MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 3979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012004	AAAC	2	8	61	68	75 %	0 %	0 %	25 %	222152202
2	NC_012004	ACAA	2	8	297	304	75 %	0 %	0 %	25 %	222152202
3	NC_012004	CTCG	2	8	1168	1175	0 %	25 %	25 %	50 %	222152202
4	NC_012004	TTTC	2	8	2222	2229	0 %	75 %	0 %	25 %	222152203
5	NC_012004	AGAT	2	8	2265	2272	50 %	25 %	25 %	0 %	222152203
6	NC_012004	AATT	2	8	2618	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	222152203
7	NC_012004	AGTT	2	8	3203	3210	25 %	50 %	25 %	0 %	222152205
8	NC_012004	ACTT	2	8	3280	3287	25 %	50 %	0 %	25 %	222152205
9	NC_012004	ATTT	2	8	3433	3440	25 %	75 %	0 %	0 %	222152205
10	NC_012004	ATTA	2	8	4193	4200	50 %	50 %	0 %	0 %	222152206
11	NC_012004	CAGA	2	8	4226	4233	50 %	0 %	25 %	25 %	222152206
12	NC_012004	ATCA	2	8	4868	4875	50 %	25 %	0 %	25 %	222152207
13	NC_012004	ATTT	2	8	5551	5558	25 %	75 %	0 %	0 %	222152208
14	NC_012004	TTAT	2	8	5695	5702	25 %	75 %	0 %	0 %	222152208
15	NC_012004	TGAA	2	8	5934	5941	50 %	25 %	25 %	0 %	222152208
16	NC_012004	ATTT	2	8	6109	6116	25 %	75 %	0 %	0 %	222152208
17	NC_012004	GACG	2	8	6956	6963	25 %	0 %	50 %	25 %	222152208
18	NC_012004	AAAG	2	8	7325	7332	75 %	0 %	25 %	0 %	222152208
19	NC_012004	TTGA	2	8	7877	7884	25 %	50 %	25 %	0 %	222152208
20	NC_012004	CTTA	2	8	8052	8059	25 %	50 %	0 %	25 %	222152208
21	NC_012004	ATAG	2	8	8444	8451	50 %	25 %	25 %	0 %	222152208
22	NC_012004	ATTT	2	8	9143	9150	25 %	75 %	0 %	0 %	222152209
23	NC_012004	TGTT	2	8	9254	9261	0 %	75 %	25 %	0 %	222152209
24	NC_012004	TCTT	2	8	9687	9694	0 %	75 %	0 %	25 %	222152209
25	NC_012004	TGTA	2	8	10040	10047	25 %	50 %	25 %	0 %	222152209
26	NC_012004	TACC	2	8	10233	10240	25 %	25 %	0 %	50 %	222152209
27	NC_012004	AAGA	2	8	10489	10496	75 %	0 %	25 %	0 %	222152210
28	NC_012004	CAAT	2	8	10576	10583	50 %	25 %	0 %	25 %	222152211
29	NC_012004	TATT	2	8	10680	10687	25 %	75 %	0 %	0 %	222152211
30	NC_012004	TTAT	2	8	10884	10891	25 %	75 %	0 %	0 %	222152211
31	NC_012004	ATTT	2	8	11356	11363	25 %	75 %	0 %	0 %	222152213
32	NC_012004	GTTG	2	8	11421	11428	0 %	50 %	50 %	0 %	222152213
33	NC_012004	CATT	2	8	12252	12259	25 %	50 %	0 %	25 %	222152213
34	NC_012004	TATT	2	8	12316	12323	25 %	75 %	0 %	0 %	222152213
35	NC_012004	TATT	2	8	13448	13455	25 %	75 %	0 %	0 %	222152214
36	NC_012004	TGGT	2	8	13734	13741	0 %	50 %	50 %	0 %	222152215
37	NC_012004	CCTT	2	8	14119	14126	0 %	50 %	0 %	50 %	222152215
38	NC_012004	ATTA	2	8	14306	14313	50 %	50 %	0 %	0 %	222152216
39	NC_012004	CAAA	2	8	14326	14333	75 %	0 %	0 %	25 %	222152216
40	NC_012004	GTTC	2	8	14984	14991	0 %	50 %	25 %	25 %	222152216
41	NC_012004	GGTA	2	8	15241	15248	25 %	25 %	50 %	0 %	222152216
42	NC_012004	TGAT	2	8	15906	15913	25 %	50 %	25 %	0 %	222152216
43	NC_012004	AATT	2	8	15990	15997	50 %	50 %	0 %	0 %	222152216
44	NC_012004	TTTC	2	8	24828	24835	0 %	75 %	0 %	25 %	222152218
45	NC_012004	ACTA	2	8	25267	25274	50 %	25 %	0 %	25 %	222152218
46	NC_012004	TTTA	3	12	25921	25932	25 %	75 %	0 %	0 %	222152219
47	NC_012004	CTTT	2	8	25985	25992	0 %	75 %	0 %	25 %	222152219
48	NC_012004	ACAT	2	8	26524	26531	50 %	25 %	0 %	25 %	222152220
49	NC_012004	ATAC	2	8	27131	27138	50 %	25 %	0 %	25 %	222152220
50	NC_012004	TGGT	2	8	27396	27403	0 %	50 %	50 %	0 %	222152220
51	NC_012004	CAGT	2	8	27821	27828	25 %	25 %	25 %	25 %	222152221
52	NC_012004	TGAT	2	8	28241	28248	25 %	50 %	25 %	0 %	222152221
53	NC_012004	TGAT	2	8	28421	28428	25 %	50 %	25 %	0 %	222152221
54	NC_012004	TTGA	2	8	28819	28826	25 %	50 %	25 %	0 %	222152222
55	NC_012004	CTTA	2	8	28870	28877	25 %	50 %	0 %	25 %	222152222
56	NC_012004	GTGA	2	8	29221	29228	25 %	25 %	50 %	0 %	222152222
57	NC_012004	TGAA	2	8	29964	29971	50 %	25 %	25 %	0 %	222152223
58	NC_012004	ATTT	2	8	30033	30040	25 %	75 %	0 %	0 %	222152223
59	NC_012004	AATG	2	8	30230	30237	50 %	25 %	25 %	0 %	222152223
60	NC_012004	TTAT	3	12	30351	30362	25 %	75 %	0 %	0 %	222152223
61	NC_012004	GTTT	2	8	30978	30985	0 %	75 %	25 %	0 %	222152224
62	NC_012004	CATT	2	8	31472	31479	25 %	50 %	0 %	25 %	222152224
63	NC_012004	GTAC	2	8	31586	31593	25 %	25 %	25 %	25 %	222152224
64	NC_012004	CCAA	2	8	32051	32058	50 %	0 %	0 %	50 %	222152226
65	NC_012004	TAAA	2	8	32282	32289	75 %	25 %	0 %	0 %	222152226
66	NC_012004	ATTG	2	8	32559	32566	25 %	50 %	25 %	0 %	222152226
67	NC_012004	TTCT	2	8	33024	33031	0 %	75 %	0 %	25 %	222152227
68	NC_012004	TTAT	2	8	33214	33221	25 %	75 %	0 %	0 %	222152227
69	NC_012004	GTTT	2	8	34275	34282	0 %	75 %	25 %	0 %	222152227
70	NC_012004	GATT	2	8	34378	34385	25 %	50 %	25 %	0 %	222152227
71	NC_012004	ACAA	2	8	35222	35229	75 %	0 %	0 %	25 %	222152227
72	NC_012004	AATC	2	8	35449	35456	50 %	25 %	0 %	25 %	222152227
73	NC_012004	TGAA	2	8	35838	35845	50 %	25 %	25 %	0 %	222152227
74	NC_012004	CCAA	2	8	36138	36145	50 %	0 %	0 %	50 %	222152227
75	NC_012004	CATC	2	8	36837	36844	25 %	25 %	0 %	50 %	222152228
76	NC_012004	ATTG	2	8	37099	37106	25 %	50 %	25 %	0 %	222152228
77	NC_012004	CCAA	2	8	37543	37550	50 %	0 %	0 %	50 %	222152228
78	NC_012004	AATT	2	8	37779	37786	50 %	50 %	0 %	0 %	222152228
79	NC_012004	ACCT	2	8	37841	37848	25 %	25 %	0 %	50 %	222152228
80	NC_012004	TGAT	2	8	37863	37870	25 %	50 %	25 %	0 %	222152228
81	NC_012004	GCTA	2	8	38767	38774	25 %	25 %	25 %	25 %	222152229
82	NC_012004	CATT	2	8	39115	39122	25 %	50 %	0 %	25 %	222152229
83	NC_012004	TTGT	2	8	39803	39810	0 %	75 %	25 %	0 %	222152230
84	NC_012004	CATT	2	8	39963	39970	25 %	50 %	0 %	25 %	222152230
85	NC_012004	ACTT	2	8	40806	40813	25 %	50 %	0 %	25 %	222152231
86	NC_012004	GCTA	2	8	41211	41218	25 %	25 %	25 %	25 %	222152231
87	NC_012004	CAAA	2	8	41503	41510	75 %	0 %	0 %	25 %	222152231
88	NC_012004	TGTT	2	8	44366	44373	0 %	75 %	25 %	0 %	222152233
89	NC_012004	TATT	2	8	44733	44740	25 %	75 %	0 %	0 %	222152233
90	NC_012004	CAAA	2	8	44784	44791	75 %	0 %	0 %	25 %	222152234
91	NC_012004	TTTG	2	8	44843	44850	0 %	75 %	25 %	0 %	222152234
92	NC_012004	TATT	2	8	45110	45117	25 %	75 %	0 %	0 %	222152234
93	NC_012004	TATT	2	8	45557	45564	25 %	75 %	0 %	0 %	222152235
94	NC_012004	TATT	2	8	45596	45603	25 %	75 %	0 %	0 %	222152235
95	NC_012004	ATTT	2	8	45663	45670	25 %	75 %	0 %	0 %	222152235
96	NC_012004	AGAA	2	8	45742	45749	75 %	0 %	25 %	0 %	222152235
97	NC_012004	CTTT	2	8	46177	46184	0 %	75 %	0 %	25 %	222152236
98	NC_012004	ATAG	2	8	46206	46213	50 %	25 %	25 %	0 %	222152236
99	NC_012004	GTTG	2	8	46773	46780	0 %	50 %	50 %	0 %	222152237
100	NC_012004	TTAT	2	8	47073	47080	25 %	75 %	0 %	0 %	222152237
101	NC_012004	AGAA	2	8	47163	47170	75 %	0 %	25 %	0 %	222152237
102	NC_012004	CAAC	2	8	47452	47459	50 %	0 %	0 %	50 %	222152237
103	NC_012004	ATAA	2	8	47461	47468	75 %	25 %	0 %	0 %	222152237
104	NC_012004	TTTC	2	8	47596	47603	0 %	75 %	0 %	25 %	222152238
105	NC_012004	AAAG	2	8	47608	47615	75 %	0 %	25 %	0 %	222152238
106	NC_012004	AGGA	2	8	47939	47946	50 %	0 %	50 %	0 %	222152238
107	NC_012004	TTTA	2	8	48200	48207	25 %	75 %	0 %	0 %	222152238
108	NC_012004	CATT	2	8	48648	48655	25 %	50 %	0 %	25 %	222152238
109	NC_012004	ACTT	2	8	50281	50288	25 %	50 %	0 %	25 %	222152240
110	NC_012004	GGTT	2	8	51269	51276	0 %	50 %	50 %	0 %	222152241
111	NC_012004	TTGA	2	8	51878	51885	25 %	50 %	25 %	0 %	222152241
112	NC_012004	ACTG	2	8	51916	51923	25 %	25 %	25 %	25 %	222152241
113	NC_012004	TTTG	2	8	52079	52086	0 %	75 %	25 %	0 %	222152241
114	NC_012004	TCAA	2	8	52725	52732	50 %	25 %	0 %	25 %	222152242
115	NC_012004	TTAC	2	8	53440	53447	25 %	50 %	0 %	25 %	222152243
116	NC_012004	AAAT	2	8	53752	53759	75 %	25 %	0 %	0 %	222152244
117	NC_012004	TGGT	2	8	54286	54293	0 %	50 %	50 %	0 %	222152244
118	NC_012004	GGCC	2	8	55525	55532	0 %	0 %	50 %	50 %	222152246
119	NC_012004	ATTA	2	8	56727	56734	50 %	50 %	0 %	0 %	222152248
120	NC_012004	ATGG	2	8	56869	56876	25 %	25 %	50 %	0 %	222152248
121	NC_012004	TTTA	2	8	57001	57008	25 %	75 %	0 %	0 %	222152249
122	NC_012004	TCTT	2	8	57067	57074	0 %	75 %	0 %	25 %	222152249
123	NC_012004	TTGA	2	8	57616	57623	25 %	50 %	25 %	0 %	222152250
124	NC_012004	TGAT	2	8	58178	58185	25 %	50 %	25 %	0 %	222152250
125	NC_012004	AGAA	2	8	59814	59821	75 %	0 %	25 %	0 %	222152252
126	NC_012004	CTGG	2	8	59957	59964	0 %	25 %	50 %	25 %	222152252
127	NC_012004	AATA	2	8	60675	60682	75 %	25 %	0 %	0 %	222152253
128	NC_012004	ACAA	2	8	60940	60947	75 %	0 %	0 %	25 %	222152253
129	NC_012004	GAAA	2	8	62048	62055	75 %	0 %	25 %	0 %	222152254
130	NC_012004	ATTT	2	8	62621	62628	25 %	75 %	0 %	0 %	222152254
131	NC_012004	TGTC	2	8	62709	62716	0 %	50 %	25 %	25 %	222152254
132	NC_012004	TATT	2	8	62757	62764	25 %	75 %	0 %	0 %	222152254
133	NC_012004	AAAC	2	8	63419	63426	75 %	0 %	0 %	25 %	222152256
134	NC_012004	TATT	2	8	63498	63505	25 %	75 %	0 %	0 %	222152256
135	NC_012004	GAAA	2	8	63898	63905	75 %	0 %	25 %	0 %	222152256
136	NC_012004	TGGT	2	8	65163	65170	0 %	50 %	50 %	0 %	222152258
137	NC_012004	TACT	2	8	65620	65627	25 %	50 %	0 %	25 %	222152259
138	NC_012004	TATT	2	8	65703	65710	25 %	75 %	0 %	0 %	222152259
139	NC_012004	CTTT	2	8	65833	65840	0 %	75 %	0 %	25 %	222152259
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141	NC_012004	ATTT	2	8	66052	66059	25 %	75 %	0 %	0 %	222152259
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