MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAgK84

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011994	TGGC	2	8	412	419	0 %	25 %	50 %	25 %	222112729
2	NC_011994	ATCA	2	8	868	875	50 %	25 %	0 %	25 %	222112729
3	NC_011994	GATT	2	8	900	907	25 %	50 %	25 %	0 %	222112729
4	NC_011994	CATC	2	8	909	916	25 %	25 %	0 %	50 %	222112729
5	NC_011994	TTTG	2	8	1366	1373	0 %	75 %	25 %	0 %	222112729
6	NC_011994	TTGT	2	8	1742	1749	0 %	75 %	25 %	0 %	222112729
7	NC_011994	AGCG	2	8	2928	2935	25 %	0 %	50 %	25 %	222112730
8	NC_011994	TCAA	2	8	2936	2943	50 %	25 %	0 %	25 %	222112730
9	NC_011994	TCAT	2	8	3475	3482	25 %	50 %	0 %	25 %	222112730
10	NC_011994	TTTC	2	8	3597	3604	0 %	75 %	0 %	25 %	222112730
11	NC_011994	CCGC	2	8	5304	5311	0 %	0 %	25 %	75 %	222112732
12	NC_011994	ACGT	2	8	6946	6953	25 %	25 %	25 %	25 %	222112733
13	NC_011994	GGAC	2	8	6986	6993	25 %	0 %	50 %	25 %	222112733
14	NC_011994	GGCC	2	8	8557	8564	0 %	0 %	50 %	50 %	222112740
15	NC_011994	AAAC	2	8	9039	9046	75 %	0 %	0 %	25 %	222112740
16	NC_011994	CCGG	2	8	9092	9099	0 %	0 %	50 %	50 %	222112740
17	NC_011994	ATCG	2	8	9389	9396	25 %	25 %	25 %	25 %	222112734
18	NC_011994	AAAC	2	8	9553	9560	75 %	0 %	0 %	25 %	222112734
19	NC_011994	TCGA	2	8	9924	9931	25 %	25 %	25 %	25 %	222112734
20	NC_011994	GGAG	2	8	10020	10027	25 %	0 %	75 %	0 %	222112734
21	NC_011994	CAAT	2	8	10589	10596	50 %	25 %	0 %	25 %	222112735
22	NC_011994	CAGT	2	8	10641	10648	25 %	25 %	25 %	25 %	222112735
23	NC_011994	TCAC	2	8	10712	10719	25 %	25 %	0 %	50 %	222112735
24	NC_011994	TCCG	2	8	11224	11231	0 %	25 %	25 %	50 %	222112735
25	NC_011994	TCGT	2	8	11807	11814	0 %	50 %	25 %	25 %	222112736
26	NC_011994	AAAT	2	8	12260	12267	75 %	25 %	0 %	0 %	222112736
27	NC_011994	TTTC	2	8	12843	12850	0 %	75 %	0 %	25 %	222112737
28	NC_011994	TGAT	2	8	12931	12938	25 %	50 %	25 %	0 %	222112737
29	NC_011994	TTGG	2	8	12987	12994	0 %	50 %	50 %	0 %	222112737
30	NC_011994	CCAT	2	8	13931	13938	25 %	25 %	0 %	50 %	222112738
31	NC_011994	GATA	2	8	15490	15497	50 %	25 %	25 %	0 %	222112706
32	NC_011994	CGTT	2	8	16559	16566	0 %	50 %	25 %	25 %	222112707
33	NC_011994	AATA	2	8	17190	17197	75 %	25 %	0 %	0 %	222112707
34	NC_011994	CTTC	2	8	17426	17433	0 %	50 %	0 %	50 %	222112707
35	NC_011994	AATG	2	8	17505	17512	50 %	25 %	25 %	0 %	222112707
36	NC_011994	GATT	2	8	17941	17948	25 %	50 %	25 %	0 %	222112707
37	NC_011994	GTCC	2	8	18125	18132	0 %	25 %	25 %	50 %	222112707
38	NC_011994	TTTC	2	8	18703	18710	0 %	75 %	0 %	25 %	222112707
39	NC_011994	TGCC	2	8	18801	18808	0 %	25 %	25 %	50 %	222112708
40	NC_011994	GGAT	2	8	19805	19812	25 %	25 %	50 %	0 %	222112709
41	NC_011994	CCCA	2	8	20234	20241	25 %	0 %	0 %	75 %	222112709
42	NC_011994	GAGG	2	8	20640	20647	25 %	0 %	75 %	0 %	222112709
43	NC_011994	CGGG	2	8	22005	22012	0 %	0 %	75 %	25 %	222112711
44	NC_011994	TGCT	2	8	22029	22036	0 %	50 %	25 %	25 %	222112711
45	NC_011994	TCGC	2	8	23693	23700	0 %	25 %	25 %	50 %	222112712
46	NC_011994	CCGA	2	8	24238	24245	25 %	0 %	25 %	50 %	222112713
47	NC_011994	CGAT	2	8	24734	24741	25 %	25 %	25 %	25 %	222112713
48	NC_011994	AACC	2	8	25076	25083	50 %	0 %	0 %	50 %	222112713
49	NC_011994	CATT	2	8	25354	25361	25 %	50 %	0 %	25 %	222112713
50	NC_011994	ACGG	2	8	25580	25587	25 %	0 %	50 %	25 %	222112713
51	NC_011994	CCGC	2	8	27186	27193	0 %	0 %	25 %	75 %	222112716
52	NC_011994	GCAG	2	8	27676	27683	25 %	0 %	50 %	25 %	222112716
53	NC_011994	TGAA	2	8	27770	27777	50 %	25 %	25 %	0 %	222112716
54	NC_011994	CTGA	2	8	28006	28013	25 %	25 %	25 %	25 %	222112716
55	NC_011994	AAGC	2	8	28540	28547	50 %	0 %	25 %	25 %	222112716
56	NC_011994	AGCC	2	8	29186	29193	25 %	0 %	25 %	50 %	222112716
57	NC_011994	GCGA	2	8	29214	29221	25 %	0 %	50 %	25 %	222112716
58	NC_011994	AGGA	2	8	29994	30001	50 %	0 %	50 %	0 %	222112717
59	NC_011994	GGTC	2	8	30463	30470	0 %	25 %	50 %	25 %	222112718
60	NC_011994	TCCG	2	8	30683	30690	0 %	25 %	25 %	50 %	222112718
61	NC_011994	GATC	2	8	31466	31473	25 %	25 %	25 %	25 %	222112719
62	NC_011994	GACC	2	8	31596	31603	25 %	0 %	25 %	50 %	222112719
63	NC_011994	CATC	2	8	31731	31738	25 %	25 %	0 %	50 %	222112719
64	NC_011994	CGCC	2	8	32028	32035	0 %	0 %	25 %	75 %	222112719
65	NC_011994	GCAA	2	8	32055	32062	50 %	0 %	25 %	25 %	222112719
66	NC_011994	CGAC	2	8	32429	32436	25 %	0 %	25 %	50 %	222112719
67	NC_011994	GCTG	2	8	32700	32707	0 %	25 %	50 %	25 %	222112719
68	NC_011994	CGCA	2	8	32781	32788	25 %	0 %	25 %	50 %	222112719
69	NC_011994	ACGC	2	8	33603	33610	25 %	0 %	25 %	50 %	222112720
70	NC_011994	TCGA	2	8	33829	33836	25 %	25 %	25 %	25 %	222112720
71	NC_011994	ATGA	2	8	34123	34130	50 %	25 %	25 %	0 %	222112720
72	NC_011994	ATCA	2	8	34191	34198	50 %	25 %	0 %	25 %	222112720
73	NC_011994	CGCA	2	8	34718	34725	25 %	0 %	25 %	50 %	222112721
74	NC_011994	CGCT	2	8	34906	34913	0 %	25 %	25 %	50 %	222112721
75	NC_011994	TTTG	2	8	35012	35019	0 %	75 %	25 %	0 %	222112721
76	NC_011994	GGAA	2	8	35704	35711	50 %	0 %	50 %	0 %	222112722
77	NC_011994	AGCA	2	8	35931	35938	50 %	0 %	25 %	25 %	222112722
78	NC_011994	CCAG	2	8	36631	36638	25 %	0 %	25 %	50 %	222112723
79	NC_011994	ATCG	2	8	36955	36962	25 %	25 %	25 %	25 %	222112723
80	NC_011994	AAAG	2	8	37073	37080	75 %	0 %	25 %	0 %	222112723
81	NC_011994	CCGG	2	8	37486	37493	0 %	0 %	50 %	50 %	222112724
82	NC_011994	GCCG	2	8	37620	37627	0 %	0 %	50 %	50 %	222112724
83	NC_011994	GCTG	2	8	37909	37916	0 %	25 %	50 %	25 %	222112725
84	NC_011994	CGGC	2	8	38221	38228	0 %	0 %	50 %	50 %	222112725
85	NC_011994	TGAC	2	8	38262	38269	25 %	25 %	25 %	25 %	222112725
86	NC_011994	CAGC	2	8	38279	38286	25 %	0 %	25 %	50 %	222112725
87	NC_011994	GCCG	2	8	38441	38448	0 %	0 %	50 %	50 %	222112725
88	NC_011994	CCGC	2	8	38499	38506	0 %	0 %	25 %	75 %	222112725
89	NC_011994	GGCC	2	8	38743	38750	0 %	0 %	50 %	50 %	222112725
90	NC_011994	CGGC	2	8	38847	38854	0 %	0 %	50 %	50 %	222112725
91	NC_011994	AACG	2	8	39338	39345	50 %	0 %	25 %	25 %	222112725
92	NC_011994	TCGA	2	8	39704	39711	25 %	25 %	25 %	25 %	222112726
93	NC_011994	GATG	2	8	39767	39774	25 %	25 %	50 %	0 %	222112727
94	NC_011994	CGGC	2	8	40007	40014	0 %	0 %	50 %	50 %	222112727
95	NC_011994	GCAG	2	8	40155	40162	25 %	0 %	50 %	25 %	222112727
96	NC_011994	CCGT	2	8	40327	40334	0 %	25 %	25 %	50 %	222112727
97	NC_011994	TGGA	2	8	40375	40382	25 %	25 %	50 %	0 %	222112727
98	NC_011994	GCAA	2	8	40480	40487	50 %	0 %	25 %	25 %	222112727
99	NC_011994	CGAC	2	8	41351	41358	25 %	0 %	25 %	50 %	222112728
100	NC_011994	CCGA	2	8	41479	41486	25 %	0 %	25 %	50 %	222112728
101	NC_011994	CGGC	2	8	42380	42387	0 %	0 %	50 %	50 %	222112728
102	NC_011994	GCCG	2	8	43114	43121	0 %	0 %	50 %	50 %	222112728

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.