MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011999	CTATTA	2	12	1791	1802	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011999	AATTTA	2	12	15994	16005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011999	GGTGGC	2	12	21200	21211	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011999	TTTTTA	2	12	31752	31763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011999	TTTATC	2	12	60537	60548	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011999	TATTTT	2	12	103229	103240	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011999	AGTACG	2	12	130167	130178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011999	ATCAAT	2	12	137387	137398	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011999	TATATC	2	12	162242	162253	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011999	ATTAAA	2	12	201162	201173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011999	TACACA	2	12	217563	217574	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011999	TAGATA	2	12	225153	225164	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011999	ATAAAA	2	12	264682	264693	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011999	TATAAT	2	12	264988	264999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011999	ATATTA	2	12	280353	280364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011999	ATTAAA	2	12	285208	285219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011999	ACCTTC	2	12	297150	297161	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011999	ACCTTC	2	12	297642	297653	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011999	GCATAT	2	12	299284	299295	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011999	ATTGAC	2	12	327755	327766	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011999	AGTTTA	2	12	338123	338134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011999	TTATAA	2	12	351438	351449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011999	ATAATT	2	12	357164	357175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011999	AATATT	2	12	380973	380984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011999	ATAGTA	2	12	383317	383328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011999	ATAAAA	2	12	418841	418852	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011999	AAATAT	2	12	456700	456711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011999	TAAAAA	2	12	511626	511637	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011999	TTTATT	2	12	527161	527172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011999	CAATTA	2	12	530857	530868	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011999	GTTATT	2	12	538149	538160	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011999	ATTTTT	2	12	553254	553265	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011999	ACAAGC	2	12	571097	571108	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011999	ATAAAA	2	12	600965	600976	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011999	TTCAAC	2	12	601021	601032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011999	AGTGTA	2	12	656184	656195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011999	TTTAAT	2	12	656302	656313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011999	AGTCAT	2	12	685220	685231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011999	TGATTA	2	12	851696	851707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011999	AAATAA	2	12	851756	851767	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011999	AATATT	2	12	908426	908437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011999	TAAACA	2	12	936887	936898	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011999	CTTTAT	2	12	1002804	1002815	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011999	CATTAA	2	12	1019298	1019309	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011999	AATCAA	2	12	1082499	1082510	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011999	CTTTTT	2	12	1083030	1083041	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011999	TTGCAA	2	12	1083109	1083120	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011999	TGTTAT	2	12	1085035	1085046	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011999	TTGGAT	2	12	1099636	1099647	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011999	TTCATT	2	12	1108206	1108217	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011999	TAGTTT	2	12	1118660	1118671	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011999	AGCTGC	2	12	1120199	1120210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011999	CAAATA	2	12	1140237	1140248	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011999	CATTTT	2	12	1177479	1177490	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_011999	TCATTT	2	12	1180362	1180373	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011999	AAAAAG	2	12	1228988	1228999	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011999	TCCTTC	2	12	1244524	1244535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011999	CCATAT	2	12	1250036	1250047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011999	TAAAAA	2	12	1280776	1280787	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011999	AAACAA	2	12	1309831	1309842	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_011999	TTTACG	2	12	1328376	1328387	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011999	TTGACT	2	12	1333002	1333013	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011999	ATTTGG	2	12	1341255	1341266	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011999	TATGCA	2	12	1373376	1373387	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011999	AAATTT	2	12	1423921	1423932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011999	TTATTT	2	12	1439510	1439521	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011999	ATTTAT	2	12	1464075	1464086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011999	TCTTTA	2	12	1481459	1481470	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011999	AGAGAT	2	12	1515333	1515344	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011999	ATATTT	2	12	1519453	1519464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011999	ATAAAA	2	12	1547919	1547930	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011999	TTACAA	2	12	1593916	1593927	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011999	ATATAA	2	12	1595799	1595810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011999	ATTCTT	2	12	1605393	1605404	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_011999	CAATAT	2	12	1614582	1614593	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011999	TTAAAC	2	12	1639454	1639465	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011999	TTATTT	2	12	1667417	1667428	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011999	TTTTTA	2	12	1710950	1710961	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011999	TACACC	2	12	1717152	1717163	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011999	CTTGAT	2	12	1720744	1720755	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011999	ATGTCA	2	12	1722471	1722482	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_011999	ATGATA	2	12	1758633	1758644	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011999	GACTGG	2	12	1805202	1805213	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_011999	AAATAT	2	12	1840198	1840209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011999	TTTATC	2	12	1843903	1843914	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_011999	CTTGAT	2	12	1863491	1863502	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_011999	ATGTCA	2	12	1865218	1865229	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_011999	TAAAAA	2	12	1889538	1889549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011999	GAATCT	2	12	1895300	1895311	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_011999	AAAATT	2	12	1902379	1902390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011999	TAAAAA	2	12	1908011	1908022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011999	AAGGGA	2	12	1931814	1931825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011999	AATTCT	2	12	1987939	1987950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_011999	TTTTCA	2	12	1990383	1990394	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_011999	CATTTT	2	12	2006697	2006708	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011999	TATTTA	2	12	2010841	2010852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011999	TTAATT	2	12	2049645	2049656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011999	ATGTCA	2	12	2070016	2070027	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_011999	ACAAGC	2	12	2075785	2075796	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011999	TTACTT	2	12	2080948	2080959	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011999	TTTTAA	2	12	2081277	2081288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011999	TAAAGA	2	12	2081914	2081925	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011999	ATTAAT	2	12	2088042	2088053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011999	TAGATA	2	12	2091651	2091662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.