MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 257

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012028	TG	3	6	139	144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012028	CT	3	6	1736	1741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012028	TC	3	6	1883	1888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012028	AT	3	6	1985	1990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012028	AG	3	6	2122	2127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012028	GA	3	6	2670	2675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012028	GA	4	8	5889	5896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012028	CT	3	6	12113	12118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012028	AG	3	6	12763	12768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012028	GT	3	6	12808	12813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012028	GA	3	6	26616	26621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012028	CG	3	6	26648	26653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012028	TA	3	6	27802	27807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012028	TC	3	6	28195	28200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012028	GC	3	6	28719	28724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012028	AC	3	6	28736	28741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012028	CT	3	6	28979	28984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012028	CT	3	6	29956	29961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012028	GT	3	6	32059	32064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012028	TG	3	6	32125	32130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012028	CT	3	6	33620	33625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012028	AG	3	6	35185	35190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012028	TC	3	6	37373	37378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012028	GA	3	6	40549	40554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012028	GA	3	6	55788	55793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012028	GT	3	6	56052	56057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012028	AC	3	6	59083	59088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012028	CT	3	6	59228	59233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012028	AC	3	6	59327	59332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012028	AT	3	6	62846	62851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012028	GT	4	8	67761	67768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012028	CT	3	6	71133	71138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012028	AC	3	6	71363	71368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012028	GA	3	6	77927	77932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012028	AG	3	6	83897	83902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012028	AG	3	6	84288	84293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012028	GA	3	6	87166	87171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012028	AG	3	6	91498	91503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012028	CA	3	6	96770	96775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012028	CA	3	6	96962	96967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012028	CT	3	6	97786	97791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012028	AC	3	6	99299	99304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012028	GA	3	6	99403	99408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012028	TC	3	6	109223	109228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012028	CA	3	6	110186	110191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012028	TC	3	6	115558	115563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012028	TA	3	6	120924	120929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012028	TA	3	6	121006	121011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012028	CT	3	6	133197	133202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012028	TG	3	6	135475	135480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012028	GC	3	6	135525	135530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012028	TC	3	6	135737	135742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012028	AC	3	6	135745	135750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012028	AG	3	6	137165	137170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012028	TC	3	6	138057	138062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012028	GA	3	6	138469	138474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012028	CG	3	6	139846	139851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012028	CG	3	6	140180	140185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012028	GC	4	8	141751	141758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012028	GT	3	6	142242	142247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012028	CA	3	6	142292	142297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012028	AT	3	6	145794	145799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012028	GC	3	6	148357	148362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012028	CT	3	6	150560	150565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012028	CT	3	6	150649	150654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012028	GC	3	6	153390	153395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012028	AG	3	6	156967	156972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012028	GA	3	6	158022	158027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012028	TC	3	6	160186	160191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012028	GA	3	6	160574	160579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012028	AG	3	6	162286	162291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012028	GC	3	6	162616	162621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012028	CA	3	6	162645	162650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012028	CA	3	6	162898	162903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012028	AC	3	6	163276	163281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012028	AG	3	6	163874	163879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012028	GC	3	6	165584	165589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012028	TG	3	6	166005	166010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012028	TC	4	8	166283	166290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012028	AG	4	8	166302	166309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012028	AC	3	6	167856	167861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012028	AG	3	6	168316	168321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012028	TC	3	6	168347	168352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012028	CG	3	6	169213	169218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012028	GA	4	8	169443	169450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012028	GA	3	6	170160	170165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012028	AC	3	6	176700	176705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012028	AC	3	6	176719	176724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012028	AC	3	6	178087	178092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012028	GC	3	6	179405	179410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012028	GC	3	6	179635	179640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012028	TC	3	6	186731	186736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012028	GA	3	6	186747	186752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012028	CA	3	6	188720	188725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012028	CA	4	8	188899	188906	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012028	TC	3	6	194905	194910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012028	TA	3	6	197662	197667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012028	CT	3	6	197780	197785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012028	TG	4	8	202965	202972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012028	GT	3	6	204006	204011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012028	GC	3	6	204105	204110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012028	TG	3	6	204531	204536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012028	GA	3	6	204708	204713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012028	GC	4	8	206849	206856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012028	GA	3	6	208411	208416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012028	GT	3	6	208505	208510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012028	GC	3	6	208567	208572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012028	AC	3	6	209157	209162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012028	AC	3	6	210531	210536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012028	TC	3	6	210576	210581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_012028	TG	3	6	210778	210783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012028	TG	3	6	210888	210893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012028	GA	5	10	212562	212571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012028	GA	3	6	212679	212684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012028	TC	3	6	214148	214153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012028	CA	3	6	214204	214209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012028	TC	3	6	214380	214385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012028	AG	3	6	218021	218026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012028	GT	4	8	218146	218153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012028	TC	3	6	218162	218167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012028	TC	4	8	223711	223718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012028	AT	3	6	224461	224466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012028	GT	3	6	225733	225738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012028	CA	3	6	228485	228490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012028	GT	3	6	229552	229557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012028	CA	3	6	229570	229575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012028	TC	3	6	229745	229750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012028	GC	3	6	230066	230071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012028	GC	3	6	230099	230104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_012028	TG	3	6	231118	231123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012028	GC	3	6	231242	231247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012028	AC	3	6	231728	231733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012028	CA	3	6	231774	231779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_012028	CG	3	6	231881	231886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_012028	TC	3	6	234089	234094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012028	CA	3	6	234175	234180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012028	CA	3	6	234192	234197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012028	GA	3	6	237170	237175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012028	TG	3	6	239052	239057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012028	TC	3	6	240384	240389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012028	TC	3	6	245353	245358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_012028	TG	3	6	254310	254315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012028	CG	3	6	256297	256302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_012028	TC	3	6	257721	257726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_012028	GA	3	6	257727	257732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012028	CT	3	6	270803	270808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_012028	GA	4	8	272281	272288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012028	AC	3	6	272685	272690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_012028	TG	3	6	283990	283995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012028	CT	3	6	287881	287886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_012028	AG	3	6	287960	287965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012028	TG	3	6	288311	288316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012028	GT	3	6	288441	288446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012028	GA	3	6	288560	288565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_012028	CT	3	6	295093	295098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.