MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL6

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012001	TCC	2	6	126	131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_012001	AGA	2	6	183	188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012001	GAA	2	6	280	285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012001	ATT	2	6	482	487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012001	CAG	2	6	515	520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012001	CAG	2	6	590	595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012001	ACT	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012001	AGA	2	6	716	721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012001	TAA	2	6	764	769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012001	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012001	TTG	2	6	844	849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012001	GAG	2	6	1119	1124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012001	CAA	2	6	1155	1160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143331
14	NC_012001	AGT	2	6	1170	1175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143331
15	NC_012001	TAT	2	6	1415	1420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143331
16	NC_012001	TAG	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143331
17	NC_012001	AGA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143331
18	NC_012001	GAA	2	6	1651	1656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143331
19	NC_012001	AGT	2	6	1800	1805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143331
20	NC_012001	ACT	2	6	1853	1858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143331
21	NC_012001	CAA	2	6	1912	1917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143331
22	NC_012001	TGA	2	6	1929	1934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143331
23	NC_012001	GAA	3	9	1942	1950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143331
24	NC_012001	GAT	2	6	2092	2097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012001	ACC	2	6	2102	2107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_012001	GAG	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012001	AGA	2	6	2163	2168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143332
28	NC_012001	CTG	2	6	2191	2196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143332
29	NC_012001	CTT	2	6	2236	2241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143332
30	NC_012001	GAA	3	9	2328	2336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143332
31	NC_012001	GAT	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143332
32	NC_012001	CGT	2	6	2368	2373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143332
33	NC_012001	ATT	2	6	2429	2434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143332
34	NC_012001	AGG	2	6	2712	2717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012001	CTG	2	6	2793	2798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012001	ATA	2	6	2814	2819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012001	ATT	2	6	2844	2849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012001	TAT	2	6	2858	2863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012001	TGT	2	6	2902	2907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012001	TGA	2	6	2927	2932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012001	AGG	2	6	2973	2978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012001	ATT	2	6	3105	3110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143333
43	NC_012001	AGA	2	6	3239	3244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143333
44	NC_012001	GTT	2	6	3255	3260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143333
45	NC_012001	CAA	2	6	3319	3324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143333
46	NC_012001	AAG	2	6	3386	3391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012001	GGA	2	6	3429	3434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012001	ATA	2	6	3607	3612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143334
49	NC_012001	GAA	2	6	3672	3677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143334
50	NC_012001	GAA	2	6	3687	3692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143334
51	NC_012001	TGG	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222143334
52	NC_012001	TGA	2	6	3881	3886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143334
53	NC_012001	TGA	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143334

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.