MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL1

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011995	ATC	2	6	56	61	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011995	CAT	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011995	TCT	2	6	193	198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011995	TCT	2	6	228	233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011995	TTG	2	6	270	275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011995	GAC	2	6	293	298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011995	CCA	2	6	309	314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011995	CTT	2	6	430	435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011995	GAC	2	6	461	466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011995	CTT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011995	TTG	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011995	AAC	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011995	ATC	2	6	1358	1363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011995	TTC	2	6	1370	1375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011995	GAT	2	6	1386	1391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011995	CAT	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011995	TCC	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011995	TTA	2	6	1963	1968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011995	CAC	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_011995	AGG	2	6	2056	2061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011995	GTT	2	6	2081	2086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011995	TAT	2	6	2116	2121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011995	ATG	2	6	2209	2214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011995	CAT	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011995	GTA	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011995	TAA	2	6	2356	2361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011995	ATA	3	9	2389	2397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011995	GAT	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011995	TTA	3	9	3993	4001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011995	CAT	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011995	ATT	2	6	4017	4022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011995	TAT	2	6	4078	4083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011995	TCC	2	6	5897	5902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_011995	TAA	2	6	5914	5919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011995	TTA	2	6	6037	6042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011995	GAT	2	6	6062	6067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011995	CAA	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011995	ATT	2	6	6187	6192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011995	TTC	2	6	9508	9513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011995	CTT	2	6	9571	9576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011995	TAT	2	6	9708	9713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011995	ATA	3	9	9718	9726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011995	GAT	2	6	9739	9744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011995	ATT	2	6	9771	9776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011995	ATT	2	6	9854	9859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011995	TCC	2	6	10786	10791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011995	TAA	2	6	10801	10806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011995	TAT	2	6	10979	10984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011995	ATA	2	6	11853	11858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011995	ATT	2	6	12115	12120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011995	ATT	2	6	12252	12257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011995	TAA	2	6	13787	13792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011995	TAA	2	6	14367	14372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011995	TTG	2	6	15594	15599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.