MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acidovorax ebreus TPSY chromosome

Total Repeats: 2699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011992	GCGCCC	2	12	3535755	3535766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222112472
2502	NC_011992	CACCAA	2	12	3538028	3538039	50 %	0 %	0 %	50 %	222112474
2503	NC_011992	CTGGCC	2	12	3538596	3538607	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222112474
2504	NC_011992	TGTTCG	2	12	3539346	3539357	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222112475
2505	NC_011992	CGACGC	2	12	3539839	3539850	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112475
2506	NC_011992	CCTGCG	2	12	3544857	3544868	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222112482
2507	NC_011992	GCCCAG	2	12	3545454	3545465	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112483
2508	NC_011992	CCCACG	2	12	3545890	3545901	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222112483
2509	NC_011992	CGTCGG	2	12	3545966	3545977	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112483
2510	NC_011992	CCAGGG	2	12	3546887	3546898	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112484
2511	NC_011992	GCGGGC	2	12	3547338	3547349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112485
2512	NC_011992	CCGTGC	2	12	3548639	3548650	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222112486
2513	NC_011992	CACCGC	2	12	3550159	3550170	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222112488
2514	NC_011992	CGTGGC	2	12	3553000	3553011	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112490
2515	NC_011992	GCAAGA	2	12	3560991	3561002	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222112501
2516	NC_011992	CGGGGC	2	12	3562775	3562786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112502
2517	NC_011992	CAGGCC	2	12	3574094	3574105	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112511
2518	NC_011992	CGCCAG	2	12	3574499	3574510	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112511
2519	NC_011992	GATGTG	2	12	3576529	3576540	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	222112513
2520	NC_011992	AAGGCC	2	12	3576906	3576917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112514
2521	NC_011992	GGGCGA	2	12	3576977	3576988	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222112514
2522	NC_011992	TGGGCG	2	12	3577045	3577056	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222112514
2523	NC_011992	CACGCT	2	12	3577112	3577123	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222112514
2524	NC_011992	AAGGTG	2	12	3577620	3577631	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	222112514
2525	NC_011992	GCGCCA	2	12	3580546	3580557	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112516
2526	NC_011992	GCCCTT	2	12	3582918	3582929	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222112518
2527	NC_011992	CCTTGG	2	12	3583241	3583252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112518
2528	NC_011992	CCGTCG	2	12	3583432	3583443	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222112518
2529	NC_011992	GCACCT	2	12	3584214	3584225	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222112519
2530	NC_011992	TGGGCG	2	12	3585411	3585422	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222112520
2531	NC_011992	TTTGGC	2	12	3585674	3585685	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222112520
2532	NC_011992	CGCAGG	2	12	3585708	3585719	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112520
2533	NC_011992	CGCCAG	2	12	3586249	3586260	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112521
2534	NC_011992	GTGGAA	2	12	3591828	3591839	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	222112524
2535	NC_011992	CAACGG	2	12	3592679	3592690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112524
2536	NC_011992	AACGGG	2	12	3592902	3592913	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222112524
2537	NC_011992	AACGGG	2	12	3592950	3592961	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222112524
2538	NC_011992	GCAACG	2	12	3592996	3593007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112524
2539	NC_011992	GGCGCT	2	12	3593662	3593673	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112525
2540	NC_011992	GGGCGC	2	12	3594034	3594045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112525
2541	NC_011992	GGCCTG	2	12	3595511	3595522	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112526
2542	NC_011992	CCGGCG	2	12	3596492	3596503	0 %	0 %	50 %	50 %	222112527
2543	NC_011992	GTGACG	2	12	3596665	3596676	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222112527
2544	NC_011992	ATGCCC	2	12	3597980	3597991	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222112529
2545	NC_011992	GCACCA	2	12	3598980	3598991	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222112529
2546	NC_011992	CACGTT	2	12	3601265	3601276	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222112531
2547	NC_011992	TGCGCC	2	12	3601446	3601457	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222112531
2548	NC_011992	CTCGAT	2	12	3601574	3601585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222112531
2549	NC_011992	CCTGTG	5	30	3601975	3602004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112531
2550	NC_011992	TGGGCA	2	12	3605405	3605416	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222112532
2551	NC_011992	TCTACG	2	12	3605462	3605473	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222112532
2552	NC_011992	TCACCG	2	12	3608417	3608428	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222112533
2553	NC_011992	GCCATG	2	12	3608539	3608550	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222112533
2554	NC_011992	GCACCC	2	12	3608766	3608777	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222112534
2555	NC_011992	GCCAGC	2	12	3608988	3608999	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112534
2556	NC_011992	GCGCAG	2	12	3609129	3609140	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112534
2557	NC_011992	TGGTCA	2	12	3611456	3611467	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222112536
2558	NC_011992	CAGGTG	2	12	3611950	3611961	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222112536
2559	NC_011992	GAGGTG	2	12	3612199	3612210	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	222112536
2560	NC_011992	GTGGAG	2	12	3612532	3612543	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	222112536
2561	NC_011992	GGCGCG	2	12	3613123	3613134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112536
2562	NC_011992	CACGCT	2	12	3613152	3613163	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222112536
2563	NC_011992	GTGCTG	2	12	3613903	3613914	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222112536
2564	NC_011992	TGGCCG	2	12	3614252	3614263	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112536
2565	NC_011992	AGGTGG	2	12	3616361	3616372	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	222112539
2566	NC_011992	CTGGGC	2	12	3616963	3616974	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112539
2567	NC_011992	GCGGGC	2	12	3621722	3621733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112546
2568	NC_011992	AAGGAA	2	12	3624839	3624850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222112549
2569	NC_011992	TGGCCA	2	12	3626803	3626814	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222112552
2570	NC_011992	CCAGGT	2	12	3629239	3629250	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222112554
2571	NC_011992	TCCAGC	2	12	3632085	3632096	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222112557
2572	NC_011992	AACGAC	2	12	3635700	3635711	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222112560
2573	NC_011992	TGGCCA	2	12	3636837	3636848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222112562
2574	NC_011992	GCTCAA	2	12	3637357	3637368	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222112562
2575	NC_011992	GCCATC	2	12	3637495	3637506	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222112563
2576	NC_011992	GCGCTC	2	12	3639439	3639450	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222112565
2577	NC_011992	CCCGCG	2	12	3641532	3641543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222112567
2578	NC_011992	AGTACG	2	12	3641706	3641717	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222112567
2579	NC_011992	CTGGTG	2	12	3642423	3642434	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222112568
2580	NC_011992	GCACCG	2	12	3642439	3642450	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112568
2581	NC_011992	CACGCT	2	12	3643222	3643233	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222112569
2582	NC_011992	GGCCGA	2	12	3643393	3643404	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112569
2583	NC_011992	CTGGCC	2	12	3645081	3645092	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222112570
2584	NC_011992	ACGCTG	2	12	3645117	3645128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222112570
2585	NC_011992	CGATGA	2	12	3648229	3648240	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222112572
2586	NC_011992	TCGCCC	2	12	3649758	3649769	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	222112572
2587	NC_011992	CTGCAT	2	12	3650546	3650557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222112572
2588	NC_011992	GCCCGA	2	12	3650948	3650959	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112572
2589	NC_011992	CTGGTG	2	12	3652264	3652275	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222112573
2590	NC_011992	CACCGC	2	12	3652533	3652544	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222112573
2591	NC_011992	GAACAC	2	12	3654110	3654121	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222112575
2592	NC_011992	CTCGAT	2	12	3656210	3656221	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222112576
2593	NC_011992	CACCGT	2	12	3656746	3656757	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222112577
2594	NC_011992	ATCGAG	2	12	3658088	3658099	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222112578
2595	NC_011992	TCACCT	2	12	3658809	3658820	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222112578
2596	NC_011992	GCAGAT	2	12	3659175	3659186	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222112579
2597	NC_011992	TGCTGG	2	12	3659951	3659962	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222112579
2598	NC_011992	CCGCGC	2	12	3660113	3660124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222112579
2599	NC_011992	CCCGGC	2	12	3662875	3662886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222112581
2600	NC_011992	CGCTGG	2	12	3663691	3663702	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112582
2601	NC_011992	TCAGCA	2	12	3666748	3666759	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222112584
2602	NC_011992	GGCCGC	2	12	3668347	3668358	0 %	0 %	50 %	50 %	222112585
2603	NC_011992	CGGCAT	2	12	3668404	3668415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222112585
2604	NC_011992	CGAGGC	2	12	3669396	3669407	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112586
2605	NC_011992	GCCACG	2	12	3669771	3669782	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112587
2606	NC_011992	CGCAAA	2	12	3670155	3670166	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222112588
2607	NC_011992	CGTGCG	2	12	3670191	3670202	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112588
2608	NC_011992	GCGGCC	2	12	3671157	3671168	0 %	0 %	50 %	50 %	222112590
2609	NC_011992	CAGGCC	2	12	3672222	3672233	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112590
2610	NC_011992	GCCTGG	2	12	3672796	3672807	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112590
2611	NC_011992	CTCGAT	2	12	3673881	3673892	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222112592
2612	NC_011992	TGCAGC	2	12	3675498	3675509	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222112593
2613	NC_011992	GCGCAG	2	12	3675854	3675865	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112593
2614	NC_011992	GTGAGC	2	12	3676100	3676111	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222112594
2615	NC_011992	CACTGC	2	12	3676166	3676177	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222112594
2616	NC_011992	GGCGCC	2	12	3676815	3676826	0 %	0 %	50 %	50 %	222112595
2617	NC_011992	CCTGGC	2	12	3678452	3678463	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222112597
2618	NC_011992	GAGCGC	2	12	3678705	3678716	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112597
2619	NC_011992	CCAGGC	2	12	3679617	3679628	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112599
2620	NC_011992	CAGGGC	2	12	3680128	3680139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112599
2621	NC_011992	GCTGGC	2	12	3682399	3682410	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112600
2622	NC_011992	GCTGGG	2	12	3682468	3682479	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222112600
2623	NC_011992	CTTCGT	2	12	3686394	3686405	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222112607
2624	NC_011992	GGGCTG	2	12	3686916	3686927	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222112607
2625	NC_011992	TGGCCG	2	12	3687149	3687160	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112607
2626	NC_011992	CCACGC	2	12	3687167	3687178	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222112607
2627	NC_011992	CGACTT	2	12	3687621	3687632	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222112607
2628	NC_011992	CGCTGG	2	12	3688166	3688177	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112607
2629	NC_011992	CACGGC	2	12	3691585	3691596	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112608
2630	NC_011992	GATCAC	2	12	3692694	3692705	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222112610
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2632	NC_011992	CCATGC	2	12	3694506	3694517	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222112611
2633	NC_011992	CGCATC	2	12	3695380	3695391	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222112612
2634	NC_011992	GCGCAG	2	12	3695580	3695591	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112612
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2636	NC_011992	CGTGGA	2	12	3697461	3697472	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222112614
2637	NC_011992	ATCGAG	2	12	3697606	3697617	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222112614
2638	NC_011992	CGGCCT	2	12	3697930	3697941	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222112615
2639	NC_011992	TGCAGC	2	12	3698725	3698736	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222112616
2640	NC_011992	CAGCTC	2	12	3699033	3699044	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222112616
2641	NC_011992	CCGGCT	2	12	3699609	3699620	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222112617
2642	NC_011992	ACGGCA	2	12	3701917	3701928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112618
2643	NC_011992	CAAGGC	2	12	3704517	3704528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112620
2644	NC_011992	ACGTGG	2	12	3704552	3704563	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222112620
2645	NC_011992	ATCGGC	2	12	3704736	3704747	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222112621
2646	NC_011992	TCGTGG	2	12	3705385	3705396	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222112621
2647	NC_011992	TGGCCG	2	12	3705990	3706001	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112622
2648	NC_011992	GGGCAT	2	12	3707115	3707126	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222112623
2649	NC_011992	CGGCGA	2	12	3707426	3707437	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112624
2650	NC_011992	CTGGGC	2	12	3711281	3711292	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112627
2651	NC_011992	CCAACC	2	12	3711909	3711920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222112627
2652	NC_011992	TCGCGC	2	12	3716365	3716376	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222112631
2653	NC_011992	GCGGTC	2	12	3718440	3718451	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112632
2654	NC_011992	CGGTCG	2	12	3718873	3718884	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112632
2655	NC_011992	GTGCAG	2	12	3719813	3719824	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222112633
2656	NC_011992	AGCGGC	2	12	3720404	3720415	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112633
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2658	NC_011992	TGCAGG	2	12	3720913	3720924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222112634
2659	NC_011992	ATGCCG	2	12	3722604	3722615	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222112635
2660	NC_011992	CGAGCG	2	12	3724342	3724353	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112637
2661	NC_011992	GCGAGC	2	12	3724392	3724403	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112637
2662	NC_011992	GCGAGC	2	12	3724989	3725000	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112637
2663	NC_011992	CTGGAC	2	12	3727719	3727730	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222112638
2664	NC_011992	CACCAG	2	12	3733812	3733823	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222112642
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2666	NC_011992	TGCCCA	2	12	3741041	3741052	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222112651
2667	NC_011992	GGCCTG	2	12	3741531	3741542	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112652
2668	NC_011992	CCGAGC	2	12	3741805	3741816	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112652
2669	NC_011992	CTGGAC	2	12	3742599	3742610	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222112652
2670	NC_011992	TCCCTG	2	12	3743046	3743057	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222112652
2671	NC_011992	ACGCGG	2	12	3743669	3743680	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112653
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2674	NC_011992	TGGCAA	2	12	3746839	3746850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222112656
2675	NC_011992	CAGGCG	2	12	3749573	3749584	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112659
2676	NC_011992	GGAATC	2	12	3750449	3750460	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222112661
2677	NC_011992	AGCACC	2	12	3751158	3751169	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222112661
2678	NC_011992	CTGCAT	2	12	3752409	3752420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222112663
2679	NC_011992	CGCCGA	2	12	3752774	3752785	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112663
2680	NC_011992	AGGTCG	2	12	3753093	3753104	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222112664
2681	NC_011992	TGACGG	2	12	3754324	3754335	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222112664
2682	NC_011992	TCGGCG	2	12	3754392	3754403	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222112664
2683	NC_011992	CAGGCC	2	12	3755485	3755496	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112665
2684	NC_011992	CGCGAG	2	12	3755745	3755756	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112666
2685	NC_011992	GGCGCA	2	12	3756379	3756390	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222112667
2686	NC_011992	ACTTCG	2	12	3760519	3760530	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222112671
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2689	NC_011992	CCAGCA	2	12	3768650	3768661	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222112678
2690	NC_011992	CACGAA	2	12	3771246	3771257	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222112678
2691	NC_011992	CCAGGC	2	12	3774451	3774462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112681
2692	NC_011992	AGCGCA	2	12	3779988	3779999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112688
2693	NC_011992	CTTGAC	2	12	3781891	3781902	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222112691
2694	NC_011992	CTTCGC	2	12	3784128	3784139	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222112693
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2699	NC_011992	CAGCGC	2	12	3795177	3795188	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222112701

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