MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli LF82

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011993	GAAAAT	2	12	10344	10355	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011993	AAGGGA	2	12	85539	85550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011993	TATGCG	2	12	173627	173638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011993	GCAACC	2	12	174609	174620	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011993	GTAGTG	2	12	204152	204163	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011993	TGTTGA	2	12	262477	262488	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011993	CTTTTC	2	12	283788	283799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011993	TTTTCT	2	12	333881	333892	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011993	CTATTT	2	12	334918	334929	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011993	AATTTC	2	12	341807	341818	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011993	TGTCTG	2	12	351733	351744	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011993	TGAGGT	2	12	351926	351937	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011993	TTTATT	2	12	364084	364095	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011993	AACAAT	2	12	410814	410825	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011993	TATTGA	2	12	413657	413668	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011993	TTTTCA	2	12	475791	475802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011993	CAGGCG	2	12	494634	494645	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011993	TGCAAA	2	12	585481	585492	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011993	CATGAG	2	12	627433	627444	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011993	ATTTTT	2	12	680803	680814	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011993	TTTACC	2	12	691715	691726	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011993	TTTTCT	2	12	747445	747456	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011993	CAGAAA	2	12	786224	786235	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011993	TAACCG	2	12	874455	874466	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011993	AACGCT	2	12	883949	883960	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011993	AAATAA	2	12	913620	913631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011993	CTGGAA	2	12	923184	923195	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011993	AAAGAT	2	12	945977	945988	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011993	TAAGGA	2	12	981847	981858	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011993	ATAATG	2	12	983262	983273	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011993	TGGTAA	2	12	1045724	1045735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011993	TGTTAA	2	12	1054274	1054285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011993	CAAAAA	2	12	1097880	1097891	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011993	GCTATT	2	12	1178236	1178247	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011993	AAAATG	2	12	1221180	1221191	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011993	AGGGGG	2	12	1233100	1233111	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011993	CTTATT	2	12	1308352	1308363	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011993	CAAAAG	2	12	1315403	1315414	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011993	CTGATC	2	12	1325882	1325893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011993	TATAAC	2	12	1379354	1379365	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011993	TAAATT	2	12	1423409	1423420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011993	GTTAAT	2	12	1487595	1487606	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011993	AAAAAC	2	12	1521098	1521109	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011993	CGTTGT	2	12	1522485	1522496	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011993	ACCGTT	2	12	1528669	1528680	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011993	CAAAAA	2	12	1580763	1580774	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011993	TGACAG	2	12	1609063	1609074	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011993	ATACTT	2	12	1714160	1714171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011993	AAAATA	2	12	1727818	1727829	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011993	TGTTTT	2	12	1728452	1728463	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011993	AAGACT	2	12	1728712	1728723	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011993	GAACAG	2	12	1776319	1776330	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011993	TATTAC	2	12	1841438	1841449	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011993	TTTCTT	2	12	1853892	1853903	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_011993	AATTCA	2	12	1948299	1948310	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011993	ATATTT	2	12	1950286	1950297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011993	TCTTAT	2	12	1962117	1962128	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011993	GTGTAT	2	12	1976457	1976468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011993	ATTTTT	2	12	2047512	2047523	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011993	GCCATT	2	12	2052906	2052917	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011993	TGACGC	2	12	2134727	2134738	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011993	TTTTGT	2	12	2139185	2139196	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011993	CCTGTT	2	12	2234787	2234798	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011993	TCTTCC	2	12	2281767	2281778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011993	TAAATG	2	12	2415511	2415522	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011993	TGTCAC	2	12	2429146	2429157	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011993	AGCGGA	2	12	2432282	2432293	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011993	AGAAAA	2	12	2439425	2439436	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011993	CTGATG	2	12	2492291	2492302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011993	GTTATG	2	12	2510136	2510147	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011993	TCGATA	2	12	2520760	2520771	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011993	CAAGTG	2	12	2527102	2527113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011993	TCCTTC	2	12	2622743	2622754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011993	TGAGCG	2	12	2657224	2657235	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_011993	TGGACA	2	12	2667233	2667244	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011993	CAGTTT	2	12	2681838	2681849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011993	TGACGC	2	12	2852369	2852380	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011993	AATGAT	2	12	2880282	2880293	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011993	GGTTTT	2	12	2896237	2896248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011993	ACAAGA	2	12	2900567	2900578	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011993	TTTGTT	2	12	2925388	2925399	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011993	ATCGCG	2	12	3042159	3042170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011993	GTAAGG	2	12	3056833	3056844	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011993	ACTGAG	2	12	3080865	3080876	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011993	CAAAAA	2	12	3122062	3122073	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_011993	TTTTCG	2	12	3154675	3154686	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_011993	ATTTAA	2	12	3167880	3167891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011993	ATAAAA	2	12	3219769	3219780	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011993	ATTTAA	2	12	3230509	3230520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011993	AGTTGT	2	12	3261809	3261820	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011993	CTTTTT	2	12	3266485	3266496	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_011993	AATGAT	2	12	3267320	3267331	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011993	TCTCCC	2	12	3289851	3289862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011993	GTAACC	2	12	3315620	3315631	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011993	TGCATT	2	12	3324439	3324450	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011993	TTTTAT	2	12	3326336	3326347	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011993	AAGCGA	2	12	3331735	3331746	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_011993	CTTTCT	2	12	3354998	3355009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011993	ACAGAA	2	12	3378532	3378543	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_011993	AGCGTT	2	12	3461619	3461630	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011993	TTTATA	2	12	3478298	3478309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011993	AATTTA	2	12	3583048	3583059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011993	TGATAA	2	12	3609891	3609902	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011993	AAGATA	2	12	3675616	3675627	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011993	AGATGC	2	12	3690886	3690897	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_011993	TGAAAA	2	12	3714774	3714785	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011993	TTTGCC	2	12	3751269	3751280	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011993	GCCAGC	2	12	3753347	3753358	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011993	CTTCAA	2	12	3761336	3761347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011993	ATATTT	2	12	3761393	3761404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011993	TTTATA	2	12	3900729	3900740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011993	CTTTTT	2	12	3987367	3987378	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_011993	GGGAGT	2	12	4154280	4154291	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011993	ATAAAA	2	12	4166111	4166122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011993	ATTTTT	2	12	4230246	4230257	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011993	TCATTT	2	12	4297218	4297229	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_011993	TTTTAT	2	12	4316185	4316196	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011993	TAACCA	2	12	4316690	4316701	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011993	ATTTAT	2	12	4357294	4357305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011993	GTCTTT	2	12	4366104	4366115	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_011993	AATATC	2	12	4398868	4398879	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_011993	CTGATA	2	12	4434513	4434524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_011993	TTTTTA	2	12	4532404	4532415	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011993	TTTAAT	2	12	4564258	4564269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011993	CAGCCT	2	12	4605551	4605562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011993	AAAAGA	2	12	4647194	4647205	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011993	AACAGG	2	12	4662439	4662450	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_011993	GTGATT	2	12	4707290	4707301	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011993	TTATCA	2	12	4736816	4736827	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_011993	GTAAAA	2	12	4761795	4761806	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011993	ATCACC	2	12	4772990	4773001	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.