MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 1124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012028	GATT	2	8	782	789	25 %	50 %	25 %	0 %	222475683
2	NC_012028	ATTT	2	8	1368	1375	25 %	75 %	0 %	0 %	222475683
3	NC_012028	CGCC	2	8	2898	2905	0 %	0 %	25 %	75 %	222475684
4	NC_012028	GTAC	2	8	3167	3174	25 %	25 %	25 %	25 %	222475684
5	NC_012028	AACT	2	8	4527	4534	50 %	25 %	0 %	25 %	222475686
6	NC_012028	GAGC	2	8	6592	6599	25 %	0 %	50 %	25 %	222475687
7	NC_012028	AGTC	2	8	6744	6751	25 %	25 %	25 %	25 %	222475687
8	NC_012028	CTAA	2	8	7020	7027	50 %	25 %	0 %	25 %	222475687
9	NC_012028	GATG	2	8	7350	7357	25 %	25 %	50 %	0 %	222475688
10	NC_012028	GACC	2	8	7891	7898	25 %	0 %	25 %	50 %	222475689
11	NC_012028	ACTG	2	8	9838	9845	25 %	25 %	25 %	25 %	222475691
12	NC_012028	TGGA	2	8	10045	10052	25 %	25 %	50 %	0 %	222475691
13	NC_012028	TGCC	2	8	10107	10114	0 %	25 %	25 %	50 %	222475691
14	NC_012028	GTCA	2	8	10249	10256	25 %	25 %	25 %	25 %	222475691
15	NC_012028	GTCG	2	8	10399	10406	0 %	25 %	50 %	25 %	222475692
16	NC_012028	GTAC	2	8	10516	10523	25 %	25 %	25 %	25 %	222475692
17	NC_012028	TTCT	2	8	10739	10746	0 %	75 %	0 %	25 %	222475692
18	NC_012028	AGTT	2	8	11354	11361	25 %	50 %	25 %	0 %	222475692
19	NC_012028	CATC	2	8	11767	11774	25 %	25 %	0 %	50 %	222475692
20	NC_012028	CACG	2	8	13845	13852	25 %	0 %	25 %	50 %	222475694
21	NC_012028	ACGA	2	8	14287	14294	50 %	0 %	25 %	25 %	222475694
22	NC_012028	ACGA	2	8	14353	14360	50 %	0 %	25 %	25 %	222475694
23	NC_012028	GAAC	2	8	14574	14581	50 %	0 %	25 %	25 %	222475694
24	NC_012028	TCGG	2	8	15149	15156	0 %	25 %	50 %	25 %	222475694
25	NC_012028	CTCG	2	8	15157	15164	0 %	25 %	25 %	50 %	222475694
26	NC_012028	GACA	2	8	16826	16833	50 %	0 %	25 %	25 %	222475696
27	NC_012028	TGAC	2	8	16978	16985	25 %	25 %	25 %	25 %	222475696
28	NC_012028	CGGA	2	8	17176	17183	25 %	0 %	50 %	25 %	222475697
29	NC_012028	GACC	2	8	17469	17476	25 %	0 %	25 %	50 %	222475697
30	NC_012028	GTCG	2	8	17910	17917	0 %	25 %	50 %	25 %	222475697
31	NC_012028	AATG	2	8	17953	17960	50 %	25 %	25 %	0 %	222475697
32	NC_012028	ACTC	2	8	18222	18229	25 %	25 %	0 %	50 %	222475697
33	NC_012028	GGTG	2	8	18638	18645	0 %	25 %	75 %	0 %	222475697
34	NC_012028	AGAA	2	8	18659	18666	75 %	0 %	25 %	0 %	222475697
35	NC_012028	CTCC	2	8	19191	19198	0 %	25 %	0 %	75 %	222475697
36	NC_012028	CGCA	2	8	19231	19238	25 %	0 %	25 %	50 %	222475697
37	NC_012028	GAAG	2	8	19359	19366	50 %	0 %	50 %	0 %	222475697
38	NC_012028	GATC	2	8	20242	20249	25 %	25 %	25 %	25 %	222475698
39	NC_012028	ACGA	2	8	20281	20288	50 %	0 %	25 %	25 %	222475698
40	NC_012028	GAAC	3	12	20695	20706	50 %	0 %	25 %	25 %	222475698
41	NC_012028	GCGA	2	8	21267	21274	25 %	0 %	50 %	25 %	222475699
42	NC_012028	GATT	2	8	21451	21458	25 %	50 %	25 %	0 %	222475700
43	NC_012028	CGAC	2	8	21460	21467	25 %	0 %	25 %	50 %	222475700
44	NC_012028	CATC	2	8	21692	21699	25 %	25 %	0 %	50 %	222475700
45	NC_012028	TCCA	2	8	21723	21730	25 %	25 %	0 %	50 %	222475700
46	NC_012028	GTTC	2	8	22173	22180	0 %	50 %	25 %	25 %	222475701
47	NC_012028	ATCC	2	8	22477	22484	25 %	25 %	0 %	50 %	222475702
48	NC_012028	ATCC	2	8	22882	22889	25 %	25 %	0 %	50 %	222475702
49	NC_012028	TTCC	2	8	23024	23031	0 %	50 %	0 %	50 %	222475702
50	NC_012028	GCCC	2	8	23112	23119	0 %	0 %	25 %	75 %	222475702
51	NC_012028	ATTG	2	8	23284	23291	25 %	50 %	25 %	0 %	222475702
52	NC_012028	GGTG	2	8	23344	23351	0 %	25 %	75 %	0 %	222475702
53	NC_012028	AATT	2	8	23446	23453	50 %	50 %	0 %	0 %	222475702
54	NC_012028	CGTT	2	8	24068	24075	0 %	50 %	25 %	25 %	222475702
55	NC_012028	CTGT	2	8	24189	24196	0 %	50 %	25 %	25 %	222475702
56	NC_012028	GTGG	2	8	24277	24284	0 %	25 %	75 %	0 %	222475702
57	NC_012028	ACCC	2	8	25211	25218	25 %	0 %	0 %	75 %	222475703
58	NC_012028	TCTG	2	8	25261	25268	0 %	50 %	25 %	25 %	222475703
59	NC_012028	GATG	2	8	26138	26145	25 %	25 %	50 %	0 %	222475703
60	NC_012028	AAAC	2	8	29189	29196	75 %	0 %	0 %	25 %	222475704
61	NC_012028	ATGG	2	8	30856	30863	25 %	25 %	50 %	0 %	222475706
62	NC_012028	GCTG	2	8	31030	31037	0 %	25 %	50 %	25 %	222475706
63	NC_012028	ACCG	2	8	31424	31431	25 %	0 %	25 %	50 %	222475707
64	NC_012028	CGAA	2	8	32281	32288	50 %	0 %	25 %	25 %	222475709
65	NC_012028	CGAG	2	8	32686	32693	25 %	0 %	50 %	25 %	222475709
66	NC_012028	GACA	2	8	33051	33058	50 %	0 %	25 %	25 %	222475710
67	NC_012028	CAAT	2	8	33060	33067	50 %	25 %	0 %	25 %	222475710
68	NC_012028	CTGC	2	8	33235	33242	0 %	25 %	25 %	50 %	222475710
69	NC_012028	ATGA	2	8	33981	33988	50 %	25 %	25 %	0 %	222475711
70	NC_012028	GTAC	2	8	36874	36881	25 %	25 %	25 %	25 %	222475715
71	NC_012028	GGCG	2	8	37143	37150	0 %	0 %	75 %	25 %	222475715
72	NC_012028	AAGT	2	8	37558	37565	50 %	25 %	25 %	0 %	222475716
73	NC_012028	GCTT	2	8	37859	37866	0 %	50 %	25 %	25 %	222475716
74	NC_012028	ACTG	2	8	39529	39536	25 %	25 %	25 %	25 %	222475718
75	NC_012028	TGCG	2	8	39576	39583	0 %	25 %	50 %	25 %	222475718
76	NC_012028	GCAG	2	8	40740	40747	25 %	0 %	50 %	25 %	222475719
77	NC_012028	CGCT	2	8	40997	41004	0 %	25 %	25 %	50 %	222475719
78	NC_012028	ACGA	2	8	41228	41235	50 %	0 %	25 %	25 %	222475719
79	NC_012028	CGTT	2	8	41396	41403	0 %	50 %	25 %	25 %	222475719
80	NC_012028	GAAA	2	8	41508	41515	75 %	0 %	25 %	0 %	222475719
81	NC_012028	GCGA	2	8	42148	42155	25 %	0 %	50 %	25 %	222475719
82	NC_012028	ATCG	2	8	42504	42511	25 %	25 %	25 %	25 %	222475719
83	NC_012028	GCAA	2	8	42647	42654	50 %	0 %	25 %	25 %	222475719
84	NC_012028	TTCC	2	8	43446	43453	0 %	50 %	0 %	50 %	222475720
85	NC_012028	GCAA	2	8	44961	44968	50 %	0 %	25 %	25 %	222475721
86	NC_012028	CGGT	2	8	44985	44992	0 %	25 %	50 %	25 %	222475721
87	NC_012028	GGGT	2	8	45369	45376	0 %	25 %	75 %	0 %	222475721
88	NC_012028	ACGC	2	8	46187	46194	25 %	0 %	25 %	50 %	222475721
89	NC_012028	AACG	2	8	46214	46221	50 %	0 %	25 %	25 %	222475721
90	NC_012028	CTCC	2	8	46867	46874	0 %	25 %	0 %	75 %	222475722
91	NC_012028	CGCC	2	8	48258	48265	0 %	0 %	25 %	75 %	222475723
92	NC_012028	TCCA	2	8	48637	48644	25 %	25 %	0 %	50 %	222475723
93	NC_012028	CCGT	2	8	48777	48784	0 %	25 %	25 %	50 %	222475723
94	NC_012028	GATT	2	8	49657	49664	25 %	50 %	25 %	0 %	222475723
95	NC_012028	GAGC	2	8	49673	49680	25 %	0 %	50 %	25 %	222475723
96	NC_012028	GCAG	2	8	50066	50073	25 %	0 %	50 %	25 %	222475723
97	NC_012028	ACGA	2	8	50279	50286	50 %	0 %	25 %	25 %	222475723
98	NC_012028	CTTG	2	8	50385	50392	0 %	50 %	25 %	25 %	222475723
99	NC_012028	GCCT	2	8	50467	50474	0 %	25 %	25 %	50 %	222475723
100	NC_012028	TGCG	2	8	50507	50514	0 %	25 %	50 %	25 %	222475723
101	NC_012028	TTCT	2	8	50773	50780	0 %	75 %	0 %	25 %	222475724
102	NC_012028	GGCG	2	8	51069	51076	0 %	0 %	75 %	25 %	222475724
103	NC_012028	ACGG	2	8	51189	51196	25 %	0 %	50 %	25 %	222475724
104	NC_012028	ATCC	2	8	51667	51674	25 %	25 %	0 %	50 %	222475724
105	NC_012028	CCGA	2	8	51742	51749	25 %	0 %	25 %	50 %	222475724
106	NC_012028	ATGA	2	8	51814	51821	50 %	25 %	25 %	0 %	222475724
107	NC_012028	TGCT	2	8	52391	52398	0 %	50 %	25 %	25 %	222475725
108	NC_012028	GGAC	2	8	53510	53517	25 %	0 %	50 %	25 %	222475725
109	NC_012028	CGTC	2	8	53711	53718	0 %	25 %	25 %	50 %	222475725
110	NC_012028	AGGT	2	8	55694	55701	25 %	25 %	50 %	0 %	222475726
111	NC_012028	TCGG	2	8	56910	56917	0 %	25 %	50 %	25 %	222475727
112	NC_012028	CGTG	2	8	57014	57021	0 %	25 %	50 %	25 %	222475727
113	NC_012028	AAAC	2	8	57619	57626	75 %	0 %	0 %	25 %	222475728
114	NC_012028	TGAC	2	8	58840	58847	25 %	25 %	25 %	25 %	222475729
115	NC_012028	TTCT	2	8	59590	59597	0 %	75 %	0 %	25 %	222475730
116	NC_012028	ACGG	2	8	59926	59933	25 %	0 %	50 %	25 %	222475731
117	NC_012028	CTCG	2	8	60715	60722	0 %	25 %	25 %	50 %	222475732
118	NC_012028	GAAA	2	8	60773	60780	75 %	0 %	25 %	0 %	222475732
119	NC_012028	GTCA	2	8	60809	60816	25 %	25 %	25 %	25 %	222475732
120	NC_012028	GAGC	2	8	60963	60970	25 %	0 %	50 %	25 %	222475732
121	NC_012028	TGGT	2	8	61280	61287	0 %	50 %	50 %	0 %	222475733
122	NC_012028	ACGG	2	8	62183	62190	25 %	0 %	50 %	25 %	222475733
123	NC_012028	TTGA	2	8	62232	62239	25 %	50 %	25 %	0 %	222475733
124	NC_012028	CATT	2	8	63568	63575	25 %	50 %	0 %	25 %	222475734
125	NC_012028	AAAG	2	8	65076	65083	75 %	0 %	25 %	0 %	222475735
126	NC_012028	CCAG	2	8	65388	65395	25 %	0 %	25 %	50 %	222475735
127	NC_012028	TTGC	2	8	66045	66052	0 %	50 %	25 %	25 %	222475736
128	NC_012028	CGAT	2	8	66610	66617	25 %	25 %	25 %	25 %	222475736
129	NC_012028	TGGA	2	8	67343	67350	25 %	25 %	50 %	0 %	222475737
130	NC_012028	GATG	2	8	67459	67466	25 %	25 %	50 %	0 %	222475737
131	NC_012028	TCGT	2	8	68564	68571	0 %	50 %	25 %	25 %	222475739
132	NC_012028	TCGG	2	8	69464	69471	0 %	25 %	50 %	25 %	222475740
133	NC_012028	ATGA	2	8	70675	70682	50 %	25 %	25 %	0 %	222475742
134	NC_012028	CTTT	2	8	70754	70761	0 %	75 %	0 %	25 %	222475742
135	NC_012028	TTCC	2	8	70837	70844	0 %	50 %	0 %	50 %	222475742
136	NC_012028	CCTC	2	8	70940	70947	0 %	25 %	0 %	75 %	222475742
137	NC_012028	GCCT	2	8	71909	71916	0 %	25 %	25 %	50 %	222475743
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