MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL1

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011995	TCAG	2	8	674	681	25 %	25 %	25 %	25 %	222142562
2	NC_011995	TCAT	2	8	692	699	25 %	50 %	0 %	25 %	222142562
3	NC_011995	GATT	2	8	752	759	25 %	50 %	25 %	0 %	222142562
4	NC_011995	ACTT	2	8	1312	1319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011995	ATTG	2	8	1677	1684	25 %	50 %	25 %	0 %	222142563
6	NC_011995	CTGA	2	8	1725	1732	25 %	25 %	25 %	25 %	222142563
7	NC_011995	CATG	2	8	2071	2078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011995	TCTA	2	8	2601	2608	25 %	50 %	0 %	25 %	222142564
9	NC_011995	ACAA	2	8	3113	3120	75 %	0 %	0 %	25 %	222142564
10	NC_011995	ATGA	2	8	3366	3373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011995	TCAT	2	8	3379	3386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011995	ATGA	2	8	3485	3492	50 %	25 %	25 %	0 %	222142565
13	NC_011995	TAAA	2	8	3494	3501	75 %	25 %	0 %	0 %	222142565
14	NC_011995	GATT	2	8	3591	3598	25 %	50 %	25 %	0 %	222142565
15	NC_011995	CGAT	2	8	3718	3725	25 %	25 %	25 %	25 %	222142565
16	NC_011995	TCTT	2	8	3808	3815	0 %	75 %	0 %	25 %	222142565
17	NC_011995	TCAC	2	8	3832	3839	25 %	25 %	0 %	50 %	222142565
18	NC_011995	GTAT	2	8	4533	4540	25 %	50 %	25 %	0 %	222142566
19	NC_011995	CATT	2	8	4814	4821	25 %	50 %	0 %	25 %	222142567
20	NC_011995	AATG	2	8	4962	4969	50 %	25 %	25 %	0 %	222142567
21	NC_011995	ATAG	2	8	5140	5147	50 %	25 %	25 %	0 %	222142567
22	NC_011995	ATAG	2	8	5263	5270	50 %	25 %	25 %	0 %	222142567
23	NC_011995	AGTA	2	8	5340	5347	50 %	25 %	25 %	0 %	222142567
24	NC_011995	TATT	2	8	5876	5883	25 %	75 %	0 %	0 %	222142567
25	NC_011995	TTTA	2	8	7558	7565	25 %	75 %	0 %	0 %	222142569
26	NC_011995	ATTT	2	8	7663	7670	25 %	75 %	0 %	0 %	222142569
27	NC_011995	TAAA	2	8	7675	7682	75 %	25 %	0 %	0 %	222142569
28	NC_011995	ATTT	2	8	7863	7870	25 %	75 %	0 %	0 %	222142569
29	NC_011995	AGAA	2	8	7890	7897	75 %	0 %	25 %	0 %	222142569
30	NC_011995	AAAT	2	8	7966	7973	75 %	25 %	0 %	0 %	222142569
31	NC_011995	AAAT	2	8	8182	8189	75 %	25 %	0 %	0 %	222142569
32	NC_011995	ATTT	2	8	8220	8227	25 %	75 %	0 %	0 %	222142569
33	NC_011995	ATTA	2	8	8441	8448	50 %	50 %	0 %	0 %	222142570
34	NC_011995	TAAA	2	8	8497	8504	75 %	25 %	0 %	0 %	222142570
35	NC_011995	TTCA	2	8	8519	8526	25 %	50 %	0 %	25 %	222142570
36	NC_011995	TTTG	2	8	8607	8614	0 %	75 %	25 %	0 %	222142570
37	NC_011995	GCAG	2	8	8645	8652	25 %	0 %	50 %	25 %	222142570
38	NC_011995	ATTA	2	8	9636	9643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011995	AATT	2	8	9727	9734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011995	TTAT	2	8	9903	9910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011995	TTTC	2	8	9967	9974	0 %	75 %	0 %	25 %	222142571
42	NC_011995	TTTG	2	8	10297	10304	0 %	75 %	25 %	0 %	222142571
43	NC_011995	TTAA	2	8	10527	10534	50 %	50 %	0 %	0 %	222142571
44	NC_011995	TAAA	2	8	10594	10601	75 %	25 %	0 %	0 %	222142571
45	NC_011995	CTTA	2	8	10679	10686	25 %	50 %	0 %	25 %	222142571
46	NC_011995	ATCA	2	8	10848	10855	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011995	ATCA	2	8	11002	11009	50 %	25 %	0 %	25 %	222142572
48	NC_011995	TAAA	2	8	11049	11056	75 %	25 %	0 %	0 %	222142572
49	NC_011995	TTCT	2	8	11132	11139	0 %	75 %	0 %	25 %	222142572
50	NC_011995	ATCA	2	8	12054	12061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011995	TCAT	2	8	12127	12134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011995	AGAA	2	8	12574	12581	75 %	0 %	25 %	0 %	222142573
53	NC_011995	ATGA	2	8	12977	12984	50 %	25 %	25 %	0 %	222142573
54	NC_011995	ATTT	2	8	13808	13815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011995	TATC	2	8	13838	13845	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011995	TATC	2	8	13898	13905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011995	TATC	2	8	13958	13965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011995	TATC	2	8	14018	14025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011995	TATC	2	8	14078	14085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011995	TATC	2	8	14138	14145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011995	TATC	2	8	14198	14205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011995	TATC	2	8	14258	14265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011995	TATC	2	8	14318	14325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011995	CTAT	2	8	14377	14384	25 %	50 %	0 %	25 %	222142574
65	NC_011995	TCTG	2	8	14444	14451	0 %	50 %	25 %	25 %	222142574
66	NC_011995	ACGT	2	8	14482	14489	25 %	25 %	25 %	25 %	222142574
67	NC_011995	GATT	2	8	14649	14656	25 %	50 %	25 %	0 %	222142574
68	NC_011995	ACAG	2	8	14962	14969	50 %	0 %	25 %	25 %	222142574
69	NC_011995	TGTT	2	8	15167	15174	0 %	75 %	25 %	0 %	222142575

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.