MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012004	ATAG	2	8	3451	3458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012004	TTTG	2	8	3470	3477	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012004	ACGA	2	8	17985	17992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012004	ACCT	2	8	18133	18140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012004	GTGA	2	8	18414	18421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012004	TAAC	2	8	18497	18504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012004	AGCG	2	8	18585	18592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012004	TGGT	2	8	19250	19257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012004	AGCC	2	8	19467	19474	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012004	GTAA	2	8	19981	19988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012004	GAAG	2	8	20063	20070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012004	GCGA	2	8	20137	20144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012004	ATTC	2	8	21003	21010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012004	GTAT	2	8	21325	21332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012004	CTAA	2	8	21355	21362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012004	ATAC	2	8	21509	21516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012004	TAGG	2	8	22012	22019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012004	TATT	2	8	24035	24042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012004	GCGT	2	8	24200	24207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012004	ATGT	2	8	32001	32008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012004	TGTT	2	8	41792	41799	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012004	AAAT	2	8	42534	42541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012004	AAAT	2	8	42566	42573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012004	TAGA	2	8	46629	46636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012004	CTTA	2	8	46649	46656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012004	TAAT	2	8	46690	46697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012004	CTGT	2	8	60363	60370	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012004	AAAG	2	8	60483	60490	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012004	TAAT	2	8	61980	61987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012004	GAAA	2	8	64318	64325	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012004	TTTA	2	8	71717	71724	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012004	ATTT	2	8	73034	73041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012004	AAAC	2	8	78776	78783	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012004	TAAA	2	8	79727	79734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012004	ATTA	2	8	81254	81261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012004	TAAA	2	8	85010	85017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012004	ACGA	2	8	88223	88230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012004	ACCT	2	8	88371	88378	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012004	GTGA	2	8	88652	88659	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012004	TAAC	2	8	88735	88742	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012004	AGCG	2	8	88823	88830	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012004	TGGT	2	8	89488	89495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012004	AGCC	2	8	89705	89712	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012004	GTAA	2	8	90219	90226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012004	GAAG	2	8	90301	90308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012004	GCGA	2	8	90375	90382	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012004	ATTC	2	8	91241	91248	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012004	GTAT	2	8	91563	91570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012004	CTAA	2	8	91593	91600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012004	ATAC	2	8	91747	91754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012004	TAGG	2	8	92250	92257	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012004	GCGT	2	8	93776	93783	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012004	GCTT	2	8	96759	96766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012004	TTAG	2	8	97002	97009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012004	TCAA	2	8	101003	101010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012004	AAGA	2	8	108098	108105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012004	AGAT	2	8	108120	108127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012004	GAAT	2	8	137613	137620	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012004	ACCT	2	8	138448	138455	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012004	TCAT	2	8	146704	146711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012004	ATTG	2	8	150880	150887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012004	AATA	2	8	150962	150969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012004	TAAA	2	8	158310	158317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012004	TTTG	2	8	158353	158360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012004	CCTT	2	8	160434	160441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012004	CTTA	2	8	160673	160680	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012004	GAAA	2	8	162199	162206	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012004	TGAA	2	8	165559	165566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012004	ATGG	2	8	167323	167330	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012004	CTAT	2	8	175176	175183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012004	GGTG	2	8	175199	175206	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012004	AAGA	2	8	179500	179507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012004	TAAT	2	8	180525	180532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012004	CTTT	2	8	184937	184944	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012004	TAAA	2	8	184998	185005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012004	AAGA	2	8	191164	191171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012004	CTTT	2	8	193047	193054	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012004	ATTT	2	8	207298	207305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012004	TAAA	2	8	207321	207328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012004	AAAG	2	8	208942	208949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012004	TAGA	2	8	212461	212468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012004	TAGC	2	8	212475	212482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012004	CAAG	2	8	212745	212752	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012004	GTAG	2	8	213044	213051	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012004	CTTG	2	8	218828	218835	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012004	GTCG	2	8	218879	218886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012004	ATTA	2	8	220508	220515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012004	CTTG	2	8	220533	220540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012004	GCTT	2	8	230639	230646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012004	TTGG	2	8	242018	242025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012004	AAGA	2	8	242163	242170	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012004	GTCA	2	8	242206	242213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012004	TCAT	2	8	242302	242309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012004	TCAA	2	8	243088	243095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012004	ACTA	2	8	254060	254067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012004	CCAT	2	8	254528	254535	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012004	AAAT	2	8	260010	260017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012004	TAAA	2	8	260851	260858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012004	GTCA	2	8	268672	268679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012004	AGAA	2	8	270429	270436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012004	AGTG	2	8	272624	272631	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012004	TCTT	2	8	272764	272771	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012004	TTTA	2	8	272820	272827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012004	ATTT	2	8	273444	273451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012004	ATCT	2	8	273689	273696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012004	AAAT	2	8	275609	275616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012004	ATTT	2	8	275622	275629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012004	GCAA	2	8	275640	275647	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012004	TCCC	2	8	275735	275742	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_012004	TTGT	2	8	276666	276673	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012004	AGCA	2	8	276826	276833	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012004	TAAA	2	8	276909	276916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012004	TTAA	2	8	281318	281325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012004	CAGG	2	8	289022	289029	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012004	ATTA	2	8	289371	289378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012004	GAAT	2	8	289483	289490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012004	TATT	2	8	289523	289530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012004	AGGA	2	8	289812	289819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012004	CTTT	2	8	289839	289846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_012004	TCTA	2	8	294432	294439	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012004	ATTA	2	8	297496	297503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012004	CTTT	2	8	303086	303093	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012004	ACGA	2	8	309087	309094	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012004	ACCT	2	8	309235	309242	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012004	GTGA	2	8	309516	309523	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012004	TAAC	2	8	309599	309606	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_012004	AGCG	2	8	309687	309694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012004	TGGT	2	8	310352	310359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012004	AGCC	2	8	310569	310576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_012004	GTAA	2	8	311083	311090	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012004	GAAG	2	8	311165	311172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012004	GCGA	2	8	311239	311246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012004	ATTC	2	8	312105	312112	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012004	GTAT	2	8	312427	312434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012004	CTAA	2	8	312457	312464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012004	ATAC	2	8	312611	312618	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012004	TAGG	2	8	313114	313121	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012004	TCTA	2	8	319477	319484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_012004	GTTT	2	8	324485	324492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012004	TCTT	2	8	324938	324945	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_012004	CTTT	2	8	325213	325220	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012004	CAAG	2	8	327434	327441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_012004	TCTT	2	8	327817	327824	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_012004	ATAA	2	8	333777	333784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012004	TCTA	2	8	336742	336749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012004	ATAA	2	8	338921	338928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012004	ATTA	2	8	345099	345106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012004	CGTT	2	8	345430	345437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012004	TTAG	2	8	349322	349329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012004	ACGA	2	8	349667	349674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_012004	ACCT	2	8	349815	349822	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_012004	GTGA	2	8	350096	350103	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_012004	TATT	2	8	1310182	1310189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_012004	AAAC	2	8	1323716	1323723	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
473	NC_012004	TCCA	2	8	1328971	1328978	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
474	NC_012004	TGAG	2	8	1329122	1329129	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_012004	AAAT	2	8	1339913	1339920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_012004	TTTA	2	8	1339981	1339988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_012004	TTTA	2	8	1341600	1341607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_012004	TTAT	2	8	1341638	1341645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_012004	AGCT	2	8	1346094	1346101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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487	NC_012004	CATT	2	8	1356391	1356398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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