MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL5

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012000	TAA	2	6	81	86	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012000	ATT	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012000	ATA	2	6	125	130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012000	TCT	2	6	135	140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012000	AAT	2	6	227	232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012000	AAT	2	6	415	420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012000	TCT	2	6	427	432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012000	AAT	2	6	448	453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012000	AAT	2	6	582	587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012000	TTC	2	6	832	837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143326
11	NC_012000	AAT	2	6	933	938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
12	NC_012000	TAA	2	6	1041	1046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
13	NC_012000	ATA	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
14	NC_012000	CAT	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143326
15	NC_012000	ATG	2	6	1217	1222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143326
16	NC_012000	TTC	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143326
17	NC_012000	TTA	2	6	1259	1264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143326
18	NC_012000	TTA	2	6	1439	1444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143326
19	NC_012000	CAA	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143326
20	NC_012000	ATA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
21	NC_012000	TCT	2	6	1586	1591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143326
22	NC_012000	AAG	2	6	1631	1636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012000	GAA	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012000	CTT	2	6	1774	1779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012000	ACT	3	9	1918	1926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012000	TCT	2	6	1958	1963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012000	TTC	2	6	1972	1977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012000	TTG	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012000	TAA	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143327
30	NC_012000	AAT	2	6	2407	2412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143327
31	NC_012000	TTC	2	6	2475	2480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
32	NC_012000	TCT	2	6	2521	2526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
33	NC_012000	TCC	2	6	2602	2607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222143327
34	NC_012000	GTC	2	6	2608	2613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143327
35	NC_012000	TGT	2	6	2662	2667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143327
36	NC_012000	TTA	2	6	2690	2695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143327
37	NC_012000	TTC	2	6	2727	2732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
38	NC_012000	TCT	2	6	2744	2749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
39	NC_012000	TTC	3	9	2812	2820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
40	NC_012000	TCT	2	6	2912	2917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
41	NC_012000	TTC	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
42	NC_012000	TTC	2	6	3025	3030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
43	NC_012000	TGA	2	6	3112	3117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143328
44	NC_012000	TTC	2	6	3142	3147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
45	NC_012000	GTT	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143328
46	NC_012000	TTG	2	6	3206	3211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143328
47	NC_012000	TAA	3	9	3234	3242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143328
48	NC_012000	TTC	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
49	NC_012000	GTT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143328
50	NC_012000	CAT	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143329
51	NC_012000	TCT	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143329
52	NC_012000	TAC	2	6	3674	3679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143329
53	NC_012000	CAC	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_012000	CGT	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012000	TAA	2	6	4195	4200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012000	ATT	2	6	4215	4220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012000	AAT	2	6	4292	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012000	AAT	2	6	4303	4308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012000	CAA	2	6	4312	4317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.