MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 7049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012028	GAA	2	6	334	339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475683
2	NC_012028	TGT	3	9	369	377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475683
3	NC_012028	GAA	2	6	637	642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475683
4	NC_012028	ATA	2	6	689	694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222475683
5	NC_012028	CTA	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475683
6	NC_012028	GCA	3	9	967	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475683
7	NC_012028	ATT	2	6	1124	1129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222475683
8	NC_012028	GCA	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475683
9	NC_012028	CAA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475683
10	NC_012028	ATC	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475683
11	NC_012028	CTC	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475683
12	NC_012028	ACG	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475683
13	NC_012028	GAC	2	6	1387	1392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475683
14	NC_012028	ACC	2	6	1503	1508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475683
15	NC_012028	GTC	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475684
16	NC_012028	TCG	2	6	2849	2854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475684
17	NC_012028	CCA	3	9	2882	2890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475684
18	NC_012028	CGG	2	6	2907	2912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475684
19	NC_012028	CAC	3	9	2969	2977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475684
20	NC_012028	CAG	2	6	2981	2986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475684
21	NC_012028	AGT	2	6	3070	3075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475684
22	NC_012028	GTG	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475684
23	NC_012028	GCG	2	6	3117	3122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475684
24	NC_012028	GAT	2	6	3296	3301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475684
25	NC_012028	AGC	2	6	3333	3338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475684
26	NC_012028	GAA	2	6	3416	3421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475684
27	NC_012028	ACT	2	6	3434	3439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475684
28	NC_012028	TTC	2	6	3489	3494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475684
29	NC_012028	GTC	2	6	3572	3577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475684
30	NC_012028	GTA	2	6	3587	3592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475684
31	NC_012028	CGA	2	6	3796	3801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475684
32	NC_012028	CAG	2	6	3820	3825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475684
33	NC_012028	AAG	2	6	3890	3895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475684
34	NC_012028	ATG	3	9	4001	4009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475685
35	NC_012028	CTC	2	6	4082	4087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475685
36	NC_012028	GAC	2	6	4105	4110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475685
37	NC_012028	CGA	2	6	4139	4144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475685
38	NC_012028	ATC	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475686
39	NC_012028	CAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475686
40	NC_012028	CCT	2	6	4257	4262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475686
41	NC_012028	ATC	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475686
42	NC_012028	GCG	2	6	4384	4389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475686
43	NC_012028	TGC	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475686
44	NC_012028	GAA	2	6	4441	4446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475686
45	NC_012028	CGT	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475686
46	NC_012028	CGA	2	6	4722	4727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475686
47	NC_012028	CGG	2	6	4845	4850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475686
48	NC_012028	CAG	2	6	4969	4974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475686
49	NC_012028	TCC	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475686
50	NC_012028	ACG	2	6	5197	5202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475686
51	NC_012028	GAC	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475686
52	NC_012028	GTG	2	6	5250	5255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475686
53	NC_012028	AGC	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475687
54	NC_012028	CGA	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475687
55	NC_012028	CAG	2	6	6030	6035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475687
56	NC_012028	CGT	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475687
57	NC_012028	GAA	2	6	6206	6211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475687
58	NC_012028	AGA	2	6	6249	6254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475687
59	NC_012028	CGA	2	6	6370	6375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475687
60	NC_012028	CAT	2	6	6448	6453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475687
61	NC_012028	GCT	2	6	6460	6465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475687
62	NC_012028	TTG	2	6	6603	6608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475687
63	NC_012028	CGA	2	6	6652	6657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475687
64	NC_012028	TGA	2	6	6676	6681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475687
65	NC_012028	GAT	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475687
66	NC_012028	AAC	2	6	6836	6841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475687
67	NC_012028	TCC	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475687
68	NC_012028	GTG	2	6	6966	6971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475687
69	NC_012028	AGC	2	6	7011	7016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475687
70	NC_012028	TCC	2	6	7103	7108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475688
71	NC_012028	AGG	2	6	7142	7147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475688
72	NC_012028	CGA	2	6	7153	7158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475688
73	NC_012028	TCT	2	6	7196	7201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475688
74	NC_012028	GAA	2	6	7276	7281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475688
75	NC_012028	ACG	2	6	7298	7303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475688
76	NC_012028	TGC	2	6	7443	7448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475688
77	NC_012028	AAG	2	6	7492	7497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475688
78	NC_012028	ACA	2	6	7521	7526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475688
79	NC_012028	AGA	2	6	7712	7717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475689
80	NC_012028	CAG	2	6	7835	7840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475689
81	NC_012028	TAC	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475689
82	NC_012028	TAC	3	9	7920	7928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475689
83	NC_012028	CAT	3	9	7949	7957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475689
84	NC_012028	CGA	2	6	8055	8060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475690
85	NC_012028	CAA	2	6	8079	8084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475690
86	NC_012028	TGA	2	6	8196	8201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475690
87	NC_012028	GGT	2	6	8218	8223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475690
88	NC_012028	GAT	2	6	8455	8460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475690
89	NC_012028	CGT	2	6	8479	8484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475690
90	NC_012028	GCA	2	6	8563	8568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475690
91	NC_012028	GGA	2	6	8739	8744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475690
92	NC_012028	TGG	2	6	8784	8789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475690
93	NC_012028	ATG	2	6	8999	9004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475690
94	NC_012028	TCA	2	6	9011	9016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475690
95	NC_012028	GAT	2	6	9025	9030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475690
96	NC_012028	AGA	2	6	9100	9105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475691
97	NC_012028	ATG	2	6	9177	9182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475691
98	NC_012028	TTC	2	6	9446	9451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475691
99	NC_012028	GTT	3	9	9555	9563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475691
100	NC_012028	TTC	2	6	9577	9582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475691
101	NC_012028	GCT	2	6	9596	9601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475691
102	NC_012028	TCA	2	6	9623	9628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475691
103	NC_012028	GAA	2	6	9753	9758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475691
104	NC_012028	TCC	2	6	9764	9769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475691
105	NC_012028	GGT	2	6	9795	9800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475691
106	NC_012028	GTA	2	6	9889	9894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475691
107	NC_012028	CTT	2	6	9930	9935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475691
108	NC_012028	CTC	2	6	10161	10166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475691
109	NC_012028	GCC	2	6	10180	10185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475691
110	NC_012028	ACG	2	6	10220	10225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475691
111	NC_012028	GTT	2	6	10292	10297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475692
112	NC_012028	CTC	2	6	10301	10306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475692
113	NC_012028	GTT	2	6	10327	10332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475692
114	NC_012028	TTG	2	6	10478	10483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475692
115	NC_012028	GCT	2	6	10603	10608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475692
116	NC_012028	CTT	3	9	10711	10719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475692
117	NC_012028	CGA	2	6	10729	10734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475692
118	NC_012028	ACT	2	6	10748	10753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475692
119	NC_012028	CTT	2	6	10879	10884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475692
120	NC_012028	CGA	2	6	10885	10890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475692
121	NC_012028	AAC	2	6	11033	11038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475692
122	NC_012028	ATC	2	6	11214	11219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475692
123	NC_012028	TGG	2	6	11289	11294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475692
124	NC_012028	GAC	2	6	11336	11341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475692
125	NC_012028	GAA	2	6	11387	11392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475692
126	NC_012028	TCG	2	6	11463	11468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475692
127	NC_012028	ATG	2	6	11544	11549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475692
128	NC_012028	TCG	3	9	11577	11585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475692
129	NC_012028	ATC	2	6	11709	11714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475692
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132	NC_012028	ACT	2	6	12176	12181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475693
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252	NC_012028	GGA	2	6	20834	20839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475699
253	NC_012028	CTC	2	6	20905	20910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475699
254	NC_012028	GCG	2	6	20926	20931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475699
255	NC_012028	ACG	2	6	20992	20997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475699
256	NC_012028	GAA	2	6	21165	21170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475699
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276	NC_012028	GTA	2	6	22426	22431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475702
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281	NC_012028	TCG	2	6	22740	22745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475702
282	NC_012028	GCC	2	6	22769	22774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475702
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284	NC_012028	CTT	2	6	22838	22843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475702
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374	NC_012028	AAC	2	6	32939	32944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475710
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496	NC_012028	CGA	3	9	42980	42988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475720
497	NC_012028	CGC	2	6	43079	43084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475720
498	NC_012028	CAG	2	6	43299	43304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475720
499	NC_012028	CGC	2	6	43310	43315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475720
500	NC_012028	ACC	2	6	43398	43403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475720

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