MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL2

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011996	TAGAAA	2	12	890	901	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222142577
2	NC_011996	AATTTA	2	12	2480	2491	50 %	50 %	0 %	0 %	222142578
3	NC_011996	TGAGTA	2	12	4247	4258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142578
4	NC_011996	GATTGC	2	12	5405	5416	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222142579
5	NC_011996	ACAGAT	2	12	7335	7346	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222142581
6	NC_011996	GTAAAT	2	12	7830	7841	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222142581
7	NC_011996	CATTTA	2	12	9294	9305	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222142582
8	NC_011996	AATTAT	2	12	9448	9459	50 %	50 %	0 %	0 %	222142583
9	NC_011996	AGAAAA	2	12	9520	9531	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222142583
10	NC_011996	GAAAAA	2	12	10868	10879	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222142584
11	NC_011996	TTATGA	2	12	12084	12095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222142586
12	NC_011996	ATAAAA	2	12	12388	12399	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	222142586
13	NC_011996	ATTAAA	2	12	13711	13722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142587
14	NC_011996	AGATAT	2	12	19504	19515	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222142591
15	NC_011996	AATAAA	2	12	20897	20908	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	222142594
16	NC_011996	TGCAGA	2	12	21538	21549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222142594
17	NC_011996	AGATTT	2	12	22941	22952	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222142596
18	NC_011996	AAATTT	2	12	25789	25800	50 %	50 %	0 %	0 %	222142599
19	NC_011996	AAAAAT	2	12	27860	27871	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	222142600
20	NC_011996	AATATT	2	12	28415	28426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011996	GAAAGA	2	12	29343	29354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142601
22	NC_011996	ATAAAT	2	12	30029	30040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142602
23	NC_011996	TTAAAC	2	12	32667	32678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222142603
24	NC_011996	ATAGCA	2	12	33380	33391	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222142604
25	NC_011996	CTCTTG	2	12	36523	36534	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222142608
26	NC_011996	ATTTTC	2	12	36921	36932	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	222142608
27	NC_011996	AATGTA	2	12	37399	37410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222142609
28	NC_011996	TGCAGC	2	12	37817	37828	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011996	TGATAT	2	12	40079	40090	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222142612
30	NC_011996	GAAAAA	2	12	43361	43372	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222142616
31	NC_011996	GTATAT	2	12	44133	44144	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011996	ATTATC	2	12	44422	44433	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222142617
33	NC_011996	TTCCAA	2	12	52704	52715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142621
34	NC_011996	GGAATG	2	12	52957	52968	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	222142621
35	NC_011996	TTTTTC	2	12	55858	55869	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	222142623
36	NC_011996	TTTTAG	2	12	60523	60534	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	222142629
37	NC_011996	TATGAT	2	12	60869	60880	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222142630
38	NC_011996	AAATCT	2	12	61201	61212	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011996	AGCTGA	2	12	62410	62421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011996	ATTGAT	2	12	65138	65149	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222142634
41	NC_011996	AGATAA	2	12	66921	66932	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222142635
42	NC_011996	ATTGAT	2	12	70254	70265	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222142639
43	NC_011996	TAAAGA	2	12	73279	73290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222142641
44	NC_011996	GGATAA	2	12	73438	73449	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222142641
45	NC_011996	AAAGAA	2	12	73745	73756	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222142641
46	NC_011996	ATAAGA	2	12	76892	76903	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222142643
47	NC_011996	AATGTA	2	12	78267	78278	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222142644
48	NC_011996	GATACA	2	12	79993	80004	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.