MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli LF82

Total Repeats: 459

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011993	AATGT	2	10	18187	18196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011993	GATGC	2	10	26919	26928	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011993	GATGC	2	10	36300	36309	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011993	TAGTG	2	10	78046	78055	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011993	ATTTT	2	10	79762	79771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011993	GGGAG	2	10	79926	79935	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011993	CGCCA	2	10	79990	79999	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_011993	GTGTT	2	10	122649	122658	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011993	AATTG	2	10	126797	126806	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011993	GTAAG	2	10	147753	147762	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011993	TCCTC	2	10	149473	149482	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_011993	AATTT	2	10	162073	162082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011993	TATAT	2	10	162159	162168	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011993	AAAAC	2	10	173398	173407	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011993	TGGTT	2	10	173655	173664	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011993	TACGT	2	10	187199	187208	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011993	TGGCC	2	10	188888	188897	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011993	ATGGA	2	10	188996	189005	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011993	GTCTG	2	10	196605	196614	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011993	TGCGC	2	10	219788	219797	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_011993	CGGTT	2	10	227248	227257	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011993	GGTGA	2	10	229554	229563	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011993	AAATA	2	10	262128	262137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011993	ACCAA	2	10	306976	306985	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011993	ACATT	2	10	307223	307232	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011993	GCAAT	2	10	308239	308248	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011993	TGTGT	2	10	316081	316090	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011993	TGTTA	2	10	317189	317198	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011993	TTGAT	2	10	318078	318087	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011993	GTTAA	2	10	320490	320499	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011993	AGGGT	2	10	329331	329340	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011993	CAAAA	2	10	333905	333914	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011993	AAAAT	2	10	339149	339158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011993	GGTTT	2	10	343587	343596	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011993	AGCGA	2	10	345080	345089	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011993	TGAAC	2	10	368745	368754	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011993	CTTCT	2	10	402903	402912	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_011993	TGCAG	2	10	410859	410868	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011993	GTTTC	2	10	435553	435562	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011993	CTTTT	2	10	439029	439038	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011993	GAGTA	2	10	441602	441611	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011993	ATAAA	2	10	455139	455148	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011993	GAAGA	2	10	464742	464751	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011993	TGAGT	2	10	478514	478523	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011993	CAGGT	2	10	479801	479810	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011993	TTTTC	2	10	500342	500351	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011993	TCAGG	2	10	508089	508098	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011993	CATCT	2	10	511098	511107	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_011993	TATTT	2	10	536156	536165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011993	GATGC	2	10	549856	549865	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011993	GATGC	2	10	549956	549965	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011993	GATGC	2	10	550056	550065	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011993	GATGC	2	10	550156	550165	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011993	AAAGG	2	10	560762	560771	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011993	GTCAG	2	10	582193	582202	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011993	GTTAA	2	10	602418	602427	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011993	ATAGC	2	10	610332	610341	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011993	ATTTG	2	10	629140	629149	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011993	TCAAT	2	10	631444	631453	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011993	CGTAA	2	10	633444	633453	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011993	GCATA	2	10	645639	645648	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011993	AGCAA	2	10	645746	645755	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011993	GTGTT	2	10	650694	650703	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011993	GTTGC	2	10	650848	650857	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011993	GTGTT	2	10	662931	662940	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011993	CAGGG	2	10	666376	666385	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011993	ATAAA	2	10	680553	680562	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011993	TCGCG	2	10	680740	680749	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_011993	GTCGT	2	10	733461	733470	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011993	GATGC	2	10	758298	758307	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011993	ACATA	2	10	789561	789570	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011993	AGCGC	2	10	792590	792599	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_011993	GATGC	2	10	795001	795010	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011993	AAAAC	2	10	802293	802302	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011993	TATAT	2	10	806334	806343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011993	CAGGG	2	10	829881	829890	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011993	AGTAA	2	10	841743	841752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011993	TGTAA	2	10	886835	886844	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011993	GCAAC	2	10	916638	916647	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_011993	TTCAC	2	10	930607	930616	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011993	TTGTT	2	10	956505	956514	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011993	AGCGA	2	10	957845	957854	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011993	ATGAC	2	10	959585	959594	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011993	TTTTC	2	10	967477	967486	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011993	TTATT	2	10	968287	968296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011993	TTCTT	2	10	970220	970229	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011993	GTACA	2	10	972757	972766	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011993	TTATG	2	10	972914	972923	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011993	CTTAT	2	10	983418	983427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_011993	TAAAA	2	10	994014	994023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011993	CAGTG	2	10	1005863	1005872	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_011993	GTTTT	2	10	1011522	1011531	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011993	TCCTG	2	10	1011971	1011980	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_011993	CGGTG	2	10	1015674	1015683	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_011993	TAACT	2	10	1018522	1018531	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011993	CTATT	2	10	1036709	1036718	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011993	TGTCA	2	10	1036851	1036860	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011993	GGAGG	2	10	1045536	1045545	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011993	AAGGA	2	10	1045622	1045631	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011993	GATCG	2	10	1085929	1085938	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011993	GTCAT	2	10	1097347	1097356	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011993	TAAAA	2	10	1097853	1097862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011993	TGCAG	2	10	1106050	1106059	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011993	GTCGC	2	10	1121112	1121121	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_011993	GGGGA	2	10	1167201	1167210	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011993	ATTTT	2	10	1175256	1175265	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011993	GTTGT	2	10	1178208	1178217	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011993	TGAGT	2	10	1183728	1183737	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011993	AAAGT	2	10	1185935	1185944	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011993	CCACT	2	10	1186137	1186146	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_011993	CGATG	2	10	1194073	1194082	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_011993	GATTC	2	10	1195197	1195206	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011993	ATTAA	2	10	1224941	1224950	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011993	AAGGA	2	10	1229352	1229361	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011993	TTTAG	2	10	1229707	1229716	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011993	AGGTA	2	10	1232176	1232185	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011993	CTGGT	2	10	1232463	1232472	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_011993	TATAA	2	10	1236465	1236474	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011993	CCTTA	2	10	1242983	1242992	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_011993	ATAAA	2	10	1259694	1259703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011993	GAAAA	2	10	1265087	1265096	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011993	CTTCA	2	10	1280310	1280319	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011993	TTATC	2	10	1287628	1287637	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011993	ACCGT	2	10	1304585	1304594	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_011993	CAAAT	2	10	1314433	1314442	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011993	GCCAG	2	10	1341582	1341591	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_011993	TTTGC	2	10	1350561	1350570	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011993	TTTAT	2	10	1383403	1383412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011993	CAGGA	2	10	1386449	1386458	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011993	TGGCC	2	10	1397231	1397240	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_011993	AGTAC	2	10	1404042	1404051	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011993	TTAAT	2	10	1406757	1406766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011993	CGATC	2	10	1418599	1418608	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_011993	AATAA	2	10	1421703	1421712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011993	ATCTA	2	10	1421838	1421847	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011993	GTAAT	2	10	1423083	1423092	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011993	TTATT	2	10	1425223	1425232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011993	ATTTT	2	10	1425457	1425466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011993	CATTG	2	10	1425476	1425485	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011993	CAGGG	2	10	1442679	1442688	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011993	ACGTA	2	10	1456984	1456993	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_011993	TGCAT	2	10	1471972	1471981	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011993	TTTAA	2	10	1473766	1473775	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011993	ACGGC	2	10	1473960	1473969	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_011993	AAACG	2	10	1483843	1483852	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011993	AGTGC	2	10	1487778	1487787	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_011993	TAATT	2	10	1494911	1494920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011993	AAGCG	2	10	1502078	1502087	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_011993	ATTTA	2	10	1521843	1521852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_011993	ATATC	2	10	1571951	1571960	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_011993	CATCC	2	10	1580688	1580697	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
155	NC_011993	TATGA	2	10	1585224	1585233	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011993	AAGAT	2	10	1610446	1610455	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_011993	TGCCA	2	10	1613701	1613710	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
159	NC_011993	ATGCT	2	10	1635053	1635062	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_011993	GAAAA	2	10	1639404	1639413	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011993	TCCCG	2	10	1649376	1649385	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
162	NC_011993	AAAGT	2	10	1651039	1651048	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_011993	TGGTT	2	10	1665881	1665890	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011993	TTAAC	2	10	1727780	1727789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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169	NC_011993	CCCAT	2	10	1771847	1771856	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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171	NC_011993	CATTA	2	10	1776225	1776234	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_011993	TCGAT	2	10	1865938	1865947	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_011993	TTTTG	2	10	1940947	1940956	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
183	NC_011993	TAGCG	2	10	1951169	1951178	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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196	NC_011993	TAACA	2	10	2086434	2086443	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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266	NC_011993	TAAAG	2	10	2721363	2721372	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_011993	AATCA	2	10	2733623	2733632	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
268	NC_011993	CTCAG	2	10	2769568	2769577	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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270	NC_011993	TACCT	2	10	2781074	2781083	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
271	NC_011993	TTTTC	2	10	2797799	2797808	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
272	NC_011993	ATAAG	2	10	2804733	2804742	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
273	NC_011993	CCCGC	2	10	2808263	2808272	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
274	NC_011993	AACTC	2	10	2808313	2808322	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
275	NC_011993	AAAAT	2	10	2808356	2808365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_011993	TGCCT	2	10	2864883	2864892	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
280	NC_011993	AAGGT	2	10	2868518	2868527	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
281	NC_011993	GTGTT	2	10	2869181	2869190	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
282	NC_011993	CCCAG	2	10	2871434	2871443	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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284	NC_011993	GTTTA	2	10	2903522	2903531	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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404	NC_011993	GCATC	2	10	4225301	4225310	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
405	NC_011993	TGCTA	2	10	4233124	4233133	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
406	NC_011993	CTTTG	2	10	4235579	4235588	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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420	NC_011993	TGACG	2	10	4393938	4393947	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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451	NC_011993	TGCGT	2	10	4718652	4718661	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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453	NC_011993	AAAAT	2	10	4723754	4723763	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_011993	ATAAA	2	10	4727003	4727012	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_011993	GATGC	2	10	4759995	4760004	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.