MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidovorax ebreus TPSY chromosome

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011992	CCGGTG	2	12	15625	15636	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011992	GCGACC	2	12	82889	82900	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011992	GACCGC	2	12	96751	96762	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011992	GGGGGA	2	12	123378	123389	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011992	GCCGTC	2	12	129204	129215	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011992	GCAGCG	2	12	138608	138619	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011992	CGGGCG	2	12	143818	143829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011992	CTGGCG	2	12	144000	144011	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011992	GCCGCT	2	12	168001	168012	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011992	GCTGCC	2	12	242606	242617	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011992	ACCGCT	2	12	262163	262174	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011992	GGCGCC	2	12	264434	264445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011992	CGGGTG	2	12	269935	269946	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011992	GCAAGC	2	12	279556	279567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011992	CCTGGC	2	12	366273	366284	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011992	GTGTCC	2	12	383543	383554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011992	CCACCG	2	12	402678	402689	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011992	TTTTTG	2	12	405100	405111	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011992	GCGCTG	2	12	411313	411324	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011992	CCAACA	3	18	477790	477807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011992	CCAGCG	3	18	477808	477825	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011992	CCAACA	6	36	477826	477861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011992	CCAGCG	3	18	477862	477879	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011992	GAACCG	2	12	493404	493415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011992	TGGCGC	2	12	498169	498180	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011992	CCAGTG	2	12	503271	503282	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011992	ACCAGC	2	12	514015	514026	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011992	AGGCAA	2	12	568803	568814	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011992	CAAAAG	2	12	611815	611826	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011992	GTCGCA	2	12	633587	633598	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011992	CGGGGG	2	12	651190	651201	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_011992	GGCGCC	2	12	678036	678047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011992	GGCCAC	2	12	686656	686667	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011992	GTGCGG	2	12	798835	798846	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011992	GAAAAG	2	12	820245	820256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011992	GCGCCG	2	12	844417	844428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011992	CAGGTC	2	12	883750	883761	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011992	GCTCCC	2	12	943718	943729	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011992	CCGGGC	2	12	962112	962123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011992	CTTCTC	2	12	963966	963977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011992	GTGCGT	2	12	978144	978155	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_011992	ACGCTG	2	12	991462	991473	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011992	AAAAAC	2	12	1011240	1011251	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011992	GGCGTC	2	12	1025389	1025400	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011992	CGGGCG	2	12	1031934	1031945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011992	CGGGCG	2	12	1031996	1032007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011992	AGCGCG	2	12	1060378	1060389	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011992	TGGCGG	2	12	1063427	1063438	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011992	CGGCCA	2	12	1069386	1069397	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011992	GAAAAT	2	12	1069837	1069848	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011992	CTATTG	2	12	1145067	1145078	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011992	GTAAAG	2	12	1165472	1165483	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011992	GGCGCT	2	12	1167038	1167049	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011992	AAGGCC	2	12	1222861	1222872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011992	TCTTCG	2	12	1223495	1223506	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011992	ATGGGC	2	12	1226462	1226473	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_011992	GCGCAG	2	12	1248948	1248959	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011992	CACCGG	2	12	1255659	1255670	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011992	GCAAGC	2	12	1257595	1257606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011992	GGCCGT	2	12	1333469	1333480	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011992	GGCAGG	2	12	1336747	1336758	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011992	GTCAAG	2	12	1340219	1340230	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011992	CATGAG	2	12	1340442	1340453	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011992	GATGGC	2	12	1340608	1340619	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011992	TTCGGA	2	12	1395032	1395043	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_011992	GGTGCT	2	12	1398723	1398734	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011992	GCGGCT	2	12	1466067	1466078	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011992	CCAAGC	2	12	1472776	1472787	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011992	CAAGGG	2	12	1496950	1496961	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011992	GCATGC	2	12	1511450	1511461	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011992	AGGGCT	2	12	1518837	1518848	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011992	CAGGCG	2	12	1594105	1594116	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011992	CCGGCC	2	12	1598371	1598382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_011992	GCGTGG	2	12	1610467	1610478	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_011992	CACACG	3	18	1650073	1650090	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011992	GGTGCC	2	12	1650946	1650957	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011992	TCCGAT	2	12	1651032	1651043	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011992	GATTCG	2	12	1651221	1651232	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_011992	TGGCCG	2	12	1651389	1651400	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011992	CCGCGC	2	12	1651419	1651430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_011992	GCAAGC	2	12	1666075	1666086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011992	TCGCCA	2	12	1705995	1706006	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011992	GCGCGG	2	12	1720234	1720245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011992	GCAGGT	2	12	1724238	1724249	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011992	CAGCGC	2	12	1724411	1724422	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011992	GCCATC	2	12	1839781	1839792	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011992	CTGGCG	2	12	1863932	1863943	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011992	TGCCTC	2	12	1866903	1866914	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011992	CGCATG	2	12	1875127	1875138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011992	GCGCAT	2	12	1931912	1931923	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011992	GCGGCT	2	12	1962324	1962335	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011992	AAAAAC	2	12	2087536	2087547	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_011992	CACGGC	2	12	2147170	2147181	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011992	GCGCTG	2	12	2204442	2204453	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011992	ATAAAC	2	12	2218026	2218037	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011992	GCCACC	3	18	2226030	2226047	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011992	CATTGG	2	12	2278293	2278304	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_011992	CCATCG	2	12	2289142	2289153	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011992	CAGGTT	2	12	2292417	2292428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_011992	AACGCG	2	12	2308245	2308256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011992	TCGATA	2	12	2308308	2308319	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_011992	GCCCTC	2	12	2313223	2313234	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011992	GCCTGG	2	12	2319335	2319346	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011992	CCCAGC	2	12	2319652	2319663	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011992	CATTGC	2	12	2346771	2346782	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011992	GCGGCC	2	12	2388249	2388260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011992	CCCCAC	2	12	2468700	2468711	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
108	NC_011992	CTGCGG	2	12	2516197	2516208	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011992	ATTGAC	2	12	2522080	2522091	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_011992	ACGCCG	2	12	2522825	2522836	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011992	GCAAGC	2	12	2535330	2535341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011992	CAGCGC	2	12	2555203	2555214	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011992	CGCCCG	2	12	2680573	2680584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011992	GATGCG	2	12	2680862	2680873	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_011992	GGTGCG	2	12	2681150	2681161	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_011992	GACAGG	2	12	2681508	2681519	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_011992	CGCAGG	2	12	2685138	2685149	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011992	CGGGTG	2	12	2685308	2685319	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_011992	GCCACG	2	12	2711906	2711917	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011992	GCAAGC	2	12	2713931	2713942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011992	GCCTGG	2	12	2736615	2736626	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011992	GCCATT	2	12	2791136	2791147	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011992	GCAAGC	2	12	2795790	2795801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011992	GCGCGG	2	12	2815740	2815751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011992	CGGCCC	2	12	2871399	2871410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_011992	AGCCCA	2	12	2912998	2913009	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011992	GCCGGC	2	12	2961743	2961754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011992	AAAAGT	2	12	3142818	3142829	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011992	CGCGGG	2	12	3148060	3148071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011992	CCTGCG	2	12	3148465	3148476	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011992	TTGGCG	2	12	3398504	3398515	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_011992	GAAAAG	2	12	3405900	3405911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011992	TCGCGC	2	12	3436165	3436176	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011992	GGGCAG	2	12	3586039	3586050	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_011992	GAAGAC	2	12	3597097	3597108	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_011992	GCCCGG	2	12	3619437	3619448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011992	CGGGCA	2	12	3690126	3690137	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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139	NC_011992	CCGGGT	2	12	3735902	3735913	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011992	GTCGCA	2	12	3736765	3736776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011992	AAAGCG	2	12	3747153	3747164	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_011992	CCTGCC	2	12	3785471	3785482	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.