0 %	50 %	25 %	222475719
119	NC_012028	CGCT	2	8	40997	41004	0 %	25 %	25 %	50 %	222475719
120	NC_012028	ACGA	2	8	41228	41235	50 %	0 %	25 %	25 %	222475719
121	NC_012028	CGTT	2	8	41396	41403	0 %	50 %	25 %	25 %	222475719
122	NC_012028	GAAA	2	8	41508	41515	75 %	0 %	25 %	0 %	222475719
123	NC_012028	GCGA	2	8	42148	42155	25 %	0 %	50 %	25 %	222475719
124	NC_012028	ATCG	2	8	42504	42511	25 %	25 %	25 %	25 %	222475719
125	NC_012028	GCAA	2	8	42647	42654	50 %	0 %	25 %	25 %	222475719
126	NC_012028	TTCC	2	8	43446	43453	0 %	50 %	0 %	50 %	222475720
127	NC_012028	CTAC	2	8	44319	44326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012028	GCGA	2	8	44398	44405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012028	GCAA	2	8	44961	44968	50 %	0 %	25 %	25 %	222475721
130	NC_012028	CGGT	2	8	44985	44992	0 %	25 %	50 %	25 %	222475721
131	NC_012028	GGGT	2	8	45369	45376	0 %	25 %	75 %	0 %	222475721
132	NC_012028	ACGC	2	8	46187	46194	25 %	0 %	25 %	50 %	222475721
133	NC_012028	AACG	2	8	46214	46221	50 %	0 %	25 %	25 %	222475721
134	NC_012028	CTCC	2	8	46867	46874	0 %	25 %	0 %	75 %	222475722
135	NC_012028	CGCC	2	8	48258	48265	0 %	0 %	25 %	75 %	222475723
136	NC_012028	TCCA	2	8	48637	48644	25 %	25 %	0 %	50 %	222475723
137	NC_012028	CCGT	2	8	48777	48784	0 %	25 %	25 %	50 %	222475723
138	NC_012028	GATT	2	8	49657	49664	25 %	50 %	25 %	0 %	222475723
139	NC_012028	GAGC	2	8	49673	49680	25 %	0 %	50 %	25 %	222475723
140	NC_012028	GCAG	2	8	50066	50073	25 %	0 %	50 %	25 %	222475723
141	NC_012028	ACGA	2	8	50279	50286	50 %	0 %	25 %	25 %	222475723
142	NC_012028	CTTG	2	8	50385	50392	0 %	50 %	25 %	25 %	222475723
143	NC_012028	GCCT	2	8	50467	50474	0 %	25 %	25 %	50 %	222475723
144	NC_012028	TGCG	2	8	50507	50514	0 %	25 %	50 %	25 %	222475723
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