MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402

Total Repeats: 308

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011999	ATTGA	2	10	16135	16144	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011999	TAAAA	2	10	24823	24832	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011999	ATGAG	2	10	26162	26171	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011999	GTAAA	2	10	36344	36353	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011999	ATGTT	2	10	38406	38415	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011999	CTTTT	2	10	54353	54362	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011999	TATAA	2	10	63897	63906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011999	ATTGT	2	10	71981	71990	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011999	TTTAT	2	10	72139	72148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011999	GTAAG	2	10	81287	81296	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011999	AGAGA	2	10	87714	87723	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011999	TAATA	2	10	99075	99084	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011999	ATCGA	2	10	104418	104427	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011999	ATAAA	2	10	118291	118300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011999	TAGTA	2	10	124009	124018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011999	ATAAA	2	10	128007	128016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011999	TATCA	2	10	139834	139843	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011999	CATAA	2	10	139853	139862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011999	TAGTA	2	10	162304	162313	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011999	AATTA	2	10	163545	163554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011999	ATATT	2	10	174342	174351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011999	AGTGG	2	10	174398	174407	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011999	AATAG	2	10	177954	177963	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011999	ATATG	2	10	181795	181804	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011999	CTTTA	2	10	182013	182022	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011999	GAAAG	2	10	182067	182076	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011999	AATAT	2	10	183788	183797	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011999	ACTAT	2	10	187960	187969	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011999	TTACG	2	10	214885	214894	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011999	TATGT	2	10	227300	227309	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011999	TAAAA	2	10	245112	245121	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011999	GAAAA	2	10	245243	245252	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011999	TGAAG	2	10	249358	249367	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011999	TTAAT	2	10	252152	252161	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011999	GAGAC	3	15	253516	253530	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011999	ATTAA	2	10	263064	263073	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011999	AAGGT	2	10	272554	272563	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011999	ATAAA	2	10	273716	273725	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011999	GAAGA	2	10	276462	276471	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011999	TTACT	2	10	278806	278815	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011999	ATAAA	2	10	280418	280427	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011999	ATAAA	2	10	297500	297509	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011999	TAAAA	2	10	309271	309280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011999	CTATA	2	10	316154	316163	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011999	TCGTG	2	10	327243	327252	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011999	ATATA	2	10	334817	334826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011999	AATTG	2	10	338345	338354	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011999	TGAAA	2	10	349174	349183	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011999	CACTT	2	10	355422	355431	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011999	ATTTC	2	10	365124	365133	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011999	TAACT	2	10	380886	380895	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011999	ATAGT	2	10	382643	382652	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011999	ATTTT	2	10	382700	382709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011999	GATGG	2	10	382923	382932	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011999	CAATG	2	10	382939	382948	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011999	TAGTA	2	10	383089	383098	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011999	ATATA	2	10	391866	391875	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011999	TTATA	2	10	401051	401060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011999	ATGCG	2	10	415066	415075	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011999	AAGAA	2	10	416787	416796	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011999	AATTG	2	10	420623	420632	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011999	ATATT	2	10	420697	420706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011999	TAAAG	2	10	464481	464490	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011999	TAAAA	2	10	481667	481676	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011999	TTTTA	2	10	496734	496743	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011999	ATATT	2	10	497617	497626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011999	TGTTA	2	10	506612	506621	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011999	ATTAA	2	10	508249	508258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011999	TAATA	2	10	508350	508359	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011999	AAGCA	2	10	525227	525236	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011999	ATTAC	2	10	535051	535060	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011999	GACTG	2	10	545662	545671	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011999	TACAG	2	10	545809	545818	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011999	TTTTA	2	10	564241	564250	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011999	TACTT	2	10	570914	570923	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011999	GATAG	2	10	573131	573140	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011999	ACATC	2	10	573573	573582	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_011999	TTATA	2	10	575760	575769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011999	AAAGA	2	10	575786	575795	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011999	TATTT	2	10	576263	576272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011999	AACAA	2	10	577426	577435	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011999	TAAAT	2	10	579367	579376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011999	ACTTT	2	10	596833	596842	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011999	CATAA	2	10	601670	601679	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011999	TTTTA	2	10	603543	603552	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011999	GGGAT	2	10	604930	604939	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011999	GAAGA	2	10	615720	615729	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011999	GTGAG	2	10	626238	626247	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011999	TATAA	2	10	648577	648586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011999	GTTAA	2	10	681941	681950	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011999	CGTTT	2	10	689128	689137	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_011999	TTAAT	2	10	695103	695112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011999	CAAAT	2	10	722545	722554	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011999	TAGTT	2	10	751295	751304	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011999	CCTAA	2	10	780050	780059	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_011999	TCTCA	2	10	780172	780181	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_011999	TATGC	2	10	785924	785933	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011999	TATAA	4	20	787572	787591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011999	ATGAA	2	10	787592	787601	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011999	AATTT	2	10	792163	792172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011999	GAAGT	2	10	801449	801458	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011999	TAATT	2	10	803431	803440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011999	GAAAA	2	10	806971	806980	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011999	TAAAA	2	10	852650	852659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011999	ATCTC	2	10	857062	857071	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_011999	ATTTA	2	10	861326	861335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011999	AATGT	2	10	862204	862213	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011999	ATTTT	2	10	874756	874765	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011999	AATGA	2	10	878144	878153	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011999	TAAAA	2	10	888188	888197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011999	TAAAA	2	10	917727	917736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011999	TTATG	2	10	930540	930549	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011999	AATGA	2	10	932223	932232	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011999	ATTTA	2	10	936377	936386	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011999	GTTGT	2	10	942118	942127	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011999	ATTTG	2	10	950961	950970	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011999	TATAA	2	10	952570	952579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011999	TTATA	2	10	964242	964251	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011999	CATAT	2	10	966186	966195	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_011999	TAGAG	2	10	966323	966332	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011999	AATAA	2	10	969889	969898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011999	CTATA	2	10	977286	977295	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_011999	GTTAA	2	10	984403	984412	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011999	ATTTG	2	10	1000480	1000489	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011999	ACATT	2	10	1003219	1003228	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011999	TAAAA	2	10	1003765	1003774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011999	AATCA	2	10	1009073	1009082	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011999	TATAT	2	10	1010719	1010728	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011999	TATTT	2	10	1011798	1011807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011999	TTTGT	2	10	1011825	1011834	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011999	ATTAA	2	10	1012040	1012049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011999	AAGTG	2	10	1012074	1012083	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011999	AAAAC	2	10	1019357	1019366	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_011999	TCAAC	2	10	1025930	1025939	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_011999	ACAGC	2	10	1040138	1040147	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_011999	TTAAA	2	10	1040494	1040503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011999	ATTGT	2	10	1041823	1041832	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011999	AATGA	2	10	1046100	1046109	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011999	AACGG	2	10	1049137	1049146	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011999	AAAAT	2	10	1049507	1049516	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011999	AAAAT	2	10	1050217	1050226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011999	TCTTA	2	10	1052370	1052379	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011999	AATAA	2	10	1054414	1054423	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011999	AAGGA	2	10	1065550	1065559	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011999	TAATA	2	10	1081455	1081464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011999	AAAAT	2	10	1081925	1081934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011999	AAAAT	2	10	1082974	1082983	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_011999	AAAAG	2	10	1981667	1981676	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011999	TACAA	2	10	1983677	1983686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
290	NC_011999	TATTT	2	10	1983691	1983700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_011999	TATTT	2	10	1986709	1986718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011999	TTTAT	2	10	1997528	1997537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_011999	TTCCT	2	10	1998874	1998883	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
294	NC_011999	ATAAA	2	10	2010024	2010033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_011999	ATTTT	2	10	2055275	2055284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_011999	ATAAA	2	10	2059623	2059632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_011999	AGTTA	2	10	2084463	2084472	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
308	NC_011999	TACGT	2	10	2102106	2102115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.