MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL2

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011996	AAAAT	2	10	13914	13923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011996	TAGAA	2	10	15463	15472	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011996	AAAAT	2	10	20701	20710	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011996	TTAAT	2	10	28601	28610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011996	TATAA	2	10	33744	33753	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011996	ATTAT	2	10	35244	35253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011996	GAAAA	2	10	35848	35857	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011996	TGTTT	2	10	37663	37672	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011996	AGTAT	2	10	37883	37892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011996	AAAAT	2	10	38636	38645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011996	CATTT	2	10	47180	47189	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011996	AAAAT	2	10	50967	50976	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011996	TTATT	2	10	51012	51021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011996	AATTA	2	10	51054	51063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011996	TAAAA	2	10	55177	55186	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011996	AAAAT	2	10	56130	56139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011996	AAGAC	2	10	56221	56230	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011996	AATAT	2	10	60568	60577	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011996	ATATT	2	10	60583	60592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011996	ATTAA	2	10	62325	62334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011996	TGTAT	2	10	67405	67414	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011996	AGGGG	2	10	67482	67491	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011996	GGAAA	2	10	68421	68430	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011996	ATTTT	2	10	69601	69610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011996	TTAAA	2	10	71304	71313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011996	ATCTA	2	10	79527	79536	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011996	CAACA	2	10	79703	79712	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011996	TATTT	2	10	79728	79737	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.