MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL2

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011996	ATTTG	2	10	176	185	20 %	60 %	20 %	0 %	222142577
2	NC_011996	TAGAA	2	10	320	329	60 %	20 %	20 %	0 %	222142577
3	NC_011996	TAAGT	2	10	2388	2397	40 %	40 %	20 %	0 %	222142578
4	NC_011996	TCATT	2	10	5815	5824	20 %	60 %	0 %	20 %	222142580
5	NC_011996	TCATT	2	10	7085	7094	20 %	60 %	0 %	20 %	222142581
6	NC_011996	AAAAT	2	10	9543	9552	80 %	20 %	0 %	0 %	222142583
7	NC_011996	AGAAA	2	10	10723	10732	80 %	0 %	20 %	0 %	222142584
8	NC_011996	GAAAT	2	10	11571	11580	60 %	20 %	20 %	0 %	222142585
9	NC_011996	ATAAA	2	10	11631	11640	80 %	20 %	0 %	0 %	222142585
10	NC_011996	TGTAT	2	10	11762	11771	20 %	60 %	20 %	0 %	222142585
11	NC_011996	TGGTG	2	10	12463	12472	0 %	40 %	60 %	0 %	222142586
12	NC_011996	AAAGC	2	10	12616	12625	60 %	0 %	20 %	20 %	222142586
13	NC_011996	TTGAT	2	10	13564	13573	20 %	60 %	20 %	0 %	222142587
14	NC_011996	AATTA	2	10	15419	15428	60 %	40 %	0 %	0 %	222142588
15	NC_011996	AAGAA	2	10	16669	16678	80 %	0 %	20 %	0 %	222142589
16	NC_011996	TTTAC	2	10	19595	19604	20 %	60 %	0 %	20 %	222142592
17	NC_011996	CAATG	2	10	21070	21079	40 %	20 %	20 %	20 %	222142594
18	NC_011996	TAATG	2	10	21938	21947	40 %	40 %	20 %	0 %	222142595
19	NC_011996	TTTTA	2	10	23690	23699	20 %	80 %	0 %	0 %	222142597
20	NC_011996	TAATT	2	10	24088	24097	40 %	60 %	0 %	0 %	222142598
21	NC_011996	AAATT	2	10	25264	25273	60 %	40 %	0 %	0 %	222142598
22	NC_011996	AAATC	2	10	25921	25930	60 %	20 %	0 %	20 %	222142599
23	NC_011996	AGAAA	2	10	26449	26458	80 %	0 %	20 %	0 %	222142599
24	NC_011996	GGACA	2	10	26468	26477	40 %	0 %	40 %	20 %	222142599
25	NC_011996	AGCAA	2	10	28281	28290	60 %	0 %	20 %	20 %	222142600
26	NC_011996	AAAAT	2	10	29800	29809	80 %	20 %	0 %	0 %	222142601
27	NC_011996	ATCAA	2	10	31521	31530	60 %	20 %	0 %	20 %	222142603
28	NC_011996	AATTT	2	10	32195	32204	40 %	60 %	0 %	0 %	222142603
29	NC_011996	AATAG	2	10	32564	32573	60 %	20 %	20 %	0 %	222142603
30	NC_011996	AATTA	2	10	36566	36575	60 %	40 %	0 %	0 %	222142608
31	NC_011996	AAAAG	2	10	37284	37293	80 %	0 %	20 %	0 %	222142609
32	NC_011996	ATGAT	2	10	38870	38879	40 %	40 %	20 %	0 %	222142611
33	NC_011996	ATGAA	2	10	41002	41011	60 %	20 %	20 %	0 %	222142612
34	NC_011996	ATGAT	2	10	41318	41327	40 %	40 %	20 %	0 %	222142613
35	NC_011996	AATAT	2	10	43038	43047	60 %	40 %	0 %	0 %	222142615
36	NC_011996	TATGG	2	10	44454	44463	20 %	40 %	40 %	0 %	222142617
37	NC_011996	AGAAA	2	10	45573	45582	80 %	0 %	20 %	0 %	222142617
38	NC_011996	TATTC	2	10	47791	47800	20 %	60 %	0 %	20 %	222142619
39	NC_011996	AAAAG	2	10	51675	51684	80 %	0 %	20 %	0 %	222142621
40	NC_011996	GGAAT	2	10	51817	51826	40 %	20 %	40 %	0 %	222142621
41	NC_011996	TCATT	2	10	58363	58372	20 %	60 %	0 %	20 %	222142627
42	NC_011996	CAAAT	2	10	58842	58851	60 %	20 %	0 %	20 %	222142627
43	NC_011996	GTTAA	2	10	58979	58988	40 %	40 %	20 %	0 %	222142628
44	NC_011996	ACAAA	2	10	60111	60120	80 %	0 %	0 %	20 %	222142629
45	NC_011996	AAGAG	2	10	65896	65905	60 %	0 %	40 %	0 %	222142634
46	NC_011996	TATCA	2	10	71409	71418	40 %	40 %	0 %	20 %	222142641
47	NC_011996	TAGAC	2	10	71665	71674	40 %	20 %	20 %	20 %	222142641
48	NC_011996	TAAAT	2	10	72853	72862	60 %	40 %	0 %	0 %	222142641
49	NC_011996	AAATA	2	10	74386	74395	80 %	20 %	0 %	0 %	222142641
50	NC_011996	AAAAG	2	10	76923	76932	80 %	0 %	20 %	0 %	222142643
51	NC_011996	AAAAG	2	10	78583	78592	80 %	0 %	20 %	0 %	222142644

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.