MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Florida

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012026	GAAGTA	2	12	24245	24256	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012026	GGTGAT	2	12	36035	36046	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012026	GAAGTA	2	12	45513	45524	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012026	CTACTT	2	12	47800	47811	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012026	TGGCTG	2	12	125560	125571	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012026	CTACTT	2	12	176143	176154	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012026	TATAAT	2	12	189147	189158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012026	GCCGCG	2	12	250372	250383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012026	TGGGCT	2	12	283194	283205	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012026	GGGTTT	2	12	322317	322328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012026	ATGCCC	2	12	333897	333908	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012026	TATAAT	2	12	402701	402712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012026	GCACCG	2	12	489613	489624	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012026	TAAAAG	2	12	502403	502414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012026	TAAAAG	2	12	504802	504813	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012026	TTGCTG	2	12	506983	506994	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012026	TTGATG	2	12	657705	657716	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012026	ACCTTA	2	12	657733	657744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012026	CTACTT	2	12	661633	661644	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012026	ACCCCT	2	12	781516	781527	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_012026	CCAACC	2	12	795226	795237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_012026	AAAAAG	2	12	852169	852180	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012026	GAAGTA	2	12	904004	904015	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012026	CCTGTA	2	12	905249	905260	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012026	GTGGCG	2	12	918070	918081	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012026	TGCACA	2	12	941966	941977	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012026	ACACTT	2	12	960293	960304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012026	CTACTT	2	12	1117450	1117461	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012026	TACTTT	2	12	1179514	1179525	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012026	GCACCA	2	12	1184316	1184327	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.