MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAgK84

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011994	TAATA	2	10	1582	1591	60 %	40 %	0 %	0 %	222112729
2	NC_011994	TTTGG	2	10	2024	2033	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011994	ATATG	2	10	5365	5374	40 %	40 %	20 %	0 %	222112732
4	NC_011994	ACGAG	2	10	6567	6576	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011994	CTCGA	2	10	9585	9594	20 %	20 %	20 %	40 %	222112734
6	NC_011994	CTCTT	2	10	10314	10323	0 %	60 %	0 %	40 %	222112735
7	NC_011994	GAAGG	2	10	11891	11900	40 %	0 %	60 %	0 %	222112736
8	NC_011994	ACCCA	2	10	11952	11961	40 %	0 %	0 %	60 %	222112736
9	NC_011994	TGGGC	2	10	12019	12028	0 %	20 %	60 %	20 %	222112736
10	NC_011994	TCCAA	2	10	12506	12515	40 %	20 %	0 %	40 %	222112737
11	NC_011994	CTGCG	2	10	13403	13412	0 %	20 %	40 %	40 %	222112738
12	NC_011994	AAGAT	2	10	13596	13605	60 %	20 %	20 %	0 %	222112738
13	NC_011994	GTTTG	2	10	13734	13743	0 %	60 %	40 %	0 %	222112738
14	NC_011994	ATAAA	2	10	15828	15837	80 %	20 %	0 %	0 %	222112706
15	NC_011994	TCAGA	2	10	18081	18090	40 %	20 %	20 %	20 %	222112707
16	NC_011994	AGGGC	2	10	19308	19317	20 %	0 %	60 %	20 %	222112708
17	NC_011994	TGGGT	2	10	20304	20313	0 %	40 %	60 %	0 %	222112709
18	NC_011994	CCTCG	2	10	20320	20329	0 %	20 %	20 %	60 %	222112709
19	NC_011994	GCCGA	2	10	22445	22454	20 %	0 %	40 %	40 %	222112711
20	NC_011994	TCCCC	2	10	30758	30767	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
21	NC_011994	GCCCC	2	10	33012	33021	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
22	NC_011994	TGCGC	2	10	37637	37646	0 %	20 %	40 %	40 %	222112724
23	NC_011994	ACCGG	2	10	39038	39047	20 %	0 %	40 %	40 %	222112725
24	NC_011994	AGCGA	2	10	40737	40746	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011994	TTGCC	2	10	41105	41114	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.