MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL2

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011996	ATTA	2	8	4862	4869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011996	AAAT	2	8	5186	5193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011996	CATA	2	8	11191	11198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011996	CGTA	2	8	11219	11226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011996	AAAT	2	8	11249	11256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011996	CAAA	2	8	11504	11511	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011996	TTAT	2	8	17642	17649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011996	TCAA	2	8	20536	20543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011996	CATT	2	8	23097	23104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011996	TAAA	2	8	28639	28646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011996	CTTG	2	8	32911	32918	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011996	TATT	2	8	33052	33059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011996	AGTA	2	8	33125	33132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011996	AATC	2	8	35332	35339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011996	AATT	2	8	35942	35949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011996	TCAT	2	8	36091	36098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011996	TAGA	2	8	36103	36110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011996	AATT	2	8	36112	36119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011996	TAAA	2	8	37100	37107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011996	TTTA	2	8	37627	37634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011996	ATGA	2	8	37639	37646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011996	CTGC	2	8	38016	38023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011996	TAAT	2	8	38742	38749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011996	AAAT	2	8	39840	39847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011996	TAAA	2	8	39890	39897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011996	TTTA	2	8	43885	43892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011996	TTTA	2	8	43939	43946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011996	ATAA	2	8	44161	44168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011996	ATAA	2	8	46093	46100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011996	ACAA	2	8	46164	46171	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011996	TATT	2	8	46187	46194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011996	GTTT	2	8	50868	50875	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011996	TTTC	2	8	50898	50905	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011996	AAGA	2	8	54203	54210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011996	TTAG	2	8	54326	54333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011996	TAAA	2	8	55338	55345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011996	GTTT	2	8	56307	56314	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011996	GAAC	2	8	57384	57391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011996	TTTC	2	8	58335	58342	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011996	AACA	2	8	59708	59715	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011996	TAAT	2	8	62198	62205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011996	GAAA	2	8	62649	62656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011996	TAGT	2	8	62675	62682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011996	TAGA	2	8	62848	62855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011996	TTTC	2	8	64771	64778	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011996	GACG	2	8	67224	67231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011996	TATC	2	8	67250	67257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011996	GATT	2	8	68005	68012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011996	AATC	2	8	68385	68392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011996	AGAA	2	8	69178	69185	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011996	ATCA	2	8	69691	69698	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011996	CAAA	2	8	70924	70931	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011996	ATCA	2	8	74876	74883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011996	ATTA	2	8	74978	74985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011996	GAAA	2	8	79435	79442	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011996	AGTT	2	8	79460	79467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011996	TGAA	2	8	80480	80487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.