MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012028	T	6	6	717	722	0 %	100 %	0 %	0 %	222475683
2	NC_012028	T	7	7	2156	2162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012028	T	6	6	7792	7797	0 %	100 %	0 %	0 %	222475689
4	NC_012028	G	6	6	7822	7827	0 %	0 %	100 %	0 %	222475689
5	NC_012028	A	6	6	8237	8242	100 %	0 %	0 %	0 %	222475690
6	NC_012028	A	6	6	8713	8718	100 %	0 %	0 %	0 %	222475690
7	NC_012028	A	6	6	10030	10035	100 %	0 %	0 %	0 %	222475691
8	NC_012028	G	6	6	12757	12762	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012028	A	6	6	16744	16749	100 %	0 %	0 %	0 %	222475696
10	NC_012028	T	6	6	20044	20049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012028	T	6	6	20948	20953	0 %	100 %	0 %	0 %	222475699
12	NC_012028	T	6	6	23409	23414	0 %	100 %	0 %	0 %	222475702
13	NC_012028	T	6	6	24225	24230	0 %	100 %	0 %	0 %	222475702
14	NC_012028	C	6	6	26018	26023	0 %	0 %	0 %	100 %	222475703
15	NC_012028	A	6	6	27999	28004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012028	G	6	6	29709	29714	0 %	0 %	100 %	0 %	222475704
17	NC_012028	T	6	6	32086	32091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012028	C	6	6	32583	32588	0 %	0 %	0 %	100 %	222475709
19	NC_012028	G	6	6	37497	37502	0 %	0 %	100 %	0 %	222475716
20	NC_012028	T	6	6	38651	38656	0 %	100 %	0 %	0 %	222475716
21	NC_012028	C	6	6	39273	39278	0 %	0 %	0 %	100 %	222475718
22	NC_012028	G	7	7	40645	40651	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012028	T	7	7	49331	49337	0 %	100 %	0 %	0 %	222475723
24	NC_012028	C	6	6	54904	54909	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_012028	C	6	6	56124	56129	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_012028	T	6	6	57225	57230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012028	A	6	6	60216	60221	100 %	0 %	0 %	0 %	222475732
28	NC_012028	G	6	6	60513	60518	0 %	0 %	100 %	0 %	222475732
29	NC_012028	C	6	6	61382	61387	0 %	0 %	0 %	100 %	222475733
30	NC_012028	T	6	6	71054	71059	0 %	100 %	0 %	0 %	222475742
31	NC_012028	C	6	6	79806	79811	0 %	0 %	0 %	100 %	222475752
32	NC_012028	T	6	6	81992	81997	0 %	100 %	0 %	0 %	222475754
33	NC_012028	T	6	6	86706	86711	0 %	100 %	0 %	0 %	222475755
34	NC_012028	A	6	6	89939	89944	100 %	0 %	0 %	0 %	222475758
35	NC_012028	G	6	6	96784	96789	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012028	G	6	6	97300	97305	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012028	G	6	6	97366	97371	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012028	G	6	6	113670	113675	0 %	0 %	100 %	0 %	222475780
39	NC_012028	G	6	6	115787	115792	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012028	C	6	6	117123	117128	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_012028	A	6	6	121053	121058	100 %	0 %	0 %	0 %	222475787
42	NC_012028	A	6	6	129814	129819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012028	G	6	6	131048	131053	0 %	0 %	100 %	0 %	222475794
44	NC_012028	C	6	6	134269	134274	0 %	0 %	0 %	100 %	222475797
45	NC_012028	G	6	6	135445	135450	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012028	T	6	6	141626	141631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012028	C	6	6	145985	145990	0 %	0 %	0 %	100 %	222475808
48	NC_012028	C	6	6	147148	147153	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_012028	C	6	6	151374	151379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_012028	A	6	6	158040	158045	100 %	0 %	0 %	0 %	222475825
51	NC_012028	A	6	6	168353	168358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012028	A	6	6	169318	169323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012028	G	6	6	174215	174220	0 %	0 %	100 %	0 %	222475837
54	NC_012028	G	6	6	174237	174242	0 %	0 %	100 %	0 %	222475837
55	NC_012028	G	6	6	175618	175623	0 %	0 %	100 %	0 %	222475838
56	NC_012028	A	7	7	178069	178075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012028	C	6	6	182944	182949	0 %	0 %	0 %	100 %	222475846
58	NC_012028	C	6	6	192869	192874	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_012028	A	6	6	201209	201214	100 %	0 %	0 %	0 %	222475860
60	NC_012028	G	6	6	209826	209831	0 %	0 %	100 %	0 %	222475873
61	NC_012028	G	6	6	214912	214917	0 %	0 %	100 %	0 %	222475876
62	NC_012028	A	6	6	216013	216018	100 %	0 %	0 %	0 %	222475877
63	NC_012028	C	6	6	217792	217797	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_012028	T	6	6	222717	222722	0 %	100 %	0 %	0 %	222475879
65	NC_012028	C	6	6	229238	229243	0 %	0 %	0 %	100 %	222475884
66	NC_012028	C	6	6	242344	242349	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_012028	A	7	7	246001	246007	100 %	0 %	0 %	0 %	222475896
68	NC_012028	A	6	6	249203	249208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012028	G	6	6	253384	253389	0 %	0 %	100 %	0 %	222475903
70	NC_012028	C	6	6	257193	257198	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
71	NC_012028	G	6	6	257554	257559	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012028	G	6	6	257713	257718	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012028	G	6	6	259581	259586	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012028	A	6	6	264077	264082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012028	A	6	6	269691	269696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012028	G	6	6	270660	270665	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012028	T	6	6	273123	273128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012028	G	6	6	277042	277047	0 %	0 %	100 %	0 %	222475931
79	NC_012028	C	6	6	280035	280040	0 %	0 %	0 %	100 %	222475932
80	NC_012028	C	7	7	282716	282722	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_012028	C	6	6	286419	286424	0 %	0 %	0 %	100 %	222475936
82	NC_012028	A	6	6	286618	286623	100 %	0 %	0 %	0 %	222475936
83	NC_012028	T	6	6	288902	288907	0 %	100 %	0 %	0 %	222475938
84	NC_012028	A	6	6	296092	296097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012028	G	7	7	297452	297458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012028	G	6	6	298169	298174	0 %	0 %	100 %	0 %	222475949
87	NC_012028	G	6	6	314769	314774	0 %	0 %	100 %	0 %	222475963
88	NC_012028	G	7	7	314994	315000	0 %	0 %	100 %	0 %	222475963
89	NC_012028	T	6	6	319321	319326	0 %	100 %	0 %	0 %	222475966
90	NC_012028	A	6	6	320222	320227	100 %	0 %	0 %	0 %	222475967
91	NC_012028	T	6	6	323141	323146	0 %	100 %	0 %	0 %	222475970
92	NC_012028	T	6	6	329770	329775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012028	A	6	6	335037	335042	100 %	0 %	0 %	0 %	222475984
94	NC_012028	C	6	6	336052	336057	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_012028	C	6	6	340675	340680	0 %	0 %	0 %	100 %	222475990
96	NC_012028	A	6	6	342816	342821	100 %	0 %	0 %	0 %	222475993
97	NC_012028	C	6	6	344766	344771	0 %	0 %	0 %	100 %	222475996
98	NC_012028	A	6	6	351485	351490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012028	A	6	6	357963	357968	100 %	0 %	0 %	0 %	222476013
100	NC_012028	C	6	6	359020	359025	0 %	0 %	0 %	100 %	222476014
101	NC_012028	G	6	6	360840	360845	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012028	C	6	6	365200	365205	0 %	0 %	0 %	100 %	222476021
103	NC_012028	A	6	6	367661	367666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012028	G	6	6	368105	368110	0 %	0 %	100 %	0 %	222476025
105	NC_012028	C	6	6	368302	368307	0 %	0 %	0 %	100 %	222476025
106	NC_012028	C	6	6	374494	374499	0 %	0 %	0 %	100 %	222476034
107	NC_012028	G	6	6	379255	379260	0 %	0 %	100 %	0 %	222476041
108	NC_012028	A	6	6	381129	381134	100 %	0 %	0 %	0 %	222476044
109	NC_012028	A	6	6	381680	381685	100 %	0 %	0 %	0 %	222476045
110	NC_012028	A	6	6	387863	387868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012028	T	7	7	395806	395812	0 %	100 %	0 %	0 %	222476060
112	NC_012028	T	7	7	397988	397994	0 %	100 %	0 %	0 %	222476063
113	NC_012028	C	6	6	398412	398417	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_012028	G	6	6	399202	399207	0 %	0 %	100 %	0 %	222476065
115	NC_012028	A	6	6	404059	404064	100 %	0 %	0 %	0 %	222476074
116	NC_012028	G	6	6	418177	418182	0 %	0 %	100 %	0 %	222476085
117	NC_012028	C	6	6	438240	438245	0 %	0 %	0 %	100 %	222476095
118	NC_012028	C	6	6	438673	438678	0 %	0 %	0 %	100 %	222476095
119	NC_012028	C	6	6	441547	441552	0 %	0 %	0 %	100 %	222476096
120	NC_012028	G	6	6	446265	446270	0 %	0 %	100 %	0 %	222476100
121	NC_012028	T	6	6	454341	454346	0 %	100 %	0 %	0 %	222476110
122	NC_012028	T	6	6	481916	481921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012028	C	6	6	482493	482498	0 %	0 %	0 %	100 %	222476124
124	NC_012028	T	6	6	484573	484578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012028	A	6	6	486644	486649	100 %	0 %	0 %	0 %	222476125
126	NC_012028	T	6	6	489626	489631	0 %	100 %	0 %	0 %	222476126
127	NC_012028	A	6	6	491852	491857	100 %	0 %	0 %	0 %	222476127
128	NC_012028	A	6	6	493046	493051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012028	C	6	6	495497	495502	0 %	0 %	0 %	100 %	222476130
130	NC_012028	T	6	6	497846	497851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012028	A	6	6	499999	500004	100 %	0 %	0 %	0 %	222476133
132	NC_012028	T	7	7	507162	507168	0 %	100 %	0 %	0 %	222476137
133	NC_012028	C	6	6	510857	510862	0 %	0 %	0 %	100 %	222476139
134	NC_012028	T	6	6	515095	515100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012028	G	6	6	515677	515682	0 %	0 %	100 %	0 %	222476144

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.