MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012028	TG	3	6	139	144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012028	GT	3	6	1460	1465	0 %	50 %	50 %	0 %	222475683
3	NC_012028	CT	3	6	1736	1741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012028	TC	3	6	1883	1888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012028	AT	3	6	1985	1990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012028	AG	3	6	2122	2127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012028	GA	3	6	2670	2675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012028	CG	3	6	3498	3503	0 %	0 %	50 %	50 %	222475684
9	NC_012028	AC	3	6	3937	3942	50 %	0 %	0 %	50 %	222475684
10	NC_012028	AG	3	6	4272	4277	50 %	0 %	50 %	0 %	222475686
11	NC_012028	AG	3	6	4482	4487	50 %	0 %	50 %	0 %	222475686
12	NC_012028	GA	4	8	5889	5896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012028	GA	3	6	7589	7594	50 %	0 %	50 %	0 %	222475688
14	NC_012028	AG	3	6	7759	7764	50 %	0 %	50 %	0 %	222475689
15	NC_012028	TG	3	6	8011	8016	0 %	50 %	50 %	0 %	222475689
16	NC_012028	AC	3	6	9165	9170	50 %	0 %	0 %	50 %	222475691
17	NC_012028	TC	3	6	9273	9278	0 %	50 %	0 %	50 %	222475691
18	NC_012028	CT	3	6	10012	10017	0 %	50 %	0 %	50 %	222475691
19	NC_012028	GT	3	6	11158	11163	0 %	50 %	50 %	0 %	222475692
20	NC_012028	TG	3	6	11967	11972	0 %	50 %	50 %	0 %	222475692
21	NC_012028	CT	3	6	12113	12118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012028	AG	3	6	12763	12768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012028	GT	3	6	12808	12813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012028	CG	3	6	13049	13054	0 %	0 %	50 %	50 %	222475694
25	NC_012028	TC	3	6	17324	17329	0 %	50 %	0 %	50 %	222475697
26	NC_012028	AC	3	6	18872	18877	50 %	0 %	0 %	50 %	222475697
27	NC_012028	CG	3	6	19772	19777	0 %	0 %	50 %	50 %	222475697
28	NC_012028	AG	3	6	20313	20318	50 %	0 %	50 %	0 %	222475698
29	NC_012028	CG	3	6	20842	20847	0 %	0 %	50 %	50 %	222475699
30	NC_012028	GC	3	6	21200	21205	0 %	0 %	50 %	50 %	222475699
31	NC_012028	TC	3	6	21308	21313	0 %	50 %	0 %	50 %	222475699
32	NC_012028	TC	3	6	22060	22065	0 %	50 %	0 %	50 %	222475701
33	NC_012028	CT	3	6	22228	22233	0 %	50 %	0 %	50 %	222475701
34	NC_012028	GA	3	6	22761	22766	50 %	0 %	50 %	0 %	222475702
35	NC_012028	TC	3	6	22813	22818	0 %	50 %	0 %	50 %	222475702
36	NC_012028	TC	3	6	24164	24169	0 %	50 %	0 %	50 %	222475702
37	NC_012028	AG	3	6	26151	26156	50 %	0 %	50 %	0 %	222475703
38	NC_012028	CG	3	6	26433	26438	0 %	0 %	50 %	50 %	222475703
39	NC_012028	GA	3	6	26616	26621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012028	CG	3	6	26648	26653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012028	TA	3	6	27802	27807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012028	TC	3	6	28195	28200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012028	GC	3	6	28719	28724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012028	AC	3	6	28736	28741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012028	CT	3	6	28979	28984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012028	TA	3	6	29358	29363	50 %	50 %	0 %	0 %	222475704
47	NC_012028	CT	3	6	29956	29961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012028	AG	3	6	30575	30580	50 %	0 %	50 %	0 %	222475705
49	NC_012028	GC	3	6	30995	31000	0 %	0 %	50 %	50 %	222475706
50	NC_012028	AG	3	6	31072	31077	50 %	0 %	50 %	0 %	222475706
51	NC_012028	TC	3	6	31513	31518	0 %	50 %	0 %	50 %	222475707
52	NC_012028	CT	3	6	31625	31630	0 %	50 %	0 %	50 %	222475707
53	NC_012028	GT	3	6	32059	32064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012028	TG	3	6	32125	32130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012028	CA	3	6	32487	32492	50 %	0 %	0 %	50 %	222475709
56	NC_012028	GA	3	6	32676	32681	50 %	0 %	50 %	0 %	222475709
57	NC_012028	CT	3	6	33620	33625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012028	CA	3	6	34711	34716	50 %	0 %	0 %	50 %	222475713
59	NC_012028	GA	3	6	34935	34940	50 %	0 %	50 %	0 %	222475713
60	NC_012028	GA	3	6	35036	35041	50 %	0 %	50 %	0 %	222475713
61	NC_012028	AG	3	6	35185	35190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012028	TC	3	6	35289	35294	0 %	50 %	0 %	50 %	222475714
63	NC_012028	TG	3	6	35497	35502	0 %	50 %	50 %	0 %	222475714
64	NC_012028	CT	3	6	35517	35522	0 %	50 %	0 %	50 %	222475714
65	NC_012028	GT	3	6	36106	36111	0 %	50 %	50 %	0 %	222475715
66	NC_012028	CG	3	6	36545	36550	0 %	0 %	50 %	50 %	222475715
67	NC_012028	TC	3	6	37373	37378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012028	AG	3	6	37663	37668	50 %	0 %	50 %	0 %	222475716
69	NC_012028	TA	3	6	37977	37982	50 %	50 %	0 %	0 %	222475716
70	NC_012028	CT	3	6	38077	38082	0 %	50 %	0 %	50 %	222475716
71	NC_012028	TG	3	6	38854	38859	0 %	50 %	50 %	0 %	222475717
72	NC_012028	CT	3	6	39343	39348	0 %	50 %	0 %	50 %	222475718
73	NC_012028	CG	3	6	39957	39962	0 %	0 %	50 %	50 %	222475718
74	NC_012028	CA	3	6	40227	40232	50 %	0 %	0 %	50 %	222475718
75	NC_012028	GA	3	6	40549	40554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012028	CT	3	6	40834	40839	0 %	50 %	0 %	50 %	222475719
77	NC_012028	CA	4	8	41069	41076	50 %	0 %	0 %	50 %	222475719
78	NC_012028	TC	3	6	41241	41246	0 %	50 %	0 %	50 %	222475719
79	NC_012028	TC	3	6	41277	41282	0 %	50 %	0 %	50 %	222475719
80	NC_012028	CT	3	6	41750	41755	0 %	50 %	0 %	50 %	222475719
81	NC_012028	GT	3	6	41914	41919	0 %	50 %	50 %	0 %	222475719
82	NC_012028	GT	3	6	42102	42107	0 %	50 %	50 %	0 %	222475719
83	NC_012028	GC	3	6	42661	42666	0 %	0 %	50 %	50 %	222475719
84	NC_012028	TC	4	8	43198	43205	0 %	50 %	0 %	50 %	222475720
85	NC_012028	CG	3	6	43910	43915	0 %	0 %	50 %	50 %	222475720
86	NC_012028	GA	3	6	43919	43924	50 %	0 %	50 %	0 %	222475720
87	NC_012028	AC	3	6	45397	45402	50 %	0 %	0 %	50 %	222475721
88	NC_012028	TG	4	8	45717	45724	0 %	50 %	50 %	0 %	222475721
89	NC_012028	TG	3	6	45951	45956	0 %	50 %	50 %	0 %	222475721
90	NC_012028	CG	3	6	46127	46132	0 %	0 %	50 %	50 %	222475721
91	NC_012028	GA	3	6	47305	47310	50 %	0 %	50 %	0 %	222475722
92	NC_012028	TC	3	6	47404	47409	0 %	50 %	0 %	50 %	222475722
93	NC_012028	CG	3	6	49035	49040	0 %	0 %	50 %	50 %	222475723
94	NC_012028	TG	3	6	49386	49391	0 %	50 %	50 %	0 %	222475723
95	NC_012028	TC	3	6	49489	49494	0 %	50 %	0 %	50 %	222475723
96	NC_012028	CT	3	6	49565	49570	0 %	50 %	0 %	50 %	222475723
97	NC_012028	TG	4	8	50793	50800	0 %	50 %	50 %	0 %	222475724
98	NC_012028	AC	3	6	54603	54608	50 %	0 %	0 %	50 %	222475725
99	NC_012028	AG	3	6	55596	55601	50 %	0 %	50 %	0 %	222475726
100	NC_012028	AG	3	6	55672	55677	50 %	0 %	50 %	0 %	222475726
101	NC_012028	GA	3	6	55788	55793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012028	GT	3	6	56052	56057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012028	GC	3	6	56357	56362	0 %	0 %	50 %	50 %	222475727
104	NC_012028	CG	3	6	57906	57911	0 %	0 %	50 %	50 %	222475728
105	NC_012028	CG	3	6	58018	58023	0 %	0 %	50 %	50 %	222475728
106	NC_012028	GT	3	6	58070	58075	0 %	50 %	50 %	0 %	222475728
107	NC_012028	AC	3	6	59083	59088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012028	CT	3	6	59228	59233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012028	AC	3	6	59327	59332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012028	GT	3	6	59559	59564	0 %	50 %	50 %	0 %	222475730
111	NC_012028	GT	3	6	62128	62133	0 %	50 %	50 %	0 %	222475733
112	NC_012028	AT	3	6	62846	62851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012028	GC	3	6	65273	65278	0 %	0 %	50 %	50 %	222475735
114	NC_012028	AC	3	6	66275	66280	50 %	0 %	0 %	50 %	222475736
115	NC_012028	GC	3	6	66330	66335	0 %	0 %	50 %	50 %	222475736
116	NC_012028	GA	3	6	67586	67591	50 %	0 %	50 %	0 %	222475737
117	NC_012028	GT	4	8	67761	67768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012028	GC	3	6	69133	69138	0 %	0 %	50 %	50 %	222475740
119	NC_012028	AC	3	6	70126	70131	50 %	0 %	0 %	50 %	222475741
120	NC_012028	CT	3	6	71133	71138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012028	AC	3	6	71363	71368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012028	GC	3	6	71825	71830	0 %	0 %	50 %	50 %	222475743
123	NC_012028	GT	3	6	73205	73210	0 %	50 %	50 %	0 %	222475744
124	NC_012028	GC	3	6	73269	73274	0 %	0 %	50 %	50 %	222475744
125	NC_012028	AC	3	6	74080	74085	50 %	0 %	0 %	50 %	222475745
126	NC_012028	AC	3	6	74193	74198	50 %	0 %	0 %	50 %	222475745
127	NC_012028	GC	3	6	74570	74575	0 %	0 %	50 %	50 %	222475746
128	NC_012028	CG	3	6	74895	74900	0 %	0 %	50 %	50 %	222475746
129	NC_012028	GC	3	6	75631	75636	0 %	0 %	50 %	50 %	222475747
130	NC_012028	CG	3	6	76013	76018	0 %	0 %	50 %	50 %	222475747
131	NC_012028	CG	3	6	76655	76660	0 %	0 %	50 %	50 %	222475748
132	NC_012028	GC	3	6	76727	76732	0 %	0 %	50 %	50 %	222475748
133	NC_012028	AT	3	6	77005	77010	50 %	50 %	0 %	0 %	222475748
134	NC_012028	GA	3	6	77927	77932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012028	CG	3	6	78755	78760	0 %	0 %	50 %	50 %	222475751
136	NC_012028	AC	3	6	79194	79199	50 %	0 %	0 %	50 %	222475751
137	NC_012028	GA	3	6	81336	81341	50 %	0 %	50 %	0 %	222475754
138	NC_012028	GT	3	6	81451	81456	0 %	50 %	50 %	0 %	222475754
139	NC_012028	TG	3	6	81496	81501	0 %	50 %	50 %	0 %	222475754
140	NC_012028	TG	3	6	82298	82303	0 %	50 %	50 %	0 %	222475754
141	NC_012028	AG	3	6	83897	83902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012028	AG	3	6	84288	84293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012028	GA	3	6	86426	86431	50 %	0 %	50 %	0 %	222475755
144	NC_012028	CG	3	6	86590	86595	0 %	0 %	50 %	50 %	222475755
145	NC_012028	GA	3	6	87166	87171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012028	CG	3	6	87994	87999	0 %	0 %	50 %	50 %	222475757
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