MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 25340

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012004	CAG	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152202
2	NC_012004	GAT	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152202
3	NC_012004	GAA	2	6	265	270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152202
4	NC_012004	TGA	2	6	372	377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152202
5	NC_012004	TTA	2	6	481	486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152202
6	NC_012004	CAG	2	6	545	550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152202
7	NC_012004	GAA	2	6	688	693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152202
8	NC_012004	AAT	3	9	721	729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152202
9	NC_012004	AAC	2	6	782	787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152202
10	NC_012004	CTC	2	6	830	835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222152202
11	NC_012004	TGC	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152202
12	NC_012004	GAA	2	6	1084	1089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152202
13	NC_012004	TGG	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152202
14	NC_012004	TAA	2	6	1278	1283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152202
15	NC_012004	AAC	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012004	CTA	5	15	1464	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012004	CAA	2	6	1604	1609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152203
18	NC_012004	ATT	2	6	1762	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152203
19	NC_012004	AAC	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152203
20	NC_012004	AGT	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152203
21	NC_012004	AAG	2	6	1889	1894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152203
22	NC_012004	GCT	2	6	1963	1968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152203
23	NC_012004	ATT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152203
24	NC_012004	TGT	2	6	2109	2114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152203
25	NC_012004	TTC	2	6	2142	2147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152203
26	NC_012004	GAT	2	6	2158	2163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152203
27	NC_012004	TTA	2	6	2239	2244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152203
28	NC_012004	GAG	2	6	2446	2451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222152203
29	NC_012004	TTG	2	6	2459	2464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152203
30	NC_012004	TGA	3	9	2595	2603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152203
31	NC_012004	TCA	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152204
32	NC_012004	ATC	2	6	2724	2729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152204
33	NC_012004	TAG	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152204
34	NC_012004	ATG	2	6	2864	2869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152204
35	NC_012004	TTC	2	6	3064	3069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152205
36	NC_012004	AAG	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152205
37	NC_012004	AAC	2	6	3106	3111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152205
38	NC_012004	GAT	2	6	3252	3257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152205
39	NC_012004	GAA	2	6	3258	3263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152205
40	NC_012004	GAT	2	6	3264	3269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152205
41	NC_012004	ATA	2	6	3363	3368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152205
42	NC_012004	TGG	2	6	3378	3383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152205
43	NC_012004	TTA	2	6	3415	3420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152205
44	NC_012004	TAA	2	6	3483	3488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012004	TTG	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152206
46	NC_012004	GCT	2	6	3608	3613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152206
47	NC_012004	ATT	2	6	3695	3700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152206
48	NC_012004	TGA	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152206
49	NC_012004	TGA	2	6	3877	3882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152206
50	NC_012004	TAA	2	6	3955	3960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152206
51	NC_012004	AGA	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152206
52	NC_012004	AGA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152206
53	NC_012004	AAC	2	6	4129	4134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152206
54	NC_012004	TGA	2	6	4186	4191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152206
55	NC_012004	AGT	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152206
56	NC_012004	GAA	3	9	4268	4276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152206
57	NC_012004	GAT	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152206
58	NC_012004	TGC	2	6	4360	4365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152206
59	NC_012004	CTG	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152206
60	NC_012004	AAG	2	6	4410	4415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152206
61	NC_012004	CTC	2	6	4449	4454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222152206
62	NC_012004	AGC	2	6	4456	4461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152206
63	NC_012004	ATT	2	6	4466	4471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152206
64	NC_012004	GAT	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152206
65	NC_012004	GTC	2	6	4566	4571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152206
66	NC_012004	GAA	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152206
67	NC_012004	ATA	2	6	4642	4647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012004	ATA	2	6	4707	4712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152207
69	NC_012004	ATA	2	6	4758	4763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152207
70	NC_012004	ATA	2	6	4770	4775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152207
71	NC_012004	AGA	2	6	4828	4833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152207
72	NC_012004	TTA	2	6	4940	4945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152207
73	NC_012004	GAT	2	6	4988	4993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152207
74	NC_012004	GGT	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152207
75	NC_012004	ATT	2	6	5066	5071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152207
76	NC_012004	GAC	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152207
77	NC_012004	TTA	2	6	5142	5147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152207
78	NC_012004	GAC	2	6	5177	5182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152207
79	NC_012004	ATT	3	9	5226	5234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152207
80	NC_012004	ATT	2	6	5362	5367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152208
81	NC_012004	GCA	2	6	5405	5410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152208
82	NC_012004	GTA	2	6	5441	5446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
83	NC_012004	GAA	2	6	5504	5509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152208
84	NC_012004	GAT	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
85	NC_012004	GCA	2	6	5540	5545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152208
86	NC_012004	GAT	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
87	NC_012004	TAA	2	6	5634	5639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152208
88	NC_012004	AAC	2	6	5752	5757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152208
89	NC_012004	TTA	2	6	5988	5993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152208
90	NC_012004	AAT	2	6	6002	6007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152208
91	NC_012004	ATG	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
92	NC_012004	ATT	2	6	6062	6067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152208
93	NC_012004	ATT	2	6	6118	6123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152208
94	NC_012004	TGA	2	6	6181	6186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
95	NC_012004	GAT	2	6	6248	6253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
96	NC_012004	TGA	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
97	NC_012004	TCA	2	6	6385	6390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152208
98	NC_012004	TGA	2	6	6442	6447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
99	NC_012004	TAA	2	6	6480	6485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152208
100	NC_012004	TGA	2	6	6634	6639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
101	NC_012004	TGT	2	6	6763	6768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152208
102	NC_012004	TAA	2	6	6943	6948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152208
103	NC_012004	GAT	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
104	NC_012004	CAA	2	6	7046	7051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152208
105	NC_012004	GAT	3	9	7073	7081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
106	NC_012004	TGA	3	9	7096	7104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
107	NC_012004	TAT	2	6	7141	7146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152208
108	NC_012004	ATC	2	6	7173	7178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152208
109	NC_012004	CTC	2	6	7190	7195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222152208
110	NC_012004	GCA	2	6	7238	7243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152208
111	NC_012004	CTA	2	6	7287	7292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152208
112	NC_012004	CAA	2	6	7304	7309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152208
113	NC_012004	ATT	3	9	7433	7441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152208
114	NC_012004	CTT	2	6	7454	7459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152208
115	NC_012004	TGA	2	6	7501	7506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
116	NC_012004	CAA	2	6	7656	7661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152208
117	NC_012004	GGT	2	6	7742	7747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152208
118	NC_012004	TAA	2	6	7765	7770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152208
119	NC_012004	AAG	2	6	7787	7792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152208
120	NC_012004	TTA	2	6	7887	7892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152208
121	NC_012004	CTA	2	6	7917	7922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152208
122	NC_012004	ATT	2	6	7925	7930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152208
123	NC_012004	TTG	2	6	7968	7973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152208
124	NC_012004	TGA	2	6	8404	8409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152208
125	NC_012004	ATT	2	6	8418	8423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152208
126	NC_012004	TTG	2	6	8526	8531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152208
127	NC_012004	AAT	2	6	8554	8559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152208
128	NC_012004	TAC	2	6	8591	8596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152208
129	NC_012004	AAT	2	6	8657	8662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152208
130	NC_012004	AGA	2	6	8716	8721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152208
131	NC_012004	TTA	2	6	8800	8805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152209
132	NC_012004	GCT	2	6	8835	8840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152209
133	NC_012004	TAT	2	6	8918	8923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152209
134	NC_012004	ATA	2	6	9018	9023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152209
135	NC_012004	ACA	2	6	9027	9032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152209
136	NC_012004	TAT	2	6	9034	9039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152209
137	NC_012004	TAA	2	6	9059	9064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152209
138	NC_012004	GTC	2	6	9088	9093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152209
139	NC_012004	ATC	2	6	9108	9113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152209
140	NC_012004	TAT	2	6	9127	9132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152209
141	NC_012004	TTA	2	6	9223	9228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152209
142	NC_012004	TTA	2	6	9235	9240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152209
143	NC_012004	AGC	2	6	9248	9253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152209
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149	NC_012004	ATA	2	6	9778	9783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152209
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153	NC_012004	ATT	2	6	10108	10113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152209
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155	NC_012004	TAT	2	6	10320	10325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152210
156	NC_012004	AAG	2	6	10346	10351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152210
157	NC_012004	ATG	2	6	10418	10423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152210
158	NC_012004	TAA	2	6	10443	10448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152210
159	NC_012004	ATT	2	6	10449	10454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152210
160	NC_012004	ATT	2	6	10519	10524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152210
161	NC_012004	GAA	2	6	10549	10554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152210
162	NC_012004	GAA	2	6	10622	10627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152211
163	NC_012004	ATG	2	6	10670	10675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152211
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166	NC_012004	ATT	2	6	10903	10908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152211
167	NC_012004	ATA	2	6	10915	10920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152211
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169	NC_012004	AGA	2	6	11009	11014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152212
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171	NC_012004	TTA	2	6	11106	11111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152213
172	NC_012004	TCA	2	6	11149	11154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152213
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174	NC_012004	AAT	2	6	11300	11305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152213
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176	NC_012004	AAC	2	6	11395	11400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152213
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184	NC_012004	TAT	2	6	11975	11980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152213
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243	NC_012004	GAT	2	6	15665	15670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152216
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247	NC_012004	ACA	2	6	15737	15742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152216
248	NC_012004	ATG	2	6	15851	15856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152216
249	NC_012004	TTC	2	6	15886	15891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152216
250	NC_012004	TTA	2	6	15929	15934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152216
251	NC_012004	GCT	2	6	15953	15958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152216
252	NC_012004	ATT	2	6	15962	15967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152216
253	NC_012004	TGC	2	6	16030	16035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152216
254	NC_012004	AGA	2	6	16087	16092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152216
255	NC_012004	GAA	2	6	16118	16123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152216
256	NC_012004	GAA	3	9	16142	16150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152216
257	NC_012004	TTA	2	6	16226	16231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_012004	TAT	2	6	16251	16256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_012004	TGC	2	6	16392	16397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152217
260	NC_012004	ATT	2	6	16429	16434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152217
261	NC_012004	TGG	2	6	16503	16508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152217
262	NC_012004	TAT	3	9	16569	16577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152217
263	NC_012004	TTC	2	6	16715	16720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152217
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266	NC_012004	GGT	2	6	16906	16911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152217
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270	NC_012004	TAT	2	6	17095	17100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152217
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277	NC_012004	TAA	2	6	17762	17767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_012004	ATA	2	6	17854	17859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_012004	GGC	2	6	18042	18047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_012004	CGA	2	6	18287	18292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_012004	GCA	2	6	18361	18366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_012004	CGC	2	6	18408	18413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_012004	TGT	2	6	18447	18452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_012004	CAG	2	6	18530	18535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_012004	GGA	2	6	18720	18725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
287	NC_012004	GAA	2	6	18984	18989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_012004	GGT	2	6	19058	19063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
289	NC_012004	GTC	2	6	19072	19077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NC_012004	TAA	2	6	19175	19180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_012004	GGA	2	6	19184	19189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
293	NC_012004	ATC	2	6	19208	19213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_012004	CGC	2	6	19374	19379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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388	NC_012004	GCA	4	12	27226	27237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152220
389	NC_012004	TGG	3	9	27288	27296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152220
390	NC_012004	ATC	2	6	27330	27335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152220
391	NC_012004	GCA	2	6	27430	27435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152220
392	NC_012004	GGA	2	6	27555	27560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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