MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL4

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011998	CTT	2	6	28	33	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011998	ATA	2	6	214	219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011998	TTG	2	6	281	286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011998	ATA	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011998	TAT	2	6	368	373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011998	AAC	2	6	391	396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011998	CGT	2	6	400	405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011998	TCT	2	6	680	685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
9	NC_011998	TCT	2	6	767	772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
10	NC_011998	CAA	2	6	889	894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142649
11	NC_011998	TTG	2	6	930	935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142649
12	NC_011998	TCA	2	6	986	991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142649
13	NC_011998	AAT	2	6	1026	1031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142649
14	NC_011998	TTC	2	6	1166	1171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
15	NC_011998	TCA	2	6	1185	1190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142649
16	NC_011998	TCT	2	6	1208	1213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
17	NC_011998	AGA	2	6	1264	1269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142649
18	NC_011998	TCA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142649
19	NC_011998	ATT	2	6	1309	1314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142649
20	NC_011998	TCT	2	6	1339	1344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
21	NC_011998	TAT	2	6	1416	1421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142649
22	NC_011998	AAT	2	6	1712	1717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011998	TGT	2	6	1767	1772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011998	ATT	2	6	1776	1781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011998	TCT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011998	TGT	2	6	2102	2107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142650
27	NC_011998	CTT	2	6	2147	2152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
28	NC_011998	ATT	2	6	2170	2175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142650
29	NC_011998	TTC	2	6	2232	2237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
30	NC_011998	TAA	2	6	2262	2267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142650
31	NC_011998	TTC	2	6	2359	2364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
32	NC_011998	CTT	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
33	NC_011998	TTC	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
34	NC_011998	CAA	2	6	2496	2501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142650
35	NC_011998	CTT	2	6	2517	2522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
36	NC_011998	CTT	2	6	2526	2531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
37	NC_011998	TCT	2	6	2534	2539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
38	NC_011998	TCT	2	6	2582	2587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
39	NC_011998	TTC	2	6	2707	2712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
40	NC_011998	TCA	2	6	2867	2872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142650
41	NC_011998	TCA	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142650
42	NC_011998	ATC	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142650
43	NC_011998	TGA	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142650
44	NC_011998	CTG	2	6	3057	3062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222142650
45	NC_011998	TAC	2	6	3180	3185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142650
46	NC_011998	AAC	2	6	3190	3195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142650
47	NC_011998	AGC	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222142650
48	NC_011998	TCT	2	6	3313	3318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011998	ATT	2	6	3372	3377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.