MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAgK84

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011994	CAT	2	6	16	21	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011994	CTG	2	6	74	79	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011994	TTG	2	6	80	85	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011994	GTT	2	6	178	183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011994	ACT	2	6	192	197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011994	TTG	2	6	231	236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011994	TCA	2	6	1888	1893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011994	CTC	2	6	1896	1901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011994	ATG	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011994	CCG	2	6	1973	1978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011994	TGC	2	6	2035	2040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011994	ACA	2	6	3763	3768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011994	TTC	2	6	5754	5759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011994	GAA	2	6	5766	5771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011994	CGG	2	6	5952	5957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011994	TGG	2	6	5986	5991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011994	TCA	2	6	6038	6043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011994	ATG	2	6	6070	6075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011994	GTG	2	6	6167	6172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011994	ATT	2	6	6230	6235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011994	GCT	2	6	6309	6314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011994	TGG	2	6	6366	6371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011994	GAT	2	6	6442	6447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011994	TAG	2	6	6500	6505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011994	CAA	2	6	6585	6590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011994	CGG	2	6	7501	7506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011994	ACG	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011994	GAT	2	6	7679	7684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011994	ATC	3	9	7795	7803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011994	GTC	2	6	7898	7903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011994	CGC	2	6	7921	7926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_011994	ATG	2	6	7973	7978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011994	GGT	2	6	8056	8061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011994	ATG	2	6	8093	8098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011994	CGT	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011994	GGT	2	6	8380	8385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011994	CAA	2	6	16170	16175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011994	CCA	2	6	16213	16218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011994	ACT	2	6	16228	16233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011994	GCT	2	6	16330	16335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011994	TAA	3	9	20839	20847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011994	TGG	2	6	20885	20890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011994	GGT	2	6	20915	20920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011994	TAA	2	6	20928	20933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011994	AGT	2	6	20979	20984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011994	TTC	2	6	21715	21720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011994	CCA	2	6	21722	21727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011994	GAA	2	6	21768	21773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011994	GAC	2	6	22727	22732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011994	TGT	2	6	22791	22796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011994	CGA	2	6	22838	22843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011994	AAT	2	6	22946	22951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011994	CAG	2	6	23707	23712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011994	CAC	2	6	23721	23726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_011994	AGC	2	6	26169	26174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011994	ATG	2	6	26684	26689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011994	CAA	2	6	26707	26712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011994	CTC	2	6	29681	29686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011994	CAT	2	6	30795	30800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011994	GCT	2	6	32961	32966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011994	AGG	2	6	33056	33061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011994	GCG	2	6	33202	33207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011994	GTC	2	6	33285	33290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011994	AGA	2	6	33306	33311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011994	CGC	2	6	34272	34277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011994	GAA	2	6	34403	34408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011994	CAC	2	6	34460	34465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_011994	CGG	2	6	35107	35112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011994	TAT	2	6	35267	35272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011994	ATA	2	6	35280	35285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011994	TAT	2	6	35308	35313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011994	GAA	2	6	35344	35349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011994	TTG	2	6	35412	35417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011994	AGG	2	6	36188	36193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011994	CGG	2	6	36281	36286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011994	TGC	2	6	36540	36545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011994	CGC	2	6	40630	40635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_011994	TGC	2	6	40776	40781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011994	AGA	2	6	40807	40812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011994	ACC	2	6	41240	41245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.