MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL1

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011995	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011995	T	6	6	682	687	0 %	100 %	0 %	0 %	222142562
3	NC_011995	T	6	6	973	978	0 %	100 %	0 %	0 %	222142562
4	NC_011995	A	6	6	1015	1020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011995	T	6	6	1041	1046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011995	A	6	6	1194	1199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011995	T	6	6	1260	1265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011995	T	6	6	2197	2202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011995	A	7	7	2257	2263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011995	A	6	6	2294	2299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011995	T	6	6	2635	2640	0 %	100 %	0 %	0 %	222142564
12	NC_011995	A	7	7	2683	2689	100 %	0 %	0 %	0 %	222142564
13	NC_011995	T	7	7	2715	2721	0 %	100 %	0 %	0 %	222142564
14	NC_011995	T	6	6	3065	3070	0 %	100 %	0 %	0 %	222142564
15	NC_011995	A	8	8	3074	3081	100 %	0 %	0 %	0 %	222142564
16	NC_011995	A	6	6	3183	3188	100 %	0 %	0 %	0 %	222142564
17	NC_011995	A	7	7	3210	3216	100 %	0 %	0 %	0 %	222142564
18	NC_011995	T	7	7	3391	3397	0 %	100 %	0 %	0 %	222142565
19	NC_011995	T	7	7	3527	3533	0 %	100 %	0 %	0 %	222142565
20	NC_011995	A	7	7	3871	3877	100 %	0 %	0 %	0 %	222142565
21	NC_011995	T	6	6	3928	3933	0 %	100 %	0 %	0 %	222142565
22	NC_011995	T	7	7	4181	4187	0 %	100 %	0 %	0 %	222142566
23	NC_011995	T	6	6	4191	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	222142566
24	NC_011995	T	6	6	4499	4504	0 %	100 %	0 %	0 %	222142566
25	NC_011995	A	6	6	4631	4636	100 %	0 %	0 %	0 %	222142567
26	NC_011995	T	8	8	5044	5051	0 %	100 %	0 %	0 %	222142567
27	NC_011995	T	6	6	5295	5300	0 %	100 %	0 %	0 %	222142567
28	NC_011995	A	6	6	5611	5616	100 %	0 %	0 %	0 %	222142567
29	NC_011995	T	7	7	5865	5871	0 %	100 %	0 %	0 %	222142567
30	NC_011995	T	6	6	5925	5930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011995	T	7	7	6167	6173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011995	T	7	7	6720	6726	0 %	100 %	0 %	0 %	222142568
33	NC_011995	A	6	6	6874	6879	100 %	0 %	0 %	0 %	222142568
34	NC_011995	T	6	6	6919	6924	0 %	100 %	0 %	0 %	222142568
35	NC_011995	A	7	7	7026	7032	100 %	0 %	0 %	0 %	222142568
36	NC_011995	T	7	7	7198	7204	0 %	100 %	0 %	0 %	222142569
37	NC_011995	T	8	8	7280	7287	0 %	100 %	0 %	0 %	222142569
38	NC_011995	A	7	7	7301	7307	100 %	0 %	0 %	0 %	222142569
39	NC_011995	A	6	6	7343	7348	100 %	0 %	0 %	0 %	222142569
40	NC_011995	T	7	7	7447	7453	0 %	100 %	0 %	0 %	222142569
41	NC_011995	T	7	7	7482	7488	0 %	100 %	0 %	0 %	222142569
42	NC_011995	T	6	6	7582	7587	0 %	100 %	0 %	0 %	222142569
43	NC_011995	T	7	7	7840	7846	0 %	100 %	0 %	0 %	222142569
44	NC_011995	T	7	7	7929	7935	0 %	100 %	0 %	0 %	222142569
45	NC_011995	T	6	6	7994	7999	0 %	100 %	0 %	0 %	222142569
46	NC_011995	T	7	7	8132	8138	0 %	100 %	0 %	0 %	222142569
47	NC_011995	T	6	6	8327	8332	0 %	100 %	0 %	0 %	222142569
48	NC_011995	A	6	6	8351	8356	100 %	0 %	0 %	0 %	222142569
49	NC_011995	T	7	7	8477	8483	0 %	100 %	0 %	0 %	222142570
50	NC_011995	A	6	6	8486	8491	100 %	0 %	0 %	0 %	222142570
51	NC_011995	T	7	7	8553	8559	0 %	100 %	0 %	0 %	222142570
52	NC_011995	T	6	6	8571	8576	0 %	100 %	0 %	0 %	222142570
53	NC_011995	T	6	6	8591	8596	0 %	100 %	0 %	0 %	222142570
54	NC_011995	T	6	6	8715	8720	0 %	100 %	0 %	0 %	222142570
55	NC_011995	T	7	7	8793	8799	0 %	100 %	0 %	0 %	222142570
56	NC_011995	T	6	6	8871	8876	0 %	100 %	0 %	0 %	222142570
57	NC_011995	T	8	8	8881	8888	0 %	100 %	0 %	0 %	222142570
58	NC_011995	T	6	6	8994	8999	0 %	100 %	0 %	0 %	222142570
59	NC_011995	T	6	6	9285	9290	0 %	100 %	0 %	0 %	222142570
60	NC_011995	T	7	7	9298	9304	0 %	100 %	0 %	0 %	222142570
61	NC_011995	A	6	6	9410	9415	100 %	0 %	0 %	0 %	222142570
62	NC_011995	T	8	8	9497	9504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011995	T	6	6	9575	9580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011995	T	6	6	9660	9665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011995	T	7	7	9679	9685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011995	A	6	6	9687	9692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011995	T	6	6	9839	9844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011995	T	6	6	10259	10264	0 %	100 %	0 %	0 %	222142571
69	NC_011995	T	7	7	10378	10384	0 %	100 %	0 %	0 %	222142571
70	NC_011995	T	7	7	10892	10898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011995	A	6	6	10987	10992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011995	T	6	6	11101	11106	0 %	100 %	0 %	0 %	222142572
73	NC_011995	T	6	6	11124	11129	0 %	100 %	0 %	0 %	222142572
74	NC_011995	T	8	8	11180	11187	0 %	100 %	0 %	0 %	222142572
75	NC_011995	T	8	8	11221	11228	0 %	100 %	0 %	0 %	222142572
76	NC_011995	T	7	7	11277	11283	0 %	100 %	0 %	0 %	222142572
77	NC_011995	A	6	6	11293	11298	100 %	0 %	0 %	0 %	222142572
78	NC_011995	T	6	6	11700	11705	0 %	100 %	0 %	0 %	222142572
79	NC_011995	T	7	7	11948	11954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011995	A	7	7	12037	12043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011995	T	6	6	12217	12222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011995	T	7	7	12279	12285	0 %	100 %	0 %	0 %	222142573
83	NC_011995	A	6	6	12359	12364	100 %	0 %	0 %	0 %	222142573
84	NC_011995	A	8	8	12754	12761	100 %	0 %	0 %	0 %	222142573
85	NC_011995	T	6	6	12871	12876	0 %	100 %	0 %	0 %	222142573
86	NC_011995	A	6	6	13326	13331	100 %	0 %	0 %	0 %	222142573
87	NC_011995	A	6	6	13333	13338	100 %	0 %	0 %	0 %	222142573
88	NC_011995	T	6	6	13346	13351	0 %	100 %	0 %	0 %	222142573
89	NC_011995	A	6	6	13523	13528	100 %	0 %	0 %	0 %	222142573
90	NC_011995	A	6	6	13615	13620	100 %	0 %	0 %	0 %	222142573
91	NC_011995	A	6	6	13704	13709	100 %	0 %	0 %	0 %	222142573
92	NC_011995	T	7	7	14695	14701	0 %	100 %	0 %	0 %	222142574
93	NC_011995	T	7	7	15529	15535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.