MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402

Total Repeats: 1681

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 2 34Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011999	CGTTT	2	10	1889831	1889840	0 %	60 %	20 %	20 %	222151993
1502	NC_011999	CTGAA	2	10	1890442	1890451	40 %	20 %	20 %	20 %	222151993
1503	NC_011999	ATGTT	2	10	1890677	1890686	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_011999	TGCAG	2	10	1893946	1893955	20 %	20 %	40 %	20 %	222151998
1505	NC_011999	TTCTG	2	10	1894258	1894267	0 %	60 %	20 %	20 %	222151998
1506	NC_011999	TTTCG	2	10	1898316	1898325	0 %	60 %	20 %	20 %	222152002
1507	NC_011999	TTGAA	2	10	1901233	1901242	40 %	40 %	20 %	0 %	222152005
1508	NC_011999	AATCT	2	10	1903775	1903784	40 %	40 %	0 %	20 %	222152008
1509	NC_011999	GCTCC	2	10	1905246	1905255	0 %	20 %	20 %	60 %	222152009
1510	NC_011999	TCCAG	2	10	1910213	1910222	20 %	20 %	20 %	40 %	222152016
1511	NC_011999	CATAT	2	10	1911184	1911193	40 %	40 %	0 %	20 %	222152018
1512	NC_011999	ATCAT	2	10	1911334	1911343	40 %	40 %	0 %	20 %	222152018
1513	NC_011999	CAGTA	2	10	1912791	1912800	40 %	20 %	20 %	20 %	222152019
1514	NC_011999	GATTT	2	10	1914319	1914328	20 %	60 %	20 %	0 %	222152021
1515	NC_011999	TTCTA	2	10	1914689	1914698	20 %	60 %	0 %	20 %	222152021
1516	NC_011999	TGAAC	2	10	1915906	1915915	40 %	20 %	20 %	20 %	222152022
1517	NC_011999	GATAA	2	10	1920808	1920817	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_011999	ACCAT	2	10	1921834	1921843	40 %	20 %	0 %	40 %	222152029
1519	NC_011999	ATTTA	2	10	1922932	1922941	40 %	60 %	0 %	0 %	222152029
1520	NC_011999	CTTAA	2	10	1924551	1924560	40 %	40 %	0 %	20 %	222152031
1521	NC_011999	CTTTT	2	10	1924809	1924818	0 %	80 %	0 %	20 %	222152031
1522	NC_011999	AAAGA	2	10	1925379	1925388	80 %	0 %	20 %	0 %	222152032
1523	NC_011999	CAAAG	2	10	1927416	1927425	60 %	0 %	20 %	20 %	222152033
1524	NC_011999	TAATC	2	10	1928561	1928570	40 %	40 %	0 %	20 %	222152035
1525	NC_011999	ACATT	2	10	1932892	1932901	40 %	40 %	0 %	20 %	222152040
1526	NC_011999	GGAAT	2	10	1933000	1933009	40 %	20 %	40 %	0 %	222152040
1527	NC_011999	ATCTT	2	10	1933486	1933495	20 %	60 %	0 %	20 %	222152040
1528	NC_011999	TCATC	2	10	1933657	1933666	20 %	40 %	0 %	40 %	222152041
1529	NC_011999	CTTAT	2	10	1934049	1934058	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1530	NC_011999	TTATA	2	10	1934071	1934080	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_011999	TGTTC	2	10	1937617	1937626	0 %	60 %	20 %	20 %	222152046
1532	NC_011999	TCTTT	2	10	1941819	1941828	0 %	80 %	0 %	20 %	222152050
1533	NC_011999	ATTTT	2	10	1943895	1943904	20 %	80 %	0 %	0 %	222152051
1534	NC_011999	ACTAC	2	10	1944585	1944594	40 %	20 %	0 %	40 %	222152052
1535	NC_011999	AATAG	2	10	1945917	1945926	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011999	CAATA	2	10	1946087	1946096	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1537	NC_011999	AAATC	2	10	1946299	1946308	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1538	NC_011999	TCATT	2	10	1948532	1948541	20 %	60 %	0 %	20 %	222152055
1539	NC_011999	CTTTA	2	10	1948543	1948552	20 %	60 %	0 %	20 %	222152055
1540	NC_011999	TGTTC	2	10	1948778	1948787	0 %	60 %	20 %	20 %	222152056
1541	NC_011999	TATCA	2	10	1949372	1949381	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1542	NC_011999	TCTGT	2	10	1949396	1949405	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1543	NC_011999	TATTT	2	10	1950108	1950117	20 %	80 %	0 %	0 %	222152057
1544	NC_011999	AGTAA	2	10	1950442	1950451	60 %	20 %	20 %	0 %	222152057
1545	NC_011999	ATAGA	2	10	1950826	1950835	60 %	20 %	20 %	0 %	222152057
1546	NC_011999	ATGCA	2	10	1951938	1951947	40 %	20 %	20 %	20 %	222152058
1547	NC_011999	TTTCA	2	10	1953811	1953820	20 %	60 %	0 %	20 %	222152060
1548	NC_011999	CTGTT	2	10	1955790	1955799	0 %	60 %	20 %	20 %	222152062
1549	NC_011999	TAGTC	2	10	1956314	1956323	20 %	40 %	20 %	20 %	222152063
1550	NC_011999	AGAAC	2	10	1957712	1957721	60 %	0 %	20 %	20 %	222152065
1551	NC_011999	TTTTC	2	10	1958537	1958546	0 %	80 %	0 %	20 %	222152066
1552	NC_011999	TGCAT	2	10	1958755	1958764	20 %	40 %	20 %	20 %	222152066
1553	NC_011999	TTATA	2	10	1961123	1961132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_011999	ACTTC	2	10	1961615	1961624	20 %	40 %	0 %	40 %	222152069
1555	NC_011999	CATCT	2	10	1962219	1962228	20 %	40 %	0 %	40 %	222152070
1556	NC_011999	ACCTT	2	10	1963514	1963523	20 %	40 %	0 %	40 %	222152071
1557	NC_011999	ACGAT	2	10	1964876	1964885	40 %	20 %	20 %	20 %	222152073
1558	NC_011999	ATTTC	2	10	1965188	1965197	20 %	60 %	0 %	20 %	222152073
1559	NC_011999	CATCG	2	10	1966444	1966453	20 %	20 %	20 %	40 %	222152074
1560	NC_011999	TCTAT	2	10	1969315	1969324	20 %	60 %	0 %	20 %	222152077
1561	NC_011999	TGAAA	2	10	1969501	1969510	60 %	20 %	20 %	0 %	222152077
1562	NC_011999	TTGCT	2	10	1971745	1971754	0 %	60 %	20 %	20 %	222152079
1563	NC_011999	ACTGT	2	10	1971818	1971827	20 %	40 %	20 %	20 %	222152079
1564	NC_011999	GTTAC	2	10	1972184	1972193	20 %	40 %	20 %	20 %	222152080
1565	NC_011999	TAATA	2	10	1973726	1973735	60 %	40 %	0 %	0 %	222152081
1566	NC_011999	ATTAA	2	10	1975499	1975508	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_011999	TAGTG	2	10	1975838	1975847	20 %	40 %	40 %	0 %	222152083
1568	NC_011999	GTATT	2	10	1976009	1976018	20 %	60 %	20 %	0 %	222152083
1569	NC_011999	CATCC	2	10	1976622	1976631	20 %	20 %	0 %	60 %	222152083
1570	NC_011999	ACTTA	2	10	1977479	1977488	40 %	40 %	0 %	20 %	222152084
1571	NC_011999	TTTCG	2	10	1977771	1977780	0 %	60 %	20 %	20 %	222152085
1572	NC_011999	ATGAT	2	10	1978611	1978620	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_011999	TGAAT	2	10	1980420	1980429	40 %	40 %	20 %	0 %	222152089
1574	NC_011999	TCGGT	2	10	1980822	1980831	0 %	40 %	40 %	20 %	222152090
1575	NC_011999	AAAAG	2	10	1981667	1981676	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_011999	AAATA	2	10	1982203	1982212	80 %	20 %	0 %	0 %	222152091
1577	NC_011999	TATTT	2	10	1982231	1982240	20 %	80 %	0 %	0 %	222152092
1578	NC_011999	ATACA	2	10	1983421	1983430	60 %	20 %	0 %	20 %	222152093
1579	NC_011999	TACAA	2	10	1983677	1983686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1580	NC_011999	TATTT	2	10	1983691	1983700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_011999	CTCAT	2	10	1986679	1986688	20 %	40 %	0 %	40 %	222152097
1582	NC_011999	TATTT	2	10	1986709	1986718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_011999	TTCAG	2	10	1987103	1987112	20 %	40 %	20 %	20 %	222152098
1584	NC_011999	TAATT	2	10	1988066	1988075	40 %	60 %	0 %	0 %	222152099
1585	NC_011999	ATATT	2	10	1988676	1988685	40 %	60 %	0 %	0 %	222152099
1586	NC_011999	ATCTT	2	10	1989669	1989678	20 %	60 %	0 %	20 %	222152100
1587	NC_011999	ATAAA	2	10	1992048	1992057	80 %	20 %	0 %	0 %	222152102
1588	NC_011999	CGTAG	2	10	1993528	1993537	20 %	20 %	40 %	20 %	222152103
1589	NC_011999	TAAAA	2	10	1994027	1994036	80 %	20 %	0 %	0 %	222152103
1590	NC_011999	TTTCA	2	10	1996955	1996964	20 %	60 %	0 %	20 %	222152105
1591	NC_011999	ATACG	2	10	1997104	1997113	40 %	20 %	20 %	20 %	222152105
1592	NC_011999	TTTAT	2	10	1997528	1997537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_011999	TTCCT	2	10	1998874	1998883	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1594	NC_011999	ATAAA	2	10	2010024	2010033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_011999	CAATG	2	10	2012066	2012075	40 %	20 %	20 %	20 %	222152118
1596	NC_011999	ACTTA	2	10	2012596	2012605	40 %	40 %	0 %	20 %	222152119
1597	NC_011999	GTCGT	2	10	2013925	2013934	0 %	40 %	40 %	20 %	222152121
1598	NC_011999	ATATT	2	10	2015393	2015402	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_011999	ATTTT	2	10	2018096	2018105	20 %	80 %	0 %	0 %	222152125
1600	NC_011999	AATCA	2	10	2018966	2018975	60 %	20 %	0 %	20 %	222152126
1601	NC_011999	AATCA	2	10	2019014	2019023	60 %	20 %	0 %	20 %	222152126
1602	NC_011999	AATAA	2	10	2019043	2019052	80 %	20 %	0 %	0 %	222152126
1603	NC_011999	CATTT	2	10	2019803	2019812	20 %	60 %	0 %	20 %	222152127
1604	NC_011999	TGAAT	2	10	2020065	2020074	40 %	40 %	20 %	0 %	222152127
1605	NC_011999	TATTG	2	10	2023000	2023009	20 %	60 %	20 %	0 %	222152129
1606	NC_011999	TGTTC	2	10	2023141	2023150	0 %	60 %	20 %	20 %	222152129
1607	NC_011999	CGATT	2	10	2023697	2023706	20 %	40 %	20 %	20 %	222152130
1608	NC_011999	ACGGT	2	10	2024696	2024705	20 %	20 %	40 %	20 %	222152132
1609	NC_011999	TAATT	2	10	2024970	2024979	40 %	60 %	0 %	0 %	222152132
1610	NC_011999	TTCAT	2	10	2025735	2025744	20 %	60 %	0 %	20 %	222152133
1611	NC_011999	ATCTT	2	10	2027409	2027418	20 %	60 %	0 %	20 %	222152135
1612	NC_011999	TTTAC	2	10	2028247	2028256	20 %	60 %	0 %	20 %	222152136
1613	NC_011999	AATAA	2	10	2028834	2028843	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_011999	AAGCA	2	10	2029985	2029994	60 %	0 %	20 %	20 %	222152137
1615	NC_011999	ATTTT	2	10	2030604	2030613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_011999	TTTTG	2	10	2030989	2030998	0 %	80 %	20 %	0 %	222152138
1617	NC_011999	TTTTG	2	10	2033724	2033733	0 %	80 %	20 %	0 %	222152141
1618	NC_011999	CATCA	2	10	2034384	2034393	40 %	20 %	0 %	40 %	222152142
1619	NC_011999	TTGAT	2	10	2037138	2037147	20 %	60 %	20 %	0 %	222152145
1620	NC_011999	ATCTG	2	10	2037285	2037294	20 %	40 %	20 %	20 %	222152145
1621	NC_011999	CATAC	2	10	2037380	2037389	40 %	20 %	0 %	40 %	222152145
1622	NC_011999	CATGC	2	10	2037658	2037667	20 %	20 %	20 %	40 %	222152145
1623	NC_011999	ATTCC	2	10	2039375	2039384	20 %	40 %	0 %	40 %	222152146
1624	NC_011999	ATTTC	2	10	2040242	2040251	20 %	60 %	0 %	20 %	222152147
1625	NC_011999	AATAA	2	10	2040827	2040836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_011999	TCTTT	2	10	2041670	2041679	0 %	80 %	0 %	20 %	222152149
1627	NC_011999	TTTTC	2	10	2041694	2041703	0 %	80 %	0 %	20 %	222152149
1628	NC_011999	TACAA	2	10	2043298	2043307	60 %	20 %	0 %	20 %	222152151
1629	NC_011999	TCTTT	2	10	2045931	2045940	0 %	80 %	0 %	20 %	222152152
1630	NC_011999	ATTTT	2	10	2046738	2046747	20 %	80 %	0 %	0 %	222152152
1631	NC_011999	TCTTT	2	10	2046954	2046963	0 %	80 %	0 %	20 %	222152152
1632	NC_011999	CGAAT	2	10	2047601	2047610	40 %	20 %	20 %	20 %	222152152
1633	NC_011999	AAATA	2	10	2049773	2049782	80 %	20 %	0 %	0 %	222152155
1634	NC_011999	GTCTT	2	10	2050418	2050427	0 %	60 %	20 %	20 %	222152155
1635	NC_011999	CCTTC	2	10	2051271	2051280	0 %	40 %	0 %	60 %	222152156
1636	NC_011999	ACATT	2	10	2051282	2051291	40 %	40 %	0 %	20 %	222152156
1637	NC_011999	CCCTA	2	10	2053961	2053970	20 %	20 %	0 %	60 %	222152161
1638	NC_011999	ATTTT	2	10	2055275	2055284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_011999	ACTGC	2	10	2055649	2055658	20 %	20 %	20 %	40 %	222152162
1640	NC_011999	TAATA	2	10	2055790	2055799	60 %	40 %	0 %	0 %	222152162
1641	NC_011999	TTAAT	2	10	2056827	2056836	40 %	60 %	0 %	0 %	222152164
1642	NC_011999	CATTT	2	10	2058985	2058994	20 %	60 %	0 %	20 %	222152165
1643	NC_011999	CGTAA	2	10	2059561	2059570	40 %	20 %	20 %	20 %	222152165
1644	NC_011999	ATAAA	2	10	2059623	2059632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1645	NC_011999	ATATA	2	10	2060174	2060183	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1646	NC_011999	TTCTA	2	10	2060727	2060736	20 %	60 %	0 %	20 %	222152167
1647	NC_011999	TGTGT	2	10	2061234	2061243	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1648	NC_011999	TGTTC	2	10	2062971	2062980	0 %	60 %	20 %	20 %	222152170
1649	NC_011999	ATTCC	2	10	2063085	2063094	20 %	40 %	0 %	40 %	222152170
1650	NC_011999	ATATA	2	10	2063409	2063418	60 %	40 %	0 %	0 %	222152171
1651	NC_011999	ATATC	2	10	2064642	2064651	40 %	40 %	0 %	20 %	222152173
1652	NC_011999	TCGGT	2	10	2069066	2069075	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1653	NC_011999	CACGA	2	10	2070532	2070541	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1654	NC_011999	CTTTT	2	10	2071946	2071955	0 %	80 %	0 %	20 %	222152175
1655	NC_011999	CTTTA	2	10	2072186	2072195	20 %	60 %	0 %	20 %	222152175
1656	NC_011999	GTCTT	2	10	2073401	2073410	0 %	60 %	20 %	20 %	222152176
1657	NC_011999	TTTAT	2	10	2074642	2074651	20 %	80 %	0 %	0 %	222152178
1658	NC_011999	TAAAT	2	10	2074747	2074756	60 %	40 %	0 %	0 %	222152178
1659	NC_011999	CCTTC	2	10	2074778	2074787	0 %	40 %	0 %	60 %	222152178
1660	NC_011999	CTTCG	2	10	2075771	2075780	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1661	NC_011999	TCCCT	2	10	2077554	2077563	0 %	40 %	0 %	60 %	222152180
1662	NC_011999	AACTA	2	10	2079895	2079904	60 %	20 %	0 %	20 %	222152181
1663	NC_011999	TTTTC	2	10	2079992	2080001	0 %	80 %	0 %	20 %	222152181
1664	NC_011999	AATTC	2	10	2081684	2081693	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1665	NC_011999	AAAGA	2	10	2082359	2082368	80 %	0 %	20 %	0 %	222152183
1666	NC_011999	CAAAT	2	10	2082506	2082515	60 %	20 %	0 %	20 %	222152183
1667	NC_011999	AAATT	2	10	2082734	2082743	60 %	40 %	0 %	0 %	222152183
1668	NC_011999	AATTC	2	10	2083311	2083320	40 %	40 %	0 %	20 %	222152184
1669	NC_011999	AGTTA	2	10	2084463	2084472	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1670	NC_011999	TTGTC	2	10	2086217	2086226	0 %	60 %	20 %	20 %	222152186
1671	NC_011999	TACAA	2	10	2088528	2088537	60 %	20 %	0 %	20 %	222152188
1672	NC_011999	TCATT	2	10	2089646	2089655	20 %	60 %	0 %	20 %	222152189
1673	NC_011999	TTCAT	2	10	2089691	2089700	20 %	60 %	0 %	20 %	222152189
1674	NC_011999	TTCTC	2	10	2092365	2092374	0 %	60 %	0 %	40 %	222152191
1675	NC_011999	AATCA	2	10	2093441	2093450	60 %	20 %	0 %	20 %	222152192
1676	NC_011999	GTACC	2	10	2093656	2093665	20 %	20 %	20 %	40 %	222152192
1677	NC_011999	ATTTT	2	10	2094705	2094714	20 %	80 %	0 %	0 %	222152193
1678	NC_011999	CTTTA	2	10	2095946	2095955	20 %	60 %	0 %	20 %	222152195
1679	NC_011999	ATTTC	2	10	2099019	2099028	20 %	60 %	0 %	20 %	222152197
1680	NC_011999	ATACG	2	10	2101943	2101952	40 %	20 %	20 %	20 %	222152200
1681	NC_011999	TACGT	2	10	2102106	2102115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

< Previous 1 2 34Next >