MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL2

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011996	ATTTG	2	10	176	185	20 %	60 %	20 %	0 %	222142577
2	NC_011996	TAGAA	2	10	320	329	60 %	20 %	20 %	0 %	222142577
3	NC_011996	TAAGT	2	10	2388	2397	40 %	40 %	20 %	0 %	222142578
4	NC_011996	TCATT	2	10	5815	5824	20 %	60 %	0 %	20 %	222142580
5	NC_011996	TCATT	2	10	7085	7094	20 %	60 %	0 %	20 %	222142581
6	NC_011996	AAAAT	2	10	9543	9552	80 %	20 %	0 %	0 %	222142583
7	NC_011996	AGAAA	2	10	10723	10732	80 %	0 %	20 %	0 %	222142584
8	NC_011996	GAAAT	2	10	11571	11580	60 %	20 %	20 %	0 %	222142585
9	NC_011996	ATAAA	2	10	11631	11640	80 %	20 %	0 %	0 %	222142585
10	NC_011996	TGTAT	2	10	11762	11771	20 %	60 %	20 %	0 %	222142585
11	NC_011996	TGGTG	2	10	12463	12472	0 %	40 %	60 %	0 %	222142586
12	NC_011996	AAAGC	2	10	12616	12625	60 %	0 %	20 %	20 %	222142586
13	NC_011996	TTGAT	2	10	13564	13573	20 %	60 %	20 %	0 %	222142587
14	NC_011996	AAAAT	2	10	13914	13923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011996	AATTA	2	10	15419	15428	60 %	40 %	0 %	0 %	222142588
16	NC_011996	TAGAA	2	10	15463	15472	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011996	AAGAA	2	10	16669	16678	80 %	0 %	20 %	0 %	222142589
18	NC_011996	TTTAC	2	10	19595	19604	20 %	60 %	0 %	20 %	222142592
19	NC_011996	AAAAT	2	10	20701	20710	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011996	CAATG	2	10	21070	21079	40 %	20 %	20 %	20 %	222142594
21	NC_011996	TAATG	2	10	21938	21947	40 %	40 %	20 %	0 %	222142595
22	NC_011996	TTTTA	2	10	23690	23699	20 %	80 %	0 %	0 %	222142597
23	NC_011996	TAATT	2	10	24088	24097	40 %	60 %	0 %	0 %	222142598
24	NC_011996	AAATT	2	10	25264	25273	60 %	40 %	0 %	0 %	222142598
25	NC_011996	AAATC	2	10	25921	25930	60 %	20 %	0 %	20 %	222142599
26	NC_011996	AGAAA	2	10	26449	26458	80 %	0 %	20 %	0 %	222142599
27	NC_011996	GGACA	2	10	26468	26477	40 %	0 %	40 %	20 %	222142599
28	NC_011996	AGCAA	2	10	28281	28290	60 %	0 %	20 %	20 %	222142600
29	NC_011996	TTAAT	2	10	28601	28610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011996	AAAAT	2	10	29800	29809	80 %	20 %	0 %	0 %	222142601
31	NC_011996	ATCAA	2	10	31521	31530	60 %	20 %	0 %	20 %	222142603
32	NC_011996	AATTT	2	10	32195	32204	40 %	60 %	0 %	0 %	222142603
33	NC_011996	AATAG	2	10	32564	32573	60 %	20 %	20 %	0 %	222142603
34	NC_011996	TATAA	2	10	33744	33753	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011996	ATTAT	2	10	35244	35253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011996	GAAAA	2	10	35848	35857	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011996	AATTA	2	10	36566	36575	60 %	40 %	0 %	0 %	222142608
38	NC_011996	AAAAG	2	10	37284	37293	80 %	0 %	20 %	0 %	222142609
39	NC_011996	TGTTT	2	10	37663	37672	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011996	AGTAT	2	10	37883	37892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011996	AAAAT	2	10	38636	38645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011996	ATGAT	2	10	38870	38879	40 %	40 %	20 %	0 %	222142611
43	NC_011996	ATGAA	2	10	41002	41011	60 %	20 %	20 %	0 %	222142612
44	NC_011996	ATGAT	2	10	41318	41327	40 %	40 %	20 %	0 %	222142613
45	NC_011996	AATAT	2	10	43038	43047	60 %	40 %	0 %	0 %	222142615
46	NC_011996	TATGG	2	10	44454	44463	20 %	40 %	40 %	0 %	222142617
47	NC_011996	AGAAA	2	10	45573	45582	80 %	0 %	20 %	0 %	222142617
48	NC_011996	CATTT	2	10	47180	47189	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011996	TATTC	2	10	47791	47800	20 %	60 %	0 %	20 %	222142619
50	NC_011996	AAAAT	2	10	50967	50976	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011996	TTATT	2	10	51012	51021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011996	AATTA	2	10	51054	51063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011996	AAAAG	2	10	51675	51684	80 %	0 %	20 %	0 %	222142621
54	NC_011996	GGAAT	2	10	51817	51826	40 %	20 %	40 %	0 %	222142621
55	NC_011996	TAAAA	2	10	55177	55186	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011996	AAAAT	2	10	56130	56139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011996	AAGAC	2	10	56221	56230	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011996	TCATT	2	10	58363	58372	20 %	60 %	0 %	20 %	222142627
59	NC_011996	CAAAT	2	10	58842	58851	60 %	20 %	0 %	20 %	222142627
60	NC_011996	GTTAA	2	10	58979	58988	40 %	40 %	20 %	0 %	222142628
61	NC_011996	ACAAA	2	10	60111	60120	80 %	0 %	0 %	20 %	222142629
62	NC_011996	AATAT	2	10	60568	60577	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011996	ATATT	2	10	60583	60592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011996	ATTAA	2	10	62325	62334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011996	AAGAG	2	10	65896	65905	60 %	0 %	40 %	0 %	222142634
66	NC_011996	TGTAT	2	10	67405	67414	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011996	AGGGG	2	10	67482	67491	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011996	GGAAA	2	10	68421	68430	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011996	ATTTT	2	10	69601	69610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011996	TTAAA	2	10	71304	71313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011996	TATCA	2	10	71409	71418	40 %	40 %	0 %	20 %	222142641
72	NC_011996	TAGAC	2	10	71665	71674	40 %	20 %	20 %	20 %	222142641
73	NC_011996	TAAAT	2	10	72853	72862	60 %	40 %	0 %	0 %	222142641
74	NC_011996	AAATA	2	10	74386	74395	80 %	20 %	0 %	0 %	222142641
75	NC_011996	AAAAG	2	10	76923	76932	80 %	0 %	20 %	0 %	222142643
76	NC_011996	AAAAG	2	10	78583	78592	80 %	0 %	20 %	0 %	222142644
77	NC_011996	ATCTA	2	10	79527	79536	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011996	CAACA	2	10	79703	79712	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_011996	TATTT	2	10	79728	79737	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.