MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL2

Total Repeats: 312

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011996	GTTT	2	8	696	703	0 %	75 %	25 %	0 %	222142577
2	NC_011996	ACGA	2	8	837	844	50 %	0 %	25 %	25 %	222142577
3	NC_011996	GGAA	2	8	1201	1208	50 %	0 %	50 %	0 %	222142577
4	NC_011996	ATTT	2	8	1535	1542	25 %	75 %	0 %	0 %	222142577
5	NC_011996	AAAG	2	8	1725	1732	75 %	0 %	25 %	0 %	222142577
6	NC_011996	AATA	2	8	1740	1747	75 %	25 %	0 %	0 %	222142577
7	NC_011996	ATGG	2	8	1945	1952	25 %	25 %	50 %	0 %	222142578
8	NC_011996	GAAA	2	8	2404	2411	75 %	0 %	25 %	0 %	222142578
9	NC_011996	TTCA	2	8	2554	2561	25 %	50 %	0 %	25 %	222142578
10	NC_011996	AATT	2	8	2639	2646	50 %	50 %	0 %	0 %	222142578
11	NC_011996	GAAA	2	8	3373	3380	75 %	0 %	25 %	0 %	222142578
12	NC_011996	TCTA	2	8	3669	3676	25 %	50 %	0 %	25 %	222142578
13	NC_011996	GACA	2	8	3814	3821	50 %	0 %	25 %	25 %	222142578
14	NC_011996	GACA	2	8	4039	4046	50 %	0 %	25 %	25 %	222142578
15	NC_011996	AGGC	2	8	4096	4103	25 %	0 %	50 %	25 %	222142578
16	NC_011996	ACAA	2	8	4319	4326	75 %	0 %	0 %	25 %	222142578
17	NC_011996	GTCA	2	8	4342	4349	25 %	25 %	25 %	25 %	222142578
18	NC_011996	TTCG	2	8	4453	4460	0 %	50 %	25 %	25 %	222142578
19	NC_011996	TTTA	2	8	4671	4678	25 %	75 %	0 %	0 %	222142578
20	NC_011996	ATTA	2	8	4862	4869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011996	AAAT	2	8	5186	5193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011996	GGAT	2	8	5473	5480	25 %	25 %	50 %	0 %	222142579
23	NC_011996	GAAA	3	12	5592	5603	75 %	0 %	25 %	0 %	222142580
24	NC_011996	GATT	2	8	5618	5625	25 %	50 %	25 %	0 %	222142580
25	NC_011996	TGTC	2	8	6004	6011	0 %	50 %	25 %	25 %	222142580
26	NC_011996	CAGA	2	8	6026	6033	50 %	0 %	25 %	25 %	222142580
27	NC_011996	TTTA	2	8	6675	6682	25 %	75 %	0 %	0 %	222142581
28	NC_011996	TCAA	2	8	6906	6913	50 %	25 %	0 %	25 %	222142581
29	NC_011996	TGGA	2	8	7162	7169	25 %	25 %	50 %	0 %	222142581
30	NC_011996	AAAG	2	8	7417	7424	75 %	0 %	25 %	0 %	222142581
31	NC_011996	GAAA	2	8	7877	7884	75 %	0 %	25 %	0 %	222142581
32	NC_011996	TTTC	2	8	8009	8016	0 %	75 %	0 %	25 %	222142581
33	NC_011996	AAAG	2	8	8070	8077	75 %	0 %	25 %	0 %	222142581
34	NC_011996	CAGA	2	8	8500	8507	50 %	0 %	25 %	25 %	222142582
35	NC_011996	TAAA	2	8	8698	8705	75 %	25 %	0 %	0 %	222142582
36	NC_011996	ATAA	2	8	9509	9516	75 %	25 %	0 %	0 %	222142583
37	NC_011996	TAAG	2	8	9801	9808	50 %	25 %	25 %	0 %	222142583
38	NC_011996	AATG	2	8	10028	10035	50 %	25 %	25 %	0 %	222142583
39	NC_011996	TTAA	2	8	10095	10102	50 %	50 %	0 %	0 %	222142583
40	NC_011996	ATTT	2	8	10128	10135	25 %	75 %	0 %	0 %	222142584
41	NC_011996	AAAT	2	8	10141	10148	75 %	25 %	0 %	0 %	222142584
42	NC_011996	AATT	2	8	10341	10348	50 %	50 %	0 %	0 %	222142584
43	NC_011996	GAAG	2	8	10549	10556	50 %	0 %	50 %	0 %	222142584
44	NC_011996	ATGA	2	8	10679	10686	50 %	25 %	25 %	0 %	222142584
45	NC_011996	CATA	2	8	11191	11198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011996	CGTA	2	8	11219	11226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011996	AAAT	2	8	11249	11256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011996	CAAA	2	8	11504	11511	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011996	TTTA	2	8	11686	11693	25 %	75 %	0 %	0 %	222142585
50	NC_011996	CAAA	2	8	11891	11898	75 %	0 %	0 %	25 %	222142585
51	NC_011996	GAAG	2	8	12432	12439	50 %	0 %	50 %	0 %	222142586
52	NC_011996	AAAT	2	8	12666	12673	75 %	25 %	0 %	0 %	222142586
53	NC_011996	GAAA	2	8	12801	12808	75 %	0 %	25 %	0 %	222142586
54	NC_011996	AATA	2	8	13150	13157	75 %	25 %	0 %	0 %	222142586
55	NC_011996	AAAG	2	8	13506	13513	75 %	0 %	25 %	0 %	222142587
56	NC_011996	AAAG	2	8	14653	14660	75 %	0 %	25 %	0 %	222142588
57	NC_011996	AACA	2	8	14759	14766	75 %	0 %	0 %	25 %	222142588
58	NC_011996	AGCT	2	8	14778	14785	25 %	25 %	25 %	25 %	222142588
59	NC_011996	TCAT	2	8	15137	15144	25 %	50 %	0 %	25 %	222142588
60	NC_011996	GAAA	2	8	15372	15379	75 %	0 %	25 %	0 %	222142588
61	NC_011996	ACAG	2	8	16461	16468	50 %	0 %	25 %	25 %	222142589
62	NC_011996	AAAC	2	8	16698	16705	75 %	0 %	0 %	25 %	222142589
63	NC_011996	AAGG	2	8	16905	16912	50 %	0 %	50 %	0 %	222142589
64	NC_011996	AGGT	2	8	17126	17133	25 %	25 %	50 %	0 %	222142589
65	NC_011996	TGAA	2	8	17299	17306	50 %	25 %	25 %	0 %	222142589
66	NC_011996	AATA	2	8	17409	17416	75 %	25 %	0 %	0 %	222142589
67	NC_011996	GAAA	2	8	17548	17555	75 %	0 %	25 %	0 %	222142589
68	NC_011996	AATA	2	8	17613	17620	75 %	25 %	0 %	0 %	222142589
69	NC_011996	TTAT	2	8	17642	17649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011996	ATAA	2	8	17784	17791	75 %	25 %	0 %	0 %	222142590
71	NC_011996	TAAT	2	8	17989	17996	50 %	50 %	0 %	0 %	222142590
72	NC_011996	TATC	2	8	18043	18050	25 %	50 %	0 %	25 %	222142590
73	NC_011996	GAAA	2	8	18991	18998	75 %	0 %	25 %	0 %	222142591
74	NC_011996	GCAG	2	8	19085	19092	25 %	0 %	50 %	25 %	222142591
75	NC_011996	GTAT	2	8	19303	19310	25 %	50 %	25 %	0 %	222142591
76	NC_011996	TATT	2	8	20318	20325	25 %	75 %	0 %	0 %	222142593
77	NC_011996	TCAA	2	8	20536	20543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011996	TTAT	2	8	20921	20928	25 %	75 %	0 %	0 %	222142594
79	NC_011996	TAAT	2	8	20973	20980	50 %	50 %	0 %	0 %	222142594
80	NC_011996	CAAT	2	8	21024	21031	50 %	25 %	0 %	25 %	222142594
81	NC_011996	ATTA	2	8	21568	21575	50 %	50 %	0 %	0 %	222142594
82	NC_011996	TTAA	2	8	21623	21630	50 %	50 %	0 %	0 %	222142594
83	NC_011996	AATA	2	8	22300	22307	75 %	25 %	0 %	0 %	222142595
84	NC_011996	TTTC	2	8	22428	22435	0 %	75 %	0 %	25 %	222142595
85	NC_011996	ATTT	2	8	22530	22537	25 %	75 %	0 %	0 %	222142595
86	NC_011996	ATAA	2	8	23020	23027	75 %	25 %	0 %	0 %	222142596
87	NC_011996	CATT	2	8	23097	23104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011996	TTTA	2	8	23438	23445	25 %	75 %	0 %	0 %	222142597
89	NC_011996	CATT	2	8	23586	23593	25 %	50 %	0 %	25 %	222142597
90	NC_011996	TCTT	2	8	24118	24125	0 %	75 %	0 %	25 %	222142598
91	NC_011996	TTTC	2	8	24222	24229	0 %	75 %	0 %	25 %	222142598
92	NC_011996	ATTT	2	8	24242	24249	25 %	75 %	0 %	0 %	222142598
93	NC_011996	TTCT	2	8	24323	24330	0 %	75 %	0 %	25 %	222142598
94	NC_011996	CTTC	2	8	24391	24398	0 %	50 %	0 %	50 %	222142598
95	NC_011996	TTTC	2	8	24700	24707	0 %	75 %	0 %	25 %	222142598
96	NC_011996	TAAC	2	8	25121	25128	50 %	25 %	0 %	25 %	222142598
97	NC_011996	TGAA	2	8	25632	25639	50 %	25 %	25 %	0 %	222142599
98	NC_011996	TAAA	2	8	26037	26044	75 %	25 %	0 %	0 %	222142599
99	NC_011996	TAAA	2	8	26094	26101	75 %	25 %	0 %	0 %	222142599
100	NC_011996	AAAC	2	8	26108	26115	75 %	0 %	0 %	25 %	222142599
101	NC_011996	CAAA	2	8	26213	26220	75 %	0 %	0 %	25 %	222142599
102	NC_011996	TAGT	2	8	26586	26593	25 %	50 %	25 %	0 %	222142599
103	NC_011996	AAGA	2	8	26666	26673	75 %	0 %	25 %	0 %	222142599
104	NC_011996	TAAA	2	8	26682	26689	75 %	25 %	0 %	0 %	222142599
105	NC_011996	TAAT	2	8	27135	27142	50 %	50 %	0 %	0 %	222142599
106	NC_011996	AGAA	2	8	27283	27290	75 %	0 %	25 %	0 %	222142599
107	NC_011996	GGTT	2	8	27368	27375	0 %	50 %	50 %	0 %	222142599
108	NC_011996	ATAG	2	8	27521	27528	50 %	25 %	25 %	0 %	222142599
109	NC_011996	GAAT	2	8	27783	27790	50 %	25 %	25 %	0 %	222142600
110	NC_011996	TTAA	2	8	28181	28188	50 %	50 %	0 %	0 %	222142600
111	NC_011996	TAAA	2	8	28639	28646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011996	TGAA	2	8	28816	28823	50 %	25 %	25 %	0 %	222142601
113	NC_011996	TAAA	2	8	28876	28883	75 %	25 %	0 %	0 %	222142601
114	NC_011996	GACA	2	8	28884	28891	50 %	0 %	25 %	25 %	222142601
115	NC_011996	ATTG	2	8	28995	29002	25 %	50 %	25 %	0 %	222142601
116	NC_011996	TAAA	2	8	29326	29333	75 %	25 %	0 %	0 %	222142601
117	NC_011996	TTAG	2	8	29529	29536	25 %	50 %	25 %	0 %	222142601
118	NC_011996	AGGT	2	8	29938	29945	25 %	25 %	50 %	0 %	222142601
119	NC_011996	TATT	2	8	30406	30413	25 %	75 %	0 %	0 %	222142602
120	NC_011996	TTTA	2	8	30610	30617	25 %	75 %	0 %	0 %	222142602
121	NC_011996	ATTC	2	8	30817	30824	25 %	50 %	0 %	25 %	222142602
122	NC_011996	TAAT	2	8	31095	31102	50 %	50 %	0 %	0 %	222142603
123	NC_011996	TTAT	2	8	32058	32065	25 %	75 %	0 %	0 %	222142603
124	NC_011996	TAAA	2	8	32256	32263	75 %	25 %	0 %	0 %	222142603
125	NC_011996	CCAT	2	8	32450	32457	25 %	25 %	0 %	50 %	222142603
126	NC_011996	CTTG	2	8	32911	32918	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011996	TATT	2	8	33052	33059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011996	AGTA	2	8	33125	33132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011996	AATA	2	8	33908	33915	75 %	25 %	0 %	0 %	222142605
130	NC_011996	AATA	2	8	34190	34197	75 %	25 %	0 %	0 %	222142605
131	NC_011996	ATAG	2	8	34522	34529	50 %	25 %	25 %	0 %	222142606
132	NC_011996	ATTA	2	8	34644	34651	50 %	50 %	0 %	0 %	222142606
133	NC_011996	GATA	2	8	35112	35119	50 %	25 %	25 %	0 %	222142606
134	NC_011996	AATC	2	8	35332	35339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011996	TAAA	2	8	35754	35761	75 %	25 %	0 %	0 %	222142607
136	NC_011996	AATT	2	8	35942	35949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011996	TCAT	2	8	36091	36098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011996	TAGA	2	8	36103	36110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011996	AATT	2	8	36112	36119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011996	TTCC	2	8	36723	36730	0 %	50 %	0 %	50 %	222142608
141	NC_011996	ACTT	2	8	36821	36828	25 %	50 %	0 %	25 %	222142608
142	NC_011996	TAAA	2	8	37100	37107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.