MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Florida

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012026	CATAG	2	10	33965	33974	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012026	AGCAA	2	10	34348	34357	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012026	GAAGA	2	10	35333	35342	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012026	CCATA	2	10	37861	37870	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_012026	AGATG	2	10	46111	46120	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012026	GGCTA	2	10	54708	54717	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012026	TTGGT	2	10	64423	64432	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012026	CTATG	2	10	67146	67155	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012026	AACCG	2	10	71029	71038	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_012026	AGCAA	2	10	73094	73103	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_012026	CGGGA	2	10	74171	74180	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012026	TGGGG	2	10	76500	76509	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012026	TCGAT	2	10	80503	80512	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012026	ATTGG	2	10	82031	82040	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012026	AGATT	2	10	83241	83250	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012026	GCCTG	2	10	92160	92169	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_012026	GGTAG	2	10	97596	97605	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012026	CCCGC	2	10	99893	99902	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
19	NC_012026	CTTAA	2	10	99968	99977	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012026	CCCTA	2	10	147350	147359	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_012026	TTAAG	2	10	153249	153258	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012026	CTACC	2	10	155726	155735	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_012026	ACTTA	2	10	160900	160909	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012026	ACTTT	2	10	162764	162773	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012026	TTGCT	2	10	167279	167288	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_012026	CTTGC	2	10	171103	171112	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_012026	GAACA	2	10	189098	189107	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012026	TCGTG	2	10	247323	247332	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_012026	GCTCT	2	10	253499	253508	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_012026	TAATA	2	10	282935	282944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012026	TGTAG	2	10	291922	291931	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012026	TTGGA	2	10	322068	322077	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012026	GTAGA	2	10	331846	331855	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012026	ATCCC	2	10	336445	336454	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_012026	GCACC	2	10	345212	345221	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_012026	AGCGT	2	10	376093	376102	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_012026	GCTTG	2	10	386576	386585	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_012026	AGCCA	2	10	392141	392150	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_012026	CACGC	2	10	402762	402771	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_012026	GTATT	2	10	429373	429382	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012026	TTTAT	2	10	454606	454615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012026	GCAAA	2	10	471440	471449	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012026	CAACG	2	10	482091	482100	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_012026	GCGGT	2	10	485025	485034	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_012026	TGCGC	2	10	486084	486093	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_012026	CCTGC	2	10	486110	486119	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_012026	CATGA	2	10	502446	502455	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012026	GGAGC	2	10	513978	513987	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_012026	ATAGC	2	10	517163	517172	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012026	TGTCG	2	10	530311	530320	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_012026	GCTCA	2	10	546372	546381	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_012026	TACCC	2	10	554158	554167	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_012026	TATAC	2	10	565600	565609	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012026	CCACA	2	10	607288	607297	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_012026	GTAAT	2	10	626237	626246	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012026	AAGTG	2	10	631265	631274	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012026	GGAAC	2	10	631451	631460	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_012026	TAAGT	2	10	639088	639097	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012026	AGCAA	2	10	659135	659144	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012026	CATCT	2	10	661038	661047	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_012026	TATTG	2	10	693049	693058	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012026	CCAAG	2	10	697834	697843	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_012026	CTCCC	2	10	726413	726422	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
64	NC_012026	TGCAC	2	10	730864	730873	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_012026	GGGGC	2	10	756831	756840	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
66	NC_012026	AGCAA	2	10	762780	762789	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012026	AAAAC	2	10	779421	779430	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_012026	CTTGA	2	10	789261	789270	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_012026	GCGCT	2	10	805570	805579	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_012026	AGAGG	2	10	808849	808858	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012026	AGAGG	2	10	810000	810009	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012026	AGAGG	2	10	811727	811736	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012026	AGAGG	2	10	812837	812846	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012026	AGAGG	2	10	813989	813998	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012026	CCCCT	2	10	836058	836067	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
76	NC_012026	GCTTT	2	10	856178	856187	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_012026	GGCAA	2	10	859944	859953	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012026	AGCAC	2	10	860536	860545	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_012026	ATCGC	2	10	864911	864920	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_012026	GGTTT	2	10	868368	868377	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012026	GCCGT	2	10	870092	870101	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_012026	GGCTG	2	10	888493	888502	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_012026	TAGTG	2	10	889902	889911	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012026	GGCTG	2	10	904630	904639	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012026	TGTGC	2	10	905043	905052	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012026	TAGCG	2	10	921910	921919	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012026	CACTC	2	10	942081	942090	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
88	NC_012026	GTAGC	2	10	983511	983520	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_012026	GGGCC	2	10	1022341	1022350	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_012026	GTGCT	2	10	1022413	1022422	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012026	CTGCT	2	10	1024247	1024256	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_012026	GGCAT	2	10	1030937	1030946	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_012026	ATTGC	2	10	1031121	1031130	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_012026	AGCAA	2	10	1039070	1039079	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_012026	CTGGG	2	10	1039714	1039723	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_012026	TGTGC	2	10	1044057	1044066	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_012026	TAAAA	2	10	1044180	1044189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012026	CTTTG	2	10	1058221	1058230	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_012026	ATTAA	2	10	1061993	1062002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012026	ACGTT	2	10	1083797	1083806	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_012026	TCCCC	2	10	1093828	1093837	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
102	NC_012026	CACAA	2	10	1097982	1097991	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_012026	GGTCA	2	10	1099715	1099724	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012026	TTTGG	2	10	1099826	1099835	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012026	CCCAG	2	10	1116863	1116872	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_012026	GAAAG	2	10	1132394	1132403	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012026	TGGGA	2	10	1144063	1144072	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012026	ACTAG	2	10	1165465	1165474	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_012026	TACCC	2	10	1165484	1165493	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_012026	CTTGT	2	10	1171069	1171078	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_012026	ACAAA	2	10	1192907	1192916	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_012026	ACTTT	2	10	1201268	1201277	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.