MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL1

Total Repeats: 229

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011995	ATC	2	6	56	61	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011995	CAT	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011995	TCT	2	6	193	198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011995	TCT	2	6	228	233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011995	TTG	2	6	270	275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011995	GAC	2	6	293	298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011995	CCA	2	6	309	314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011995	CTT	2	6	430	435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011995	GAC	2	6	461	466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011995	CTT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011995	GTA	2	6	636	641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142562
12	NC_011995	TGT	2	6	704	709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142562
13	NC_011995	CTT	2	6	734	739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142562
14	NC_011995	ATT	2	6	763	768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142562
15	NC_011995	ATG	2	6	885	890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142562
16	NC_011995	CAT	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142562
17	NC_011995	AAT	2	6	961	966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142562
18	NC_011995	TTG	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011995	AAC	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011995	ATC	2	6	1358	1363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011995	TTC	2	6	1370	1375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011995	GAT	2	6	1386	1391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011995	CAT	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011995	CTT	2	6	1669	1674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
25	NC_011995	TTC	2	6	1687	1692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
26	NC_011995	TTC	2	6	1754	1759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
27	NC_011995	CTT	2	6	1821	1826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
28	NC_011995	CTT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
29	NC_011995	GTT	2	6	1875	1880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142563
30	NC_011995	TCT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
31	NC_011995	TCT	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
32	NC_011995	TCC	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_011995	TTA	2	6	1963	1968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011995	CAC	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_011995	AGG	2	6	2056	2061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011995	GTT	2	6	2081	2086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011995	TAT	2	6	2116	2121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011995	ATG	2	6	2209	2214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011995	CAT	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011995	GTA	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011995	TAA	2	6	2356	2361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011995	ATA	3	9	2389	2397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011995	GAT	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011995	TGA	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142564
45	NC_011995	AAT	2	6	2701	2706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142564
46	NC_011995	AAC	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142564
47	NC_011995	GTT	2	6	2821	2826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142564
48	NC_011995	AGA	2	6	2864	2869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142564
49	NC_011995	CTC	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222142564
50	NC_011995	GAT	2	6	2893	2898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142564
51	NC_011995	ATT	2	6	2923	2928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
52	NC_011995	TTA	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
53	NC_011995	TAA	2	6	2949	2954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142564
54	NC_011995	GTT	2	6	2962	2967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142564
55	NC_011995	AGT	2	6	2983	2988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142564
56	NC_011995	GAA	2	6	3007	3012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142564
57	NC_011995	TAT	2	6	3019	3024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
58	NC_011995	TTA	2	6	3136	3141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
59	NC_011995	ATG	2	6	3272	3277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142564
60	NC_011995	TTA	2	6	3317	3322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
61	NC_011995	TAA	2	6	3535	3540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142565
62	NC_011995	GAT	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142565
63	NC_011995	TCT	2	6	3770	3775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142565
64	NC_011995	ATA	2	6	3894	3899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142565
65	NC_011995	TCA	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142565
66	NC_011995	TTA	3	9	3993	4001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011995	CAT	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011995	ATT	2	6	4017	4022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011995	TAT	2	6	4078	4083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011995	CTT	2	6	4114	4119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142566
71	NC_011995	ATA	2	6	4203	4208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142566
72	NC_011995	TAT	2	6	4223	4228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142566
73	NC_011995	TTA	2	6	4276	4281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142566
74	NC_011995	TAA	2	6	4293	4298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142566
75	NC_011995	TCC	2	6	4377	4382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222142566
76	NC_011995	TAT	2	6	4403	4408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142566
77	NC_011995	ATA	2	6	4422	4427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142566
78	NC_011995	TAT	2	6	4451	4456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142566
79	NC_011995	TAA	2	6	4493	4498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142566
80	NC_011995	CAT	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142567
81	NC_011995	CTT	2	6	4856	4861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142567
82	NC_011995	TAA	2	6	4935	4940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142567
83	NC_011995	ATT	2	6	4956	4961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142567
84	NC_011995	TAT	2	6	4980	4985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142567
85	NC_011995	CCA	2	6	5071	5076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222142567
86	NC_011995	TAT	2	6	5088	5093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142567
87	NC_011995	TAT	2	6	5123	5128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142567
88	NC_011995	ATT	2	6	5152	5157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142567
89	NC_011995	GAT	2	6	5284	5289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142567
90	NC_011995	TAA	2	6	5330	5335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142567
91	NC_011995	ATA	2	6	5354	5359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142567
92	NC_011995	AAT	3	9	5364	5372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142567
93	NC_011995	CTA	2	6	5396	5401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142567
94	NC_011995	GAT	2	6	5477	5482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142567
95	NC_011995	TAG	2	6	5492	5497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142567
96	NC_011995	ATT	2	6	5554	5559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142567
97	NC_011995	TAA	3	9	5601	5609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142567
98	NC_011995	TAA	2	6	5648	5653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142567
99	NC_011995	ATT	2	6	5836	5841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142567
100	NC_011995	TCC	2	6	5897	5902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011995	TAA	2	6	5914	5919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011995	TTA	2	6	6037	6042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011995	GAT	2	6	6062	6067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011995	CAA	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011995	ATT	2	6	6187	6192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011995	TCT	2	6	6233	6238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142568
107	NC_011995	ATT	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142568
108	NC_011995	TAT	2	6	6296	6301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142568
109	NC_011995	CAA	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142568
110	NC_011995	ATA	2	6	6412	6417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142568
111	NC_011995	TAT	2	6	6432	6437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142568
112	NC_011995	TTA	2	6	6445	6450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142568
113	NC_011995	GTT	2	6	6691	6696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142568
114	NC_011995	TCT	2	6	6865	6870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142568
115	NC_011995	TAG	2	6	6930	6935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142568
116	NC_011995	TAA	2	6	6948	6953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142568
117	NC_011995	AAT	2	6	7007	7012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142568
118	NC_011995	CAT	2	6	7218	7223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142569
119	NC_011995	TAT	2	6	7224	7229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
120	NC_011995	AAG	2	6	7245	7250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142569
121	NC_011995	TTA	2	6	7349	7354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
122	NC_011995	ACA	2	6	7405	7410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142569
123	NC_011995	AAT	2	6	7416	7421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142569
124	NC_011995	ATT	2	6	7522	7527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
125	NC_011995	ATT	2	6	7552	7557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
126	NC_011995	TTC	2	6	7639	7644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142569
127	NC_011995	TAT	2	6	7650	7655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
128	NC_011995	GTT	2	6	7732	7737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142569
129	NC_011995	TCT	2	6	7752	7757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142569
130	NC_011995	GTT	2	6	7781	7786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142569
131	NC_011995	TCT	2	6	7793	7798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142569
132	NC_011995	TCT	2	6	7850	7855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142569
133	NC_011995	ATT	2	6	8059	8064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
134	NC_011995	ACT	2	6	8065	8070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142569
135	NC_011995	GTT	2	6	8108	8113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142569
136	NC_011995	ATT	2	6	8128	8133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142569
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229	NC_011995	TTG	2	6	15594	15599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.