MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 1162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012004	TTAGT	2	10	974	983	20 %	60 %	20 %	0 %	222152202
2	NC_012004	TTTTC	2	10	2180	2189	0 %	80 %	0 %	20 %	222152203
3	NC_012004	GTAAA	2	10	2435	2444	60 %	20 %	20 %	0 %	222152203
4	NC_012004	CAAAA	2	10	6975	6984	80 %	0 %	0 %	20 %	222152208
5	NC_012004	GTTTT	2	10	9436	9445	0 %	80 %	20 %	0 %	222152209
6	NC_012004	CTTCT	2	10	12950	12959	0 %	60 %	0 %	40 %	222152214
7	NC_012004	AAAAG	2	10	13390	13399	80 %	0 %	20 %	0 %	222152214
8	NC_012004	GTTCC	2	10	13752	13761	0 %	40 %	20 %	40 %	222152215
9	NC_012004	TTTAT	2	10	16464	16473	20 %	80 %	0 %	0 %	222152217
10	NC_012004	AATTA	2	10	17636	17645	60 %	40 %	0 %	0 %	222152217
11	NC_012004	ATTAT	2	10	24900	24909	40 %	60 %	0 %	0 %	222152218
12	NC_012004	ATCAT	2	10	25342	25351	40 %	40 %	0 %	20 %	222152218
13	NC_012004	GAAAA	2	10	25504	25513	80 %	0 %	20 %	0 %	222152218
14	NC_012004	AGTGA	2	10	28180	28189	40 %	20 %	40 %	0 %	222152221
15	NC_012004	GAATT	2	10	29242	29251	40 %	40 %	20 %	0 %	222152222
16	NC_012004	CTTAT	2	10	29712	29721	20 %	60 %	0 %	20 %	222152222
17	NC_012004	AGAAA	2	10	32158	32167	80 %	0 %	20 %	0 %	222152226
18	NC_012004	CAGCT	2	10	33153	33162	20 %	20 %	20 %	40 %	222152227
19	NC_012004	ACCAT	2	10	34939	34948	40 %	20 %	0 %	40 %	222152227
20	NC_012004	AAATG	2	10	37495	37504	60 %	20 %	20 %	0 %	222152228
21	NC_012004	AAGGC	2	10	39192	39201	40 %	0 %	40 %	20 %	222152229
22	NC_012004	GTCAA	2	10	41443	41452	40 %	20 %	20 %	20 %	222152231
23	NC_012004	TAATA	2	10	43384	43393	60 %	40 %	0 %	0 %	222152233
24	NC_012004	TCATT	2	10	43581	43590	20 %	60 %	0 %	20 %	222152233
25	NC_012004	ATCAA	2	10	43699	43708	60 %	20 %	0 %	20 %	222152233
26	NC_012004	AAACC	2	10	43826	43835	60 %	0 %	0 %	40 %	222152233
27	NC_012004	AATGA	2	10	43979	43988	60 %	20 %	20 %	0 %	222152233
28	NC_012004	TTTAT	2	10	44694	44703	20 %	80 %	0 %	0 %	222152233
29	NC_012004	CATTA	2	10	44713	44722	40 %	40 %	0 %	20 %	222152233
30	NC_012004	TTACT	2	10	49058	49067	20 %	60 %	0 %	20 %	222152239
31	NC_012004	GTTCC	2	10	49527	49536	0 %	40 %	20 %	40 %	222152239
32	NC_012004	ATTTT	2	10	52859	52868	20 %	80 %	0 %	0 %	222152243
33	NC_012004	TGCTA	2	10	53494	53503	20 %	40 %	20 %	20 %	222152243
34	NC_012004	AACAA	2	10	53732	53741	80 %	0 %	0 %	20 %	222152244
35	NC_012004	AGGAC	2	10	55260	55269	40 %	0 %	40 %	20 %	222152246
36	NC_012004	AGTAA	2	10	56347	56356	60 %	20 %	20 %	0 %	222152247
37	NC_012004	TTTTA	2	10	57108	57117	20 %	80 %	0 %	0 %	222152249
38	NC_012004	TGGCT	2	10	57891	57900	0 %	40 %	40 %	20 %	222152250
39	NC_012004	TTTTC	2	10	63082	63091	0 %	80 %	0 %	20 %	222152255
40	NC_012004	CTTAT	2	10	64077	64086	20 %	60 %	0 %	20 %	222152256
41	NC_012004	TTTGT	2	10	64444	64453	0 %	80 %	20 %	0 %	222152257
42	NC_012004	CAAAT	2	10	65026	65035	60 %	20 %	0 %	20 %	222152258
43	NC_012004	GTTTT	2	10	66073	66082	0 %	80 %	20 %	0 %	222152259
44	NC_012004	TTTAG	2	10	66654	66663	20 %	60 %	20 %	0 %	222152259
45	NC_012004	TAAAT	2	10	67309	67318	60 %	40 %	0 %	0 %	222152260
46	NC_012004	ATGGT	2	10	67962	67971	20 %	40 %	40 %	0 %	222152260
47	NC_012004	AATTC	2	10	68645	68654	40 %	40 %	0 %	20 %	222152260
48	NC_012004	AACTT	2	10	71121	71130	40 %	40 %	0 %	20 %	222152262
49	NC_012004	GCAAT	2	10	72502	72511	40 %	20 %	20 %	20 %	222152263
50	NC_012004	TTACT	2	10	72710	72719	20 %	60 %	0 %	20 %	222152263
51	NC_012004	TGAAA	2	10	75647	75656	60 %	20 %	20 %	0 %	222152268
52	NC_012004	GAAAA	2	10	76221	76230	80 %	0 %	20 %	0 %	222152269
53	NC_012004	TTTGG	2	10	76635	76644	0 %	60 %	40 %	0 %	222152270
54	NC_012004	AAATC	2	10	77107	77116	60 %	20 %	0 %	20 %	222152271
55	NC_012004	TGAAA	2	10	78071	78080	60 %	20 %	20 %	0 %	222152273
56	NC_012004	AAAAC	2	10	81294	81303	80 %	0 %	0 %	20 %	222152281
57	NC_012004	TAAAA	2	10	82334	82343	80 %	20 %	0 %	0 %	222152283
58	NC_012004	CCAAT	2	10	83650	83659	40 %	20 %	0 %	40 %	222152285
59	NC_012004	GAAAA	2	10	84186	84195	80 %	0 %	20 %	0 %	222152285
60	NC_012004	CGTGA	2	10	86209	86218	20 %	20 %	40 %	20 %	222152290
61	NC_012004	TTAGC	2	10	95488	95497	20 %	40 %	20 %	20 %	222152293
62	NC_012004	TTGAC	2	10	97202	97211	20 %	40 %	20 %	20 %	222152295
63	NC_012004	CAAAC	2	10	99582	99591	60 %	0 %	0 %	40 %	222152297
64	NC_012004	TTGAT	2	10	100368	100377	20 %	60 %	20 %	0 %	222152298
65	NC_012004	TAAAA	2	10	100828	100837	80 %	20 %	0 %	0 %	222152298
66	NC_012004	TTGGT	2	10	103067	103076	0 %	60 %	40 %	0 %	222152300
67	NC_012004	TTTTG	2	10	103389	103398	0 %	80 %	20 %	0 %	222152300
68	NC_012004	GGATT	2	10	103533	103542	20 %	40 %	40 %	0 %	222152301
69	NC_012004	TTCTT	2	10	103642	103651	0 %	80 %	0 %	20 %	222152301
70	NC_012004	AGAGA	2	10	107771	107780	60 %	0 %	40 %	0 %	222152303
71	NC_012004	AAGAT	2	10	108847	108856	60 %	20 %	20 %	0 %	222152304
72	NC_012004	ATTTC	2	10	110854	110863	20 %	60 %	0 %	20 %	222152307
73	NC_012004	CAGCT	2	10	111983	111992	20 %	20 %	20 %	40 %	222152308
74	NC_012004	GGATT	2	10	114314	114323	20 %	40 %	40 %	0 %	222152309
75	NC_012004	ATCAA	2	10	114549	114558	60 %	20 %	0 %	20 %	222152309
76	NC_012004	TAAAT	2	10	116764	116773	60 %	40 %	0 %	0 %	222152310
77	NC_012004	TAAAT	2	10	122783	122792	60 %	40 %	0 %	0 %	222152312
78	NC_012004	CAATC	2	10	124078	124087	40 %	20 %	0 %	40 %	222152314
79	NC_012004	AAAAG	2	10	124905	124914	80 %	0 %	20 %	0 %	222152315
80	NC_012004	TGAAT	2	10	124974	124983	40 %	40 %	20 %	0 %	222152315
81	NC_012004	TGATT	2	10	127780	127789	20 %	60 %	20 %	0 %	222152321
82	NC_012004	CTGGA	2	10	130499	130508	20 %	20 %	40 %	20 %	222152325
83	NC_012004	TTGTT	2	10	132570	132579	0 %	80 %	20 %	0 %	222152328
84	NC_012004	AAGAA	2	10	133672	133681	80 %	0 %	20 %	0 %	222152330
85	NC_012004	TGATT	2	10	135149	135158	20 %	60 %	20 %	0 %	222152330
86	NC_012004	GAATT	2	10	135789	135798	40 %	40 %	20 %	0 %	222152330
87	NC_012004	TAGGA	2	10	141379	141388	40 %	20 %	40 %	0 %	222152334
88	NC_012004	AGTTA	2	10	147728	147737	40 %	40 %	20 %	0 %	222152340
89	NC_012004	CAATG	2	10	148608	148617	40 %	20 %	20 %	20 %	222152341
90	NC_012004	CCACA	2	10	148671	148680	40 %	0 %	0 %	60 %	222152341
91	NC_012004	GACAG	2	10	151271	151280	40 %	0 %	40 %	20 %	222152342
92	NC_012004	TTGTT	2	10	151853	151862	0 %	80 %	20 %	0 %	222152344
93	NC_012004	TGCTT	2	10	152517	152526	0 %	60 %	20 %	20 %	222152344
94	NC_012004	CCATA	2	10	154476	154485	40 %	20 %	0 %	40 %	222152346
95	NC_012004	CCAAA	2	10	158707	158716	60 %	0 %	0 %	40 %	222152351
96	NC_012004	CTTTG	2	10	159334	159343	0 %	60 %	20 %	20 %	222152352
97	NC_012004	CCTAT	2	10	163091	163100	20 %	40 %	0 %	40 %	222152354
98	NC_012004	AGAAC	2	10	164637	164646	60 %	0 %	20 %	20 %	222152354
99	NC_012004	CTTTA	2	10	166128	166137	20 %	60 %	0 %	20 %	222152357
100	NC_012004	AAAAT	2	10	169345	169354	80 %	20 %	0 %	0 %	222152359
101	NC_012004	TGGGT	2	10	170337	170346	0 %	40 %	60 %	0 %	222152361
102	NC_012004	GTCCT	2	10	170403	170412	0 %	40 %	20 %	40 %	222152361
103	NC_012004	AGTCC	2	10	171483	171492	20 %	20 %	20 %	40 %	222152362
104	NC_012004	GCAGA	2	10	171523	171532	40 %	0 %	40 %	20 %	222152362
105	NC_012004	GATTT	2	10	178370	178379	20 %	60 %	20 %	0 %	222152369
106	NC_012004	TTATG	2	10	178393	178402	20 %	60 %	20 %	0 %	222152369
107	NC_012004	TTGGC	2	10	178840	178849	0 %	40 %	40 %	20 %	222152369
108	NC_012004	AAGGC	2	10	180283	180292	40 %	0 %	40 %	20 %	222152371
109	NC_012004	GTTCA	2	10	181601	181610	20 %	40 %	20 %	20 %	222152373
110	NC_012004	TTGAA	2	10	182259	182268	40 %	40 %	20 %	0 %	222152373
111	NC_012004	ATATT	2	10	182634	182643	40 %	60 %	0 %	0 %	222152373
112	NC_012004	TACCA	2	10	182869	182878	40 %	20 %	0 %	40 %	222152373
113	NC_012004	ACCCT	2	10	184401	184410	20 %	20 %	0 %	60 %	222152375
114	NC_012004	AAATC	2	10	185167	185176	60 %	20 %	0 %	20 %	222152376
115	NC_012004	TTGGC	2	10	186384	186393	0 %	40 %	40 %	20 %	222152378
116	NC_012004	TTTGC	2	10	186741	186750	0 %	60 %	20 %	20 %	222152378
117	NC_012004	TTTAC	2	10	188861	188870	20 %	60 %	0 %	20 %	222152382
118	NC_012004	ATTGC	2	10	189884	189893	20 %	40 %	20 %	20 %	222152382
119	NC_012004	CAGCA	2	10	192211	192220	40 %	0 %	20 %	40 %	222152385
120	NC_012004	AATCC	2	10	194917	194926	40 %	20 %	0 %	40 %	222152388
121	NC_012004	ATGCA	2	10	195475	195484	40 %	20 %	20 %	20 %	222152389
122	NC_012004	GTATG	2	10	197243	197252	20 %	40 %	40 %	0 %	222152390
123	NC_012004	TGAAA	2	10	198916	198925	60 %	20 %	20 %	0 %	222152391
124	NC_012004	CTGGT	2	10	199594	199603	0 %	40 %	40 %	20 %	222152392
125	NC_012004	CCTTT	2	10	200129	200138	0 %	60 %	0 %	40 %	222152392
126	NC_012004	AACCC	2	10	200424	200433	40 %	0 %	0 %	60 %	222152392
127	NC_012004	GAACC	2	10	201390	201399	40 %	0 %	20 %	40 %	222152393
128	NC_012004	TAGTT	2	10	205254	205263	20 %	60 %	20 %	0 %	222152397
129	NC_012004	TCCCA	2	10	205595	205604	20 %	20 %	0 %	60 %	222152397
130	NC_012004	CTTTT	2	10	205960	205969	0 %	80 %	0 %	20 %	222152398
131	NC_012004	AATGA	2	10	209815	209824	60 %	20 %	20 %	0 %	222152404
132	NC_012004	ATATC	2	10	211852	211861	40 %	40 %	0 %	20 %	222152406
133	NC_012004	CAAGC	2	10	216406	216415	40 %	0 %	20 %	40 %	222152411
134	NC_012004	ATTAG	2	10	219726	219735	40 %	40 %	20 %	0 %	222152419
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260	NC_012004	TGGAT	2	10	434078	434087	20 %	40 %	40 %	0 %	222152620
261	NC_012004	AAGCA	2	10	439717	439726	60 %	0 %	20 %	20 %	222152628
262	NC_012004	AAATT	2	10	440941	440950	60 %	40 %	0 %	0 %	222152630
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